需要測(cè)定每個(gè)蛋白樣品的蛋白濃度。根據(jù)所使用的裂解液的不同,需要采用適當(dāng)?shù)牡鞍诐舛?/div>
測(cè)定方法。
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2.電泳(Electrophoresis)
(1)SDS-PAGE 凝膠配制
(2)樣品處理
在收集的蛋白樣品中加入適量濃縮的SDS-PAGE 蛋白上樣緩沖液。例如2X 或5X 的
SDS-PAGE 蛋白上樣緩沖液。使用5X 的SDS-PAGE 蛋白上樣緩沖液可以減小上樣體積,在
相同體積的上樣孔內(nèi)可以上樣更多的蛋白樣品。
(3)上樣與電泳
冷卻到室溫后,把蛋白樣品直接上樣到SDS-PAGE 膠加樣孔內(nèi)即可。為了便于觀察電泳效
果和轉(zhuǎn)膜效果,以及判斷蛋白分子量大小,最好使用預(yù)染蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn)。電泳時(shí)通常推
薦在上層膠時(shí)使用低電壓恒壓電泳,而在溴酚藍(lán)進(jìn)入下層膠時(shí)使用高電壓恒壓電泳。對(duì)于
Bio-Rad 的標(biāo)準(zhǔn)電泳裝置或類(lèi)似電泳裝置,低電壓可以設(shè)置在80-100V,高電壓可以設(shè)置在
120V 左右。SDS-PAGE 可以采用普通的電泳儀就可以滿(mǎn)足要求。為了電泳方便起見(jiàn),也可
以采用整個(gè)SDS-PAGE 過(guò)程恒壓的方式,通常把電壓設(shè)置在100V,然后設(shè)定定時(shí)時(shí)間為90
-120 分鐘。設(shè)置定時(shí)可以避免經(jīng)常發(fā)生的電泳過(guò)頭。通常電泳時(shí)溴酚藍(lán)到達(dá)膠的底端處附
近即可停止電泳,或者可以根據(jù)預(yù)染蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn)的電泳情況,預(yù)計(jì)目的蛋白已經(jīng)被適
當(dāng)分離后即可停止電泳。
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3.轉(zhuǎn)膜(Transfer)
我們推薦在Western 實(shí)驗(yàn)中選用PVDF 膜。**纖維素膜(NC 膜)或PVDF 膜(二氟化樹(shù)脂
膜膜孔徑:0.45um)也可以使用,但**纖維素膜比較脆,在操作過(guò)程中特別是用鑷子夾取
等過(guò)程中容易裂開(kāi)。膜的使用請(qǐng)參考生產(chǎn)商的推薦使用步驟。具體的轉(zhuǎn)膜時(shí)間要根據(jù)目的蛋
白的大小而定,目的蛋白的分子量越大,需要的轉(zhuǎn)膜時(shí)間越長(zhǎng),目的蛋白的分子量越小,需
要的轉(zhuǎn)膜時(shí)間越短。在轉(zhuǎn)膜過(guò)程中,特別是高電流快速轉(zhuǎn)膜時(shí),通常會(huì)有非常嚴(yán)重的發(fā)熱現(xiàn)
象,最好把轉(zhuǎn)膜槽放置在冰浴中進(jìn)行轉(zhuǎn)膜。轉(zhuǎn)膜的效果可以觀察所使用的預(yù)染蛋白質(zhì)分子量
標(biāo)準(zhǔn),通常分子量最大的1-2 條帶較難全部轉(zhuǎn)到膜上。轉(zhuǎn)膜的效果也可以用麗春紅染色液對(duì)
膜進(jìn)行染色,以觀察實(shí)際的轉(zhuǎn)膜效果。也可以用考馬斯亮藍(lán)快速染色液對(duì)完成轉(zhuǎn)膜的
SDS-PAGE 膠進(jìn)行染色,以觀察蛋白的殘留情況。
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4.封閉(Blocking)
轉(zhuǎn)膜完畢后,立即把蛋白膜放置到預(yù)先準(zhǔn)備好的Western 洗滌液中,漂洗1-2 分鐘,以洗去
膜上的轉(zhuǎn)膜液。從轉(zhuǎn)膜完畢后所有的步驟,一定要注意膜的保濕,避免膜的干燥,否則極易
產(chǎn)生較高的背景。用微型臺(tái)式真空泵吸盡洗滌液,加入Western 封閉液,在搖床上緩慢搖動(dòng),
室溫封閉60 分鐘。對(duì)于一些背景較高的抗體,可以在4℃ 封閉過(guò)夜。
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5.一抗孵育(Primary antibody incubation)
參考一抗的說(shuō)明書(shū),按照適當(dāng)比例用Western 一抗稀釋液稀釋一抗。
用微型臺(tái)式真空泵吸盡封閉液,立即加入稀釋好的一抗,室溫或4℃在側(cè)擺搖床上緩慢搖動(dòng)
孵育一小時(shí)。如果一抗孵育一小時(shí)效果不佳,可以在4℃緩慢搖動(dòng)孵育過(guò)夜。回收一抗。加
入Western 洗滌液,在側(cè)擺搖床上緩慢搖動(dòng)洗滌5-10 分鐘。吸盡洗滌液后,再加入洗滌液,
洗滌5-10 分鐘。共洗滌3 次。如果結(jié)果背景較高可以適當(dāng)延長(zhǎng)洗滌時(shí)間并增加洗滌次數(shù)。
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6.二抗孵育(Secondary antibody inucubation)
參考二抗的說(shuō)明書(shū),按照適當(dāng)比例用Western 二抗稀釋液稀釋辣根過(guò)氧化物酶(HRP)標(biāo)記的
二抗。用微型臺(tái)式真空泵吸盡洗滌液,立即加入稀釋好的二抗,室溫或4℃在側(cè)擺搖床上緩
慢搖動(dòng)孵育一小時(shí)。回收二抗,加入Western 洗滌液,在側(cè)擺搖床上緩慢搖動(dòng)洗滌5-10 分
鐘。吸盡洗滌液后,再加入洗滌液,洗滌5-10 分鐘。共洗滌3 次。如果結(jié)果背景較高可以
適當(dāng)延長(zhǎng)洗滌時(shí)間并增加洗滌次數(shù)。
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7.蛋白檢測(cè)(Detection of proteins)
參考相關(guān)說(shuō)明書(shū),使用BeyoECL, Western 熒光檢測(cè)試劑等ECL 類(lèi)試劑來(lái)檢測(cè)蛋白。
洗片時(shí)可以使用X 光片自動(dòng)洗片機(jī)。如果沒(méi)有自動(dòng)洗片機(jī),可以用顯影定影試劑盒自行配
制顯影液和定影液進(jìn)行手工洗片。
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8、膜的重復(fù)利用(Membrane recovery)
如果蛋白樣品非常寶貴,可以使用Western 一抗二抗去除液處理蛋白膜,以重復(fù)利用蛋白膜。
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三、實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng)
1.把聚丙烯酰胺凝膠中的蛋白質(zhì)電泳轉(zhuǎn)移到**纖維膜上;
a. 轉(zhuǎn)移緩沖液洗滌凝膠和**纖維素膜,將**纖維素膜鋪在凝膠上,用5ml 移液管在凝
膠上來(lái)回滾動(dòng)去除所有的氣泡
b. 在凝膠/濾膜外再包一張3mm 濾紙(預(yù)先用轉(zhuǎn)移緩沖液浸濕),將凝膠夾在中間,保持濕
潤(rùn)和沒(méi)有氣泡
c. 將此濾紙/凝膠/薄膜濾紙按照廠家建議方法放入電泳裝置中,凝膠面向陰極
d. 將上述裝置放入緩沖液槽中,并灌滿(mǎn)轉(zhuǎn)移緩沖液以淹沒(méi)凝膠
e. 按照廠家所示接通電源開(kāi)始電泳轉(zhuǎn)移
f. 轉(zhuǎn)移結(jié)束后,取出薄膜和凝膠,棄去凝膠
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2.將薄膜漂在氨基黑中快速染色,直至分子量標(biāo)準(zhǔn)顯現(xiàn)時(shí)取出,記錄下標(biāo)準(zhǔn)位置;
3.用100ml 水洗滌纖維素膜,必要時(shí)可用脫色緩沖液;
4.膜置印跡緩沖液中于37℃保溫1 小時(shí);
5.室溫下,用PBS-Tween 緩沖液洗滌薄膜
6.用封口機(jī)將薄膜封入塑料袋中,盡可能不留空氣;
7.袋的一角剪一緩沖液的小口,用透析袋夾緊;
8.混合:NGS(100 微升),印跡緩沖液中的抗體(2.5-5 毫升),加在裝薄膜的袋中,于室溫下
搖動(dòng)2 小時(shí)(或4℃過(guò)夜);
9.用總體積300ml PBS-Tween 緩沖液,分4 次在一淺盤(pán)中洗滌薄膜,每次75ml;
10.將連接生物素的羊抗兔IgG(40 微升溶于10 毫升印跡緩沖液/100 微升 NGS)加在袋內(nèi),
于室溫下?lián)u動(dòng)1 小時(shí);
11.按步驟9 洗滌;
12.加入抗生素蛋白-HRP(40 微升溶于10 毫升印跡緩沖液/100 微升 NGS),于室溫下?lián)u動(dòng);
13.Western Blot 中轉(zhuǎn)移在膜上的蛋白處于變性狀態(tài),空間結(jié)構(gòu)改變,因此那些識(shí)別空間表位
的抗體不能用于Western Blot 檢測(cè)。這種情況可以將表達(dá)目的蛋白的細(xì)胞或細(xì)胞裂解液中的
所有蛋白先生物素化,再用酶標(biāo)記親和素進(jìn)行Western Blot。實(shí)驗(yàn)中取膠和膜需帶手套。
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