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基因的獲取——mRNA的獲取

作者:福因德科技(武漢)有限公司 暫無發(fā)布時間 (訪問量:19789)

原核表達必須要先獲取基因,通常有以下幾個途徑:

A.從物種mRNA提取反轉(zhuǎn)錄到cDNA模板,通過引物特異性擴增獲取。

B.直接從質(zhì)?;蛱崛〉幕蚪M擴增獲取。

C.基因合成:不易獲取或者需要密碼子優(yōu)化的基因可以考慮基因合成。

D.mRNA的獲?。簞游锝M織及細胞mRNA的提取制備

1.1 準備工作

1.1.1新鮮標本/-80凍存樣本/液氮儲存的標本(保證樣品mRNA不降解)。

1.1.2購買無RNA酶耗材/器材或器材(勻漿器,離心管及槍頭)作RNA酶清除處理:

0.1%的DEPC水浸泡過夜后用蒸餾水清洗,126滅菌30min,或用蒸餾水浸泡清洗,滅菌三次。

1.2 動物組織mRNA提取

將組織樣本轉(zhuǎn)入勻漿器中,每100mg組織樣本加入1ml Trizol提取液, 磨勻至無塊狀物【勻漿液】。

1.3 細胞RNA提取

1.3.1?提取單層貼壁生長細胞RNA:吸盡培養(yǎng)液后,每5~10×106個細胞加入1ml的Trizol,室溫放置5~10 min,每隔2min晃動一次裂解細胞。

1.3.2?提取懸浮生長細胞的RNA:離心沉淀細胞,每5~10×106個細胞加1ml的Trizol,反復(fù)用槍吹打或劇烈震蕩以裂解細胞。

注意事項:

a.加入Trizol前應(yīng)避免洗滌細胞而增加mRNA降解的可能性。

b.細胞充分裂解無團塊。

1.4 將勻漿液轉(zhuǎn)移至離心管中,室溫放置5min。

1.5 按勻漿液/氯仿=5:1的體積比加入氯仿,劇烈震蕩15s后室溫放置5min。

1.6 12,000rpm,4離心15min,吸取水相上清至新離心管中,加入等體積預(yù)冷的異丙醇,充分混勻后置-20 1~2h或室溫0.5h。

1.7 12,000rpm,4離心10min棄上清,管底沉淀為RNA。

1.8 加入0.5~1ml 75%乙醇重懸洗滌RNA,12,000rpm離心5min。

1.9 小心吸凈液體,加入50μl ddH2O,55 5~10min即可完全溶解。

1.10 RNA保存于-80備用。

目前商品化的mRNA提取試劑/試劑盒已經(jīng)非常成熟,針對不同類型的樣品應(yīng)該使用不同類型的提取試劑。商品化試劑盒更能保證實驗結(jié)果的穩(wěn)定,特別是適合于珍貴樣品。福因德生物推出系列RNA提取純化試劑盒可供選擇。

重組蛋白基因的獲取

2. 植物組織/細胞RNA提取

植物組織富含的酚類化合物、多糖及高活性RNase會與RNA 相互作用:酚類化合物被氧化后與RNA 不可逆地結(jié)合,導(dǎo)致RNA 活性喪失及在后續(xù)抽提時RNA 的丟失,或形成不溶性復(fù)合物;而多糖會形成難溶的膠狀物,與RNA 共沉淀;萜類化合物和RNase 會造成RNA 的化學(xué)降解和酶解。因此常規(guī)的RNA提取方法(如胍法、苯酚法和十六烷基三甲基溴化胺法等) 難以對所有的RNA提取都能奏效,常導(dǎo)致以下三種情況:提出的RNA 已被降解;RNA 的得率很低;得到的RNA 不能進行體外反轉(zhuǎn)。

針對以上問題,福因德生物通過優(yōu)化配方和實驗流程,推出了適合于不同需求的植物RNA提取試劑:FrdbioR ZOL 植物總 RNA 提取試劑主要針對常規(guī)植物的RNA提?。籉rdbioR 多糖多酚植物總 RNA 提取試劑盒通過獨特的裂解液/β-巰基乙醇迅速裂解細胞和滅活RNA酶,助提劑快速結(jié)合多糖多酚物質(zhì)并通過離心去除,RNA在高鹽狀態(tài)下吸附于離心柱內(nèi)硅基質(zhì)膜上,漂洗離心去除細胞代謝物、蛋白等雜質(zhì),低鹽溶液從硅基質(zhì)膜上將RNA洗脫;最后通過DNase I消化DNA得到無DNA殘留的高質(zhì)量RNA。

3.RNA的保存

mRNA非常容易降解,是該領(lǐng)域一個棘手問題也是個難題。針對這個問題福因德生物開發(fā)出專用的RNA保存試劑。

4.RNA質(zhì)量檢測:主要包括純度檢測和完整性檢測:

4.1純度檢測:R=OD260/OD280=1.8~2.1(質(zhì)控點:R< 1.8蛋白污染, R > 2.2,RNA降解,理想的R=2.0,含Tris溶液R偏高,但不超過2.2)。

4.2完整性檢測:

檢測方法瓊脂糖凝膠電泳。質(zhì)量較高的RNA,電泳顯示有三條帶,并且28s是18s的兩倍,5s很弱。

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