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2講師介紹
張旭敏
復(fù)旦大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 研究員、博士生導(dǎo)師
較低的分析通量是蛋白質(zhì)組學(xué)實(shí)際應(yīng)用的一個(gè)難點(diǎn)，提升分析通量對(duì)蛋白質(zhì)組分析在大隊(duì)列樣品中的應(yīng)用至關(guān)重要。等質(zhì)異位標(biāo)簽是目前蛋白質(zhì)組學(xué)研究中使用最廣泛的多重定量方法，目前分析通量最大TMTpro標(biāo)簽?zāi)芡瑫r(shí)定量18個(gè)樣品。我們建立了的TAG-TMTpro方法，使得定量通量增加三倍，可以同時(shí)定量54個(gè)樣品。方法也可以應(yīng)用在其它等質(zhì)異位標(biāo)簽的定量蛋白質(zhì)組研究中。
課程主題：TAG-TMTpro，一種新型的超高通量的定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法
- 定量蛋白質(zhì)組學(xué)簡介
- 等質(zhì)異位標(biāo)簽簡介
- TAG-TMTpro方法的開發(fā)
唐思偉
應(yīng)脈醫(yī)療 博士/高級(jí)應(yīng)用科學(xué)家
深耕蛋白質(zhì)組學(xué)近20年，有豐富的研究和技術(shù)開發(fā)經(jīng)驗(yàn)，先后就職于復(fù)旦大學(xué)，同濟(jì)大學(xué)附屬楊浦醫(yī)院，應(yīng)脈醫(yī)療等單位。
以血漿為代表的體液蛋白質(zhì)組的典型特征是蛋白質(zhì)分子的高動(dòng)態(tài)分布范圍（跨越10-12個(gè)數(shù)量級(jí)）。現(xiàn)有技術(shù)很難實(shí)現(xiàn)對(duì)血漿蛋白質(zhì)組高深度和高寬度的覆蓋，導(dǎo)致血漿蛋白質(zhì)組的研究進(jìn)展緩慢。
2020年，美國Seer公司創(chuàng)新型地推出了基于納米磁珠(NPs)富集結(jié)合質(zhì)譜的高深度體液蛋白質(zhì)系統(tǒng)——Proteograph?。借助該系統(tǒng)的自動(dòng)化流程，能在幾個(gè)小時(shí)內(nèi)完成對(duì)血漿中3500至5000種蛋白質(zhì)的鑒定，同時(shí)實(shí)現(xiàn)對(duì)血漿蛋白質(zhì)組寬度和深度的雙重高覆蓋，強(qiáng)力推進(jìn)血漿蛋白質(zhì)分子標(biāo)志物的篩選、發(fā)現(xiàn)、轉(zhuǎn)化和應(yīng)用。
本課程將通過對(duì)大量Proteograph?系統(tǒng)產(chǎn)出的本土數(shù)據(jù)的分析，詳細(xì)介紹Proteograph?系統(tǒng)在體液蛋白質(zhì)組等諸多領(lǐng)域的強(qiáng)大應(yīng)用。
課程主題：Proteograph?(Seer)——體液蛋白質(zhì)組高深度探索系統(tǒng)
- 血漿蛋白質(zhì)組特征及研究現(xiàn)狀
- Proteograph?系統(tǒng)及組件
- Proteograph?系統(tǒng)穩(wěn)定性和重復(fù)性分析
- Proteograph?系統(tǒng)對(duì)血漿蛋白質(zhì)組高深度解析力分析
- Proteograph?系統(tǒng)——大隊(duì)列樣本分析
6. Proteograph?系統(tǒng)——代表性研究案例分析
康林
Biotree蛋白質(zhì)組學(xué)總監(jiān)
專攻蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域，擁有近10年項(xiàng)目工作經(jīng)驗(yàn)，服務(wù)過近百家醫(yī)院，高校、研究所等科研單位，在蛋白質(zhì)組學(xué)方案設(shè)計(jì)、實(shí)驗(yàn)流程、數(shù)據(jù)分析及蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)庫應(yīng)用等方向有豐富的項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)。
隨著技術(shù)的進(jìn)步，蛋白質(zhì)組學(xué)研究的方法多樣， UniProt數(shù)據(jù)庫中經(jīng)人工注釋的蛋白質(zhì)有2萬多種，在蛋白質(zhì)組學(xué)研究中有組織，細(xì)胞，血清血漿等不同樣本類型的樣本，它們能夠被檢測(cè)到的蛋白種類數(shù)也不盡相同，目前為止還沒有哪種技術(shù)可以一次性陽性檢出所有的蛋白質(zhì)，質(zhì)譜檢測(cè)法是一種高通量檢測(cè)蛋白的常用手段，通常來說組織，細(xì)胞能夠檢測(cè)到的蛋白種類數(shù)可達(dá)到成千上萬，而血清血漿樣本由于高豐度蛋白的影響，通常只有成百上千的蛋白，因此對(duì)于血清血漿樣本來說，為了更深入的研究科學(xué)問題，高深度覆蓋檢測(cè)蛋白種類顯得尤為重要；而蛋白冠蛋白質(zhì)組學(xué)所擁有的**磁珠配套全自動(dòng)化前處理設(shè)備，能夠大大提升蛋白質(zhì)檢測(cè)深度；該技術(shù)被成功應(yīng)用于NSCLC研究中，可以檢測(cè)到已有研究過的biomarker指標(biāo)和潛在的含量低于10ng/ml的潛在biomarker。
總結(jié)現(xiàn)有的很多疾病的biomarker含量低于10ng/ml，高深度覆蓋蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)在biomarker研究中將有著廣泛的研究前景。
課程主題：蛋白質(zhì)組學(xué)新技術(shù)介紹與應(yīng)用
- 高深度覆蓋的蛋白組學(xué)技術(shù)與優(yōu)勢(shì)介紹
- 蛋白冠蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)用案例分享
- 高深度覆蓋的蛋白組學(xué)應(yīng)用前景展望