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客戶文章 | 腎透明細(xì)胞癌致瘤機(jī)制:KDM5C基因缺失致使糖原代謝重編和抑制鐵死亡

作者:上海阿趣生物科技有限公司 2021-12-15T11:52 (訪問量:11650)

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KDM5C主要通過促進(jìn)鐵死亡來抑制致瘤性

PPP在抗ROS活性和腫瘤侵襲上具有重大意義,其中間產(chǎn)物NADPH是鐵死亡的指標(biāo)。為了明確KDM5C在ROS抗性和鐵死亡中的潛在作用,作者通過ROS誘導(dǎo)處理來比較各種ccRCC細(xì)胞系ROS抗性。與其他ccRCC細(xì)胞系相比,RCC4表現(xiàn)出相對較高的ROS抗性(圖6 A)。在用TBHP處理后,與RCC4-H514A細(xì)胞相比,RCC4-KDM5C有更多的細(xì)胞死亡(圖6 B)。同時(shí),在TBHP誘導(dǎo)下,KDM5C導(dǎo)致ROS水平顯著增加(圖6 C)。此外,KDM5C顯著增強(qiáng)了Erastin介導(dǎo)的細(xì)胞死亡(圖6 B),這可以被Ferr-1或DFO有效逆轉(zhuǎn),但不能被Z-VAD或Nec-1s逆轉(zhuǎn)。因此,與RCC4-H514A細(xì)胞相比,RCC4-KDM5C細(xì)胞中Erastin誘導(dǎo)的脂質(zhì)過氧化增加更明顯(圖6 D)。


圖6. KDM5C主要通過抑制鐵死亡來抑制致瘤性


KDM5C敲除賦予癌細(xì)胞對ROS和鐵死亡的抵抗力

敲除KDM5C后,與幾種ccRCC細(xì)胞系對TBHP和Erastin的抵抗力顯著增強(qiáng)(圖7 A、B)。值得注意的是,在糖原磷酸化酶抑制劑(GPI)會抑制其抗性(圖7 C),這表明KDM5C蛋白介導(dǎo)的糖原重編程的缺失對于抗ROS和鐵死亡是必不可少的。


圖7. KDM5C的缺失使老化的腎細(xì)胞和ccRCC細(xì)胞對鐵死亡具有抗性


癌癥相關(guān)的KDM5C突變在抑制糖原積累和促進(jìn)鐵死亡方面存在缺陷

測序鑒定到大部分突變在JmjN和JmjC結(jié)構(gòu)域中富集(圖8 A),為了評估這些癌癥相關(guān)的KDM5C突變對糖原積累和鐵死亡的影響,選擇了幾個(gè)JmjN和JmjC結(jié)構(gòu)域相關(guān)的錯(cuò)義突變,并構(gòu)建了穩(wěn)定表達(dá)突變蛋白的相應(yīng)RCC4細(xì)胞系(圖8 A)。有趣的是,所有這些突變體都表現(xiàn)得像H514A,不能有效地降低糖原和G6P水平(圖8 B),并且它們都沒有使細(xì)胞對鐵死亡或ROS誘導(dǎo)劑敏感(圖8 C)。


圖8. 臨床相關(guān)的KDM5C突變體未能降低糖原水平并抑制鐵死亡


基于前面的結(jié)果,作者提出了ccRCC中失活KDM5C突變的模型。如圖9所示,雌性KDM5C有兩個(gè)活性等位基因;因此,在單個(gè)基因改變后,雌性不會完全喪失基因。相比之下,在男性中,一個(gè)腎細(xì)胞突變使KDM5C基因的唯一等位基因失活,從而可能通過增加糖原生成/糖原分解和抑制鐵死亡來促進(jìn)腫瘤發(fā)生。因此,男性更容易患ccRCC。


圖9. 失活KDM5C突變和ccRCC發(fā)病模型



結(jié) 論

該文章揭示了組蛋白修飾基因KDM5C失活突變重編程糖原代謝和隨后的PPP,并誘導(dǎo)了鐵死亡抗性,從而擴(kuò)展了KDM5C功能庫,這些功能對于ccRCC的腫瘤發(fā)生至關(guān)重要,有助于解釋人類癌癥中男性占主導(dǎo)地位的長期難題。此外,該研究結(jié)果可能表明在ccRCC中靶向糖原代謝的治療價(jià)值。
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提取碼:yx87

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文章標(biāo)題:Deficiency of the X-inactivation escaping gene KDM5C in clear cell renal cell carcinoma promotes tumorigenicity by reprogramming glycogen metabolism and inhibiting ferroptosis

發(fā)表期刊:Theranostics

發(fā)表時(shí)間:2021.08.04

影響因子:11.556

合作客戶:武漢大學(xué)

百趣提供的服務(wù):PPP、EMP靶標(biāo)代謝流


研究背景


腎透明細(xì)胞癌 (ccRCC) 是最常見的腎癌形式,病癥表現(xiàn)為富含脂質(zhì)和糖原的細(xì)胞質(zhì)沉積物增加。研究表明,ccRCC中諸多基因位點(diǎn)發(fā)生突變,其中VHL基因和染色質(zhì)修飾基因KDM5C。盡管已證明VHL缺失可導(dǎo)致糖原累積,X染色體上KDM5C基因失活逃逸導(dǎo)致男性為主要患者,但其潛在機(jī)制仍不清楚。


此外,ccRCC患者存活率較低可能與磷酸戊糖途徑(PPP)的上調(diào)有關(guān),因此糖原代謝可以作為治療靶點(diǎn),但是,ccRCC中糖原累積和相關(guān)致癌功能的遺傳因素尚不完全清楚。


本文利用全外顯子組與RNA測序評估KDM5C在ccRCC中的功能,結(jié)合靶標(biāo)代謝流研究KDM5C如何影響細(xì)胞內(nèi)代謝通量。同時(shí)還對小鼠進(jìn)行KDM5C基因敲除收集更多的體內(nèi)證據(jù),揭示了組蛋白修飾基因失活突變重編程糖原代謝的機(jī)制,并有助于解決人類癌癥中男性占主導(dǎo)地位的長期難題。



研究內(nèi)容


具有最高糖原水平的 ccRCC 細(xì)胞系存在著 KDM5C 基因移碼突變

對ccRCC 6個(gè)細(xì)胞系進(jìn)行高碘酸-希夫 (PAS) 染色和糖原定量測定發(fā)現(xiàn),相比于其他同樣缺乏 VHL基因的癌細(xì)胞系,RCC4表現(xiàn)出最高的糖原水平(圖1 A、B)。此外,外顯子測序結(jié)果表明RCC4細(xì)胞中KDM5C和VHL出現(xiàn)移碼和錯(cuò)義突變,WB結(jié)果發(fā)現(xiàn)RCC4細(xì)胞中不存在KDM5C和VHL蛋白(圖1 C、D),由此表明癌細(xì)胞中的高糖原水平可能與KDM5C突變有關(guān)。


為了驗(yàn)證KDM5C的恢復(fù)是否會降低RCC4細(xì)胞中的糖原水平,構(gòu)建了野生型KDM5C或其酶失活突變體H514A的RCC4細(xì)胞系,PAS染色結(jié)果和糖原定量測定結(jié)果表明KDM5C能有效降低糖原水平(圖1 E、F),KDM5C突變促進(jìn)ccRCC中糖原的形成。


鑒于KDM5C是X失活逃逸基因,作者分析不同性別的患者的情況,發(fā)現(xiàn)在ccRCC中頻繁突變的基因中,KDM5C突變表現(xiàn)出最高的男女比例(圖1 G),KDM5C蛋白水平在ccRCC患者中下降,同時(shí)糖原顯著增加(圖1 H),這就解釋了為什么ccRCC患者大部分為男性。


圖1. X失活逃逸基因KDM5C在糖原水平最高的ccRCC細(xì)胞系中具有移碼突變


KDM5C缺失引起ccRCC特異性代謝表型

為了證實(shí)KDM5C缺失導(dǎo)致ccRCC發(fā)生和糖原積累,作者進(jìn)行KDM5C敲除實(shí)驗(yàn)。在對照組中,雌性腎臟中的KDM5C蛋白水平高于雄性(圖2 A)。相比于對照組,在50%的KDM5C敲除小鼠中觀察到腎囊腫(圖2 B),其管腔的上皮細(xì)胞顯示出強(qiáng)Ki67染色(圖2 C),KDM5C敲除小鼠的腎小管表現(xiàn)出細(xì)胞質(zhì)糖原累積升高(圖2 D), 表明KDM5C缺失可能引發(fā)ccRCC特異性代謝表型并促進(jìn)腫瘤形成。另外,KDM5C敲除穩(wěn)定細(xì)胞系的PAS染色和糖原定量結(jié)果均表明KDM5C耗盡后糖原水平增加(圖2 E-H)。


圖2. KDM5C敲除引發(fā)ccRCC特異性代謝表型

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