讀文獻(xiàn)學(xué)方法,如何平衡類器官的增殖與分化-商家動(dòng)態(tài)-資訊-生物在線

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讀文獻(xiàn)學(xué)方法,如何平衡類器官的增殖與分化

作者:上海魔兜兒生物科技有限公司 2025-03-03T00:00 (訪問量:26546)

在類器官培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)中,很多研究者可能會(huì)遇到這樣的情況:干細(xì)胞過度自我更新,導(dǎo)致細(xì)胞類型單一而分化受限;又或者干細(xì)胞過度分化,增殖能力不足,難以維持類器官的長期培養(yǎng)。更為重要的是,器官在生物體內(nèi)也需要保持增殖與分化的平衡,如果不能很好的控制類器官的增殖與分化,也不能很好的模擬真正的器官。

 

那么,如何較好的平衡類器官的增殖與分化呢?

 

近期,一項(xiàng)發(fā)表在Nature Communications上的研究成果,為我們解決這個(gè)問題帶來了思路。該研究團(tuán)隊(duì)開發(fā)出一種新型的腸類器官培養(yǎng)系統(tǒng),該系統(tǒng)能夠在單一培養(yǎng)條件下實(shí)現(xiàn)干細(xì)胞快速生長和細(xì)胞多樣性的增加,盡可能地達(dá)到干細(xì)胞自我更新與分化之間的平衡。

該研究團(tuán)隊(duì)的研究思路如下:

 

假設(shè)增強(qiáng)類器官的分化潛能就是增強(qiáng)類器官干細(xì)胞的的分化潛能,為了建立兼具細(xì)胞多樣性和高增殖能力的類器官培養(yǎng)系統(tǒng),首先,利用CRISPR-Cas9技術(shù)構(gòu)建LGR5-mNeonGreen報(bào)告系統(tǒng),篩選出能顯著提高LGR5+干細(xì)胞比例的小分子組合,并驗(yàn)證相應(yīng)培養(yǎng)條件下的細(xì)胞多樣性、和體內(nèi)器官的相似性,然后,在篩選出的最佳小分子組合培養(yǎng)條件下,通過施加抑制劑和其他小分子調(diào)節(jié)干細(xì)胞分化和增殖之間的平衡,最終,得到能夠兼顧高增殖能力和細(xì)胞多樣性的人類小腸類器官(hSIO)系統(tǒng)。

 

基于這樣的研究思路,科研人員通過建立“干性”增強(qiáng)的類器官系統(tǒng)、小分子功能分析確認(rèn)以及信號(hào)通路分子調(diào)節(jié)等方法(可見附1),精確分析出調(diào)控哪些小分子和細(xì)胞因子的特定組合,可增強(qiáng)細(xì)胞多樣性分化,以及哪些信號(hào)分子組合,可增強(qiáng)細(xì)胞的特定分化,并對(duì)關(guān)鍵小分子的作用機(jī)制進(jìn)行了初步探究。

 

可見平衡類器官的增殖與分化,并非一個(gè)簡單的實(shí)驗(yàn),需要從類器官培養(yǎng)系統(tǒng)的分子層面去進(jìn)行分析,才能最大程度地讓體外類器官模型向體內(nèi)器官靠近,得到理想的結(jié)果。

團(tuán)隊(duì)研究方法概述

 

建立“干性”增強(qiáng)的類器官系統(tǒng):利用CRISPR-Cas9技術(shù)構(gòu)建LGR5- mneongreen報(bào)告系統(tǒng)來標(biāo)記LGR5+干細(xì)胞,優(yōu)化小分子和生長因子的組合來模擬干細(xì)胞的體內(nèi)生態(tài)環(huán)境,發(fā)現(xiàn)曲古霉素A(TSA或T,HDAC抑制劑)、2-磷酸- l -抗壞血酸(pVc或p,維生素C)和CP673451 (CP或C,PDGFR抑制劑)這3個(gè)小分子(TpC)的組合可以顯著增加LGR5陽性細(xì)胞(腸道內(nèi)干細(xì)胞)的比例。

 

在TpC條件下產(chǎn)生多樣化和可塑性的細(xì)胞類型單細(xì)胞RNA測序(scRNA-seq)分析揭示了TpC系統(tǒng)生成的類器官在組成和結(jié)構(gòu)方面與體內(nèi)器官具有高度的相似性,TpC系統(tǒng)支持在類器官中產(chǎn)生動(dòng)態(tài)和可塑性的腸道細(xì)胞群,具有產(chǎn)生多譜系和經(jīng)歷細(xì)胞可塑性的潛力。

 

小分子在系統(tǒng)建立中發(fā)揮重要作用:通過流式細(xì)胞術(shù)、免疫熒光染色、RT-qPCR、scRNA-seq等分析細(xì)胞標(biāo)記物的表達(dá)變化,確認(rèn)各小分子的作用機(jī)制。TSA通過靶向HDACMBD-NuRD復(fù)合物增強(qiáng)LGR5干細(xì)胞維持;iBET-151能夠可逆地促進(jìn)細(xì)胞增殖,抑制向分泌細(xì)胞分化。

 

施加特定的信號(hào)調(diào)節(jié)分子實(shí)現(xiàn)類器官譜系轉(zhuǎn)變:通過調(diào)節(jié)Wnt、Notch和BMP等信號(hào)通路,可逆地從分泌細(xì)胞分化轉(zhuǎn)變?yōu)樵鰪?qiáng)增殖的腸上皮細(xì)胞系,或單向分化為特定的腸道細(xì)胞類型。

Arcegen提供全套類器官培養(yǎng)試劑

基質(zhì)膠

應(yīng)用類型

產(chǎn)品貨號(hào)

產(chǎn)品名稱

標(biāo)準(zhǔn)型

蛋白濃度:8-12mg/mL

C231001

Arcegel Matrix LDEV-Free

C231002

Arcegel Matrix Phenol Red-Free, LDEV-Free

低生長因子

蛋白濃度:8-12mg/mL

C231003

Arcegel Matrix  GFR, LDEV-Free Matrigel

C231004

Arcegel Matrix  GFR, Phenol Red-Free, LDEV-Free

高濃度

蛋白濃度:≥18mg/mL

C231005

Arcegel Matrix High Concentration, LDEV-Free

C231006

Arcegel Matrix High Concentration, Phenol Red-Free, LDEV-Free

C231007

Arcegel Matrix High Concentration, GFR, LDEV-Free
干細(xì)胞專用

C231008

Arcegel Matrix hESC-Qualified, LDEV-Free

類器官專用

C231009

Arcegel Matrix for Organoid culture, Phenol Red-Free, LDEV-Free

類器官培養(yǎng)基

貨號(hào)

產(chǎn)品貨號(hào)

產(chǎn)品名稱

3DCultr 小鼠腸類器官培養(yǎng)基

C231105

3DCultr Intestinal Organoid Growth Medium (Mouse)

3DCultr 人腸癌類器官培養(yǎng)基

C231106

3DCultr Intestinal Cancer Organoid Growth Medium (Human)

3DCultr 人胃癌類器官培養(yǎng)基

C231107

3DCultr Gastric Cancer Organoid Growth Medium (Human)

3DCultr 人肺癌類器官培養(yǎng)基

C231110

3DCultr Lung Cancer Organoid Growth Medium (Human)

3DCultr 人肝癌類器官培養(yǎng)基

C231108

3DCultr Liver Cancer Organoid Growth Medium (Human)

3DCultr 人乳腺癌類器官培養(yǎng)基

C231109

3DCultr Breast Cancer Organoid Growth Medium (Human)

3DCultr 人食管癌類器官培養(yǎng)基

C231111

3DCultr Esophageal Cancer Organoid Growth Medium (Human)

3DCultr 人卵巢癌類器官培養(yǎng)基

C231112

3DCultr Ovarian Cancer Organoid Growth Medium (Human)

3DCultr 人胰腺癌類器官培養(yǎng)基

C231113

3DCultr Pancreatic Cancer Organoid Growth Medium (Human)

 

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