人工miRNA:降低 SNCA 的新策略,或為α?突觸核蛋白病帶來突破-技術(shù)前沿-資訊-生物在線

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人工miRNA:降低 SNCA 的新策略,或為α?突觸核蛋白病帶來突破

作者:欣博盛生物科技有限公司 暫無發(fā)布時間 (訪問量:9983)

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帕金森病(Parkinson’s disease,PD)是一種神經(jīng)退行性疾病,其主要特征包括震顫、肌強(qiáng)直以及動作遲緩(bradykinesia),即身體運(yùn)動速度減慢。PD 被歸類為突觸核蛋白病(synucleinopathy),這類疾病的共同特征是大腦中異常積累α?突觸核蛋白(alpha synuclein)——一種位于突觸前的調(diào)節(jié)蛋白。突觸核蛋白病及相關(guān)蛋白病在老年群體中愈發(fā)常見,因此研究界加大了對其發(fā)病機(jī)制的探索力度,并積極尋找潛在的治療策略。

 

目前針對帕金森病的潛在治療方法大多集中于直接靶向 α?突觸核蛋白,但臨床研究仍處于早期階段。α?突觸核蛋白由 SNCA 基因編碼,研究表明,該基因中的錯義突變(missense mutations)及單核苷酸多態(tài)性(SNPs)均與增加帕金森病發(fā)病風(fēng)險相關(guān)。因此,賽諾菲(Sanofi)基因醫(yī)學(xué)部的研究人員開展研究,評估利用腺相關(guān)病毒(AAV)介導(dǎo)的人工 microRNA(amiRNA)降低 SNCA 表達(dá)的治療效果。

 

Elmer 等人在一項 α?突觸核蛋白病的預(yù)成纖維(pre?formed fibril,PFF)模型中系統(tǒng)評估了 amiRNA 靶向 SNCA mRNA 的治療潛力,并在體內(nèi)與體外體系中對 amiRNA 進(jìn)行優(yōu)化,以推動其向臨床轉(zhuǎn)化。

 

? amiRNA治療導(dǎo)致目標(biāo)mRNA下調(diào)50%

● 研究人員首先進(jìn)行了劑量范圍研究,以確定 AAV 介導(dǎo)的 amiRNA 所需的劑量,從而實現(xiàn)對小鼠 SNCA 基因表達(dá) 50% 的降低。他們最初在野生型小鼠中評估靶基因的下調(diào)效果,隨后在接受 StressMarq 小鼠重組 α?突觸核蛋白 PFF(目錄號:SPR?324)雙側(cè)紋狀體注射的小鼠中重復(fù)實驗,以誘導(dǎo) α?突觸核蛋白病理。

● 本研究使用了 AAV?PhPeB 載體,這是一種在嚙齒類動物中被驗證具有良好腦穿透能力的衣殼類型。野生型小鼠被給予三種劑量的與小鼠 Snca 序列具有同源性的 amiRNA (amiRmSYN),或給予對照 amiRNA(amiRCTL)。結(jié)果顯示,最高劑量的 amiRmSYN 達(dá)到了預(yù)期目標(biāo),使 Snca 表達(dá)下降約 50%,并因此被用于后續(xù)的帕金森病理小鼠模型實驗。

● 研究中還使用了 StressMarq 小鼠重組 α?突觸核蛋白單體(目錄號:SPR?323)作為對照。由于在 1.5 個月和 3 個月時觀察到的運(yùn)動功能缺陷極為輕微,研究結(jié)果主要依賴神經(jīng)病理學(xué)指標(biāo)來評估治療效果。。研究流程為:小鼠首先接受編碼 amiRmSYN 或 amiRCTL 的 AAV 處理,隨后在一個月后注射 α?突觸核蛋白單體或 PFF。注射三個月后收集腦組織進(jìn)行分析。

● 與野生型小鼠的觀察結(jié)果一致,amiRmSYN 的治療使目標(biāo) mRNA 下調(diào)約 50%。此外,使用 amiRmSYN 進(jìn)行 α?突觸核蛋白敲低顯著減少了 pSer129 病理的誘導(dǎo)。相反,接受 α?突觸核蛋白單體或 PFF 并結(jié)合對照 amiRCTL 的實驗對象,其 Snca 表達(dá)并未出現(xiàn)改變。

 

? 提升人源特異性amiRNA候選物的效力

● 在驗證 AAV 介導(dǎo)的 amiRNA 治療的概念驗證(proof of concept)后,研究團(tuán)隊將研究重點(diǎn)轉(zhuǎn)向優(yōu)化這些 amiRNA,使其能夠用于未來針對人類的潛在治療。通過生物信息學(xué)篩選 (in silico down selection),研究者獲得了14 條候選 amiRNA。隨后使用酶聯(lián)免疫吸附測定(ELISA)對這些序列進(jìn)行了評估,結(jié)果顯示它們均可降低 α 突觸核蛋白水平。

● 研究人員接著在 HeLa 細(xì)胞中開展劑量反應(yīng)實驗,分析此前篩選出的 5 條 amiRNA。其中有 3 條的表現(xiàn)優(yōu)于先前用于 PFF 小鼠模型的 amiRmSYN,提示其在人類 PD 模型中具有潛在的良好效果。

● 基于這些結(jié)果,Elmer 等人進(jìn)一步嘗試通過串聯(lián)(concatenation) 的方式增強(qiáng) amiRNA 的 SNCA 敲低效果。他們確定了 4 條 amiRNA 的母本向?qū)ф?parental guide strands),并基于每條向?qū)ф湗?gòu)建了表達(dá)雙拷貝(“2X”)或三拷貝(“3X”) amiRNA發(fā)夾結(jié)構(gòu)的串聯(lián)變體。天然的 miRNA 經(jīng)常以包含多個發(fā)夾結(jié)構(gòu)的串聯(lián)形式存在,而人工串聯(lián)也已被證實是增強(qiáng)靶標(biāo)抑制的有效策略。

● 此外,研究團(tuán)隊還評估了在這些發(fā)夾結(jié)構(gòu)之間改變間距是否會影響效力。他們在 2X 和 3X 變體中加入不同長度的 spacer,并將其效力與非串聯(lián)的單拷貝(“1X”)設(shè)計進(jìn)行比較。通過將 amiRNA 質(zhì)粒轉(zhuǎn)染入 HeLa 細(xì)胞以測量 SNCA 敲低效果,結(jié)果顯示幾乎所有 2X 與 3X 變體均優(yōu)于 1X 的設(shè)計。研究還發(fā)現(xiàn),串聯(lián)對向?qū)ф溂庸さ挠绊懛浅S邢蕖?/p>

 

? 體內(nèi)SNCA下調(diào)效果及amiRNA變體的RISC互作圖譜分析

● 研究團(tuán)隊的下一步目標(biāo),是在體內(nèi)模型中評估串聯(lián) amiRNA 對人源 α 突觸核蛋白的敲低效果。為此,研究人員使用了由 Michael J. Fox 基金會開發(fā)的轉(zhuǎn)基因小鼠品系,由于該轉(zhuǎn)基因小鼠在基因組中整合了人源 SNCA,它能夠有效接受針對 SNCA mRNA 的靶向性干預(yù)。研究人員利用 AAV 衣殼將 amiRNA 注射至小鼠紋狀體,并在注射六周后收集紋狀體組織。與此前結(jié)果一致,3X 變體中更高水平的 amiRNA 表達(dá)導(dǎo)致 Snca 水平顯著降低。

● 最后,該研究通過組合方法評估 SNCA 下調(diào)的下游影響。研究采用了差異基因表達(dá)(DEG)分析、交聯(lián)(cross linking)、免疫共沉淀(immunoprecipitation)以及 RNA 測序多種技術(shù)的整合手段。該組合技術(shù)此前已用于 miRNA: mRNA 互作的定量分析。在這一研究中,研究人員識別出 1 條具有非靶向作用的母本 amiRNA,以及 3 條未發(fā)現(xiàn)明顯非靶向效應(yīng)的母本向?qū)ф湣?/p>

 

總結(jié) (Summary)

Elmer等人的研究評估了AAV介導(dǎo)的人工miRNA(amiRNA)在阻斷致病性α突觸核蛋白傳播方面的有效性。他們在多種設(shè)置中進(jìn)行了驗證,包括體內(nèi)與體外模型, 并同時針對嚙齒類與人源SNCA基因進(jìn)行敲低,從而降低Snca表達(dá), 最終達(dá)到阻斷帕金森病模型中病理擴(kuò)散的目的。這些發(fā)現(xiàn)為帕金森病治療提供了新的潛在機(jī)制, 并將50%的SNCA下調(diào)幅度確立為未來amiRNA研究的重要目標(biāo)基線。

 

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參考資料

● Artificial miRNA mediated reduction of SNCA for the treatment of α-synucleinopathies. Elmer, B. et al., Mol Ther. 2025

 

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