?? SSH是一項(xiàng)可以快速獲取兩個(gè)不同生物材料中差異表達(dá)基因的分子生物學(xué)技術(shù),是快速篩選差異表達(dá)基因的有效方法,也是尋找新基因的重要手段。該技術(shù)尤其適合以genome尚不完全清晰的物種或者以特殊材料為研究對(duì)象的科研工作者。是基因芯片技術(shù)的有效補(bǔ)充。
? ?基本流程:通過差減文庫(kù)構(gòu)建,文庫(kù)驗(yàn)證和篩選(逆向斑點(diǎn)雜交),獲得陽(yáng)性克隆,對(duì)陽(yáng)性克隆測(cè)序及生物信息分析,可判定差異基因的情況。另外結(jié)合RACE技術(shù)可進(jìn)一步克隆所獲得的差異基因的cDNA全長(zhǎng)序列,并可用Northern blot 或Real-Time PCR加以驗(yàn)證。
? 抑制性消減雜交文庫(kù)技術(shù)
是一種革命性的差異表達(dá)基因篩選技術(shù)。該方法結(jié)合了抑制性PCR和消減雜交技術(shù),即御用PCR反應(yīng)鏈內(nèi)退火有限于鏈間退火的特點(diǎn)和分子雜交二級(jí)動(dòng)力學(xué)原理,經(jīng)過體系不斷優(yōu)化建立起來(lái)的快捷、有效的差異基因篩選方法。與傳統(tǒng)的DD—PCR、SAGE及cDNA—RNA等技術(shù)相比,具有低豐度mRNA富集效率高、假陽(yáng)性低、靈敏度高重復(fù)性好等特點(diǎn)。現(xiàn)已廣泛應(yīng)用于動(dòng)植物發(fā)育和分化、疾病易感性差異、抗藥性差異和組織(病理和正常樣本)差異及微生物基因分型差異的研究。
技術(shù)方法成熟有效
不需要利用傳統(tǒng)的物理方法對(duì)單鏈、雙鏈cDNA進(jìn)行分離。只要目的序列存在,就能進(jìn)行指數(shù)擴(kuò)增,篩選出差異基因片段。
放大稀有轉(zhuǎn)錄本
本技術(shù)在同一操作下完成轉(zhuǎn)錄本豐度平衡和差減,在我們的模型實(shí)驗(yàn)中,稀有轉(zhuǎn)錄本至少被放大了5000倍,也就是說(shuō),利用本及時(shí)可以極大地增加獲得表達(dá)差異地稀有轉(zhuǎn)錄本地可能性。
僅僅需要500ng的poly A+ RNA
與其他的消減雜交方法不同,應(yīng)用抑制性消減雜交技術(shù)只需要0.5-2的poly A+ RNA即可進(jìn)行有效實(shí)驗(yàn)。如果您只有極少量(50ng-100ng)的總RNA,我們可以通過poly A+ RNA的高保真線性放大技術(shù)來(lái)合成足量的cDNA來(lái)進(jìn)行抑制性消減雜交實(shí)驗(yàn)。
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