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來(lái)自TriLink的Next-level體外轉(zhuǎn)錄(IVT)試劑盒

作者:欣博盛生物科技有限公司 暫無(wú)發(fā)布時(shí)間 (訪問(wèn)量:15597)

來(lái)自TriLink的Next-level體外轉(zhuǎn)錄(IVT)試劑盒

 

體外轉(zhuǎn)錄技術(shù)(In Vitro Transcription,IVT)是指在無(wú)細(xì)胞體系中,以 DNA 為模板,利用 RNA 聚合酶催化合成 RNA 分子的技術(shù)。其核心優(yōu)勢(shì)是無(wú)需依賴活細(xì)胞,可快速、定向生產(chǎn)高純度、高特異性的 RNA(如 mRNA、siRNA、shRNA、rRNA 等),且能通過(guò)修飾優(yōu)化 RNA 的穩(wěn)定性、翻譯效率或免疫原性,已成為分子生物學(xué)、基因治療、疫苗研發(fā)等領(lǐng)域的核心工具。

CleanCap® IVT試劑盒:簡(jiǎn)而不凡

TriLink的CleanCap® IVT試劑盒通過(guò)體外轉(zhuǎn)錄及 CleanCap® 共轉(zhuǎn)錄加帽合成 mRNA 所需的全部核心組分。極大的優(yōu)化了RNA合成與加帽流程,同時(shí)顯著提升實(shí)驗(yàn)結(jié)果,是高性能RNA合成的一體化解決方案。

 

CleanCap® 目前有兩款高效的mRNA合成Kit,無(wú)論您是IVT領(lǐng)域的新手,還是想要將蛋白表達(dá)效率最大化,這兩款試劑盒都可以助您一步獲得高產(chǎn)量、低dsRNA的加帽mRNA:

CleanCap® AG (3' OMe) CleanScript™ IVT Kit :

通用性強(qiáng),無(wú)需過(guò)多優(yōu)化;采用CleanCap® AG (3' OMe) 帽類似物,是原始CleanCap® AG的改良版本,可實(shí)現(xiàn)更高的蛋白表達(dá)水平。

 

CleanCap® M6 High Yield IVT Kit:

包含TriLink最新的帽類似物CleanCap® M6,相較于酶法加帽和CleanCap® AG類似物,可以實(shí)現(xiàn)更高的蛋白表達(dá);為了實(shí)現(xiàn)最佳產(chǎn)率,需要對(duì)5' UTR序列進(jìn)行評(píng)估。

 

圖一:mRNA的帽結(jié)構(gòu)會(huì)影響蛋白表達(dá)水平。采用 CleanCap M6 帽類似物的mRNA,其蛋白表達(dá)水平高于其前代產(chǎn)品(A)及酶法加帽技術(shù)(B)。

 

圖二:TriLink的新型RNA聚合酶可以顯著降低mRNA合成過(guò)程中dsRNA的形成。在使用 CleanCap AG(3′OMe)和 CleanCap M6 帽類似物合成未修飾或 N1 - 甲基假尿苷(N1 MePsU)修飾的 mRNA 時(shí),CleanScribe™ RNA 聚合酶可顯著減少dsRNA的形成。

 

圖三:優(yōu)化的IVT方案可顯著提高 CleanCap AG(3’OMe) mRNA的產(chǎn)率。 采用TriLink的CleanScript IVT方案,CleanCap AG(3’OMe)mRNA濃度最高可達(dá)10 mg/mL,較傳統(tǒng)方案提升高達(dá)兩倍。

 

圖四:脈沖進(jìn)料可以進(jìn)一步提高CleanCap M6 mRNA的產(chǎn)率。 經(jīng)2h脈沖進(jìn)料(操作方法參考protocol)后,CleanCap M6 mRNA 的產(chǎn)率最高可達(dá)10mg/ml,相較于傳統(tǒng)流程提升近2倍。

 

兩款Kit如何選擇呢?

 

CleanCap® AG (3' OMe) CleanScript™ IVT Kit

CleanCap® M6 IVT Kit, High Yield

操作經(jīng)驗(yàn)

通用序列兼容性強(qiáng),適合該開始進(jìn)行mRNA研究的用戶

優(yōu)化蛋白表達(dá),適合希望最大限度提高mRNA表達(dá)和整體效力的客戶

帽類似物

CleanCap® AG (3' OMe)

CleanCap® M6

蛋白表達(dá)水平

+++

++++

可合成的RNA類型

mRNA

mRNA

序列兼容性

通用性強(qiáng)-適用所有UTR

5' UTR序列可能影響產(chǎn)率

轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)

AG起始

AG起始

包含的修飾rNTP

N1 - 甲基假尿苷

N1 - 甲基假尿苷

包含的10×緩沖液

CleanScript™ 體外轉(zhuǎn)錄緩沖液

M6體外轉(zhuǎn)錄緩沖液

包含的酶混合物

AG CleanScribe™ RNA 聚合酶混合物

M6 CleanScribe™ RNA 聚合酶混合物

每100 µL反應(yīng)預(yù)期產(chǎn)率

0.8-1mg

0.8-1mg

 

下方表格對(duì)兩款試劑盒的特性進(jìn)行了對(duì)比,兩款產(chǎn)品根據(jù)對(duì)蛋白表達(dá)水平、下游應(yīng)用及IVT操作經(jīng)驗(yàn)的不同需求,提供了各自獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)。您可以根據(jù)具體需求,選擇最適合您的試劑盒。

 

訂購(gòu)信息:

產(chǎn)品名稱

貨號(hào)

反應(yīng)規(guī)格

CleanCap® AG (3' OMe) CleanScript™ IVT Kit

K-7413-25

25 x 100 μL 或 125 x 20 μL

CleanCap® M6 IVT Kit, High Yield

K-7453-25

 

CleanCap® AG (3' OMe) CleanScript™ IVT Kit中組分:

Component

Concentration

Amount

CleanCap® Reagent AG (3′ OMe)

100 mM

10 µmol

Adenosine-5′-Triphosphate

100 mM

100 µmol

Cytidine-5′-Triphosphate

100 mM

100 µmol

Guanosine-5′-Triphosphate

100 mM

100 µmol

Uridine-5′-Triphosphate

100 mM

100 µmol

N1-Methyl-Pseudouridine-5′-Triphosphate

100 mM

100 µmol

AG CleanScribe™ RNA Polymerase Mix

10X

250 µL

10X AG CleanScript™ IVT Buffer

10X

1 mL

FLuc Control Plasmid

0.5 µg/µL

25 µg

 

CleanCap® M6 IVT Kit中組分:

Component

Concentration

Amount

CleanCap® Reagent M6

100 mM

25 µmol

Adenosine-5′-Triphosphate

100 mM

100 µmol

Cytidine-5′-Triphosphate

100 mM

100 µmol

Guanosine-5′-Triphosphate

100 mM

100 µmol

Uridine-5′-Triphosphate

100 mM

100 µmol

N1-Methyl-Pseudouridine-5′-Triphosphate

100 mM

100 µmol

M6 CleanScribe™ RNA Polymerase Mix

10X

250 µL

10X M6 IVT Buffer

10X

1 mL

FLuc Control Plasmid (linearized)

0.5 µg/µL

25 µg

 

相關(guān)產(chǎn)品

可用作對(duì)照的目錄mRNA

產(chǎn)品名稱

貨號(hào)

規(guī)格

CleanCap® M6 EGFP mRNA (N1MePsU)

L-8101

0.1mg、1mg、5mg或定制

CleanCap® M6 FLuc mRNA (N1MePsU)

L-8102

CleanCap® M6 mCherry mRNA (N1MePsU)

L-8103

CleanCap® M6 Cas9 mRNA (N1MePsU)

L-8106

CleanCap® M6 EPO mRNA (N1MePsU)

L-8109

CleanCap® M6 Cre mRNA (N1MePsU)

L-8111

 

常見問(wèn)題

Q:我該如何選擇這兩款試劑盒?

A:試劑盒的選擇取決于您期望的蛋白表達(dá)水平、下游應(yīng)用場(chǎng)景,以及您的 IVT(體外轉(zhuǎn)錄)實(shí)驗(yàn)經(jīng)驗(yàn)。

CleanCap® AG (3' OMe) CleanScript™ IVT kit:這是一款通用性強(qiáng)的試劑盒,僅需少量?jī)?yōu)化即可合成高產(chǎn)量、低雙鏈 RNA(dsRNA)的加帽 mRNA。經(jīng)證實(shí),CleanCap® AG (3' OMe) 帽類似物比初代 CleanCap® AG 帽類似物的蛋白表達(dá)水平更高,且已應(yīng)用于商業(yè)化獲批的 mRNA 疫苗中。

CleanCap® M6 IVT kit(High yeild):該試劑盒包含最新的 CleanCap® M6 帽類似物,適合追求比酶法加帽及前代 CleanCap® AG 類似物更高蛋白表達(dá)的用戶。若要通過(guò)標(biāo)準(zhǔn)方案達(dá)到最高 5 mg/mL 的產(chǎn)量,或通過(guò)補(bǔ)充脈沖進(jìn)料方案達(dá)到 10 mg/mL 的產(chǎn)量,用戶可能需要評(píng)估自身 5'-UTR序列的兼容性。

 

Q:可以用這兩個(gè)試劑盒來(lái)制備不加帽的mRNA嗎?

A:對(duì)于CleanCap® AG(3' OMe)和CleanCap® M6 IVT試劑盒,你可以在我們提供的protocol中省略加帽步驟,從而獲得無(wú)帽mRNA,預(yù)期產(chǎn)量相近。不過(guò),如果你的模板是“AG起始”,5'端的異質(zhì)性會(huì)更高(例如A和G的混合物)。根據(jù)無(wú)帽mRNA的應(yīng)用需求,若有需要,可通過(guò)磷酸酶處理去除5'三磷酸基團(tuán)。

 

Q:使用 CleanCap® M6 帽類似物合成的 mRNA,其翻譯效率與 CleanCap® AG (3' OMe) 帽類似物及酶法加帽相比如何?

A:通過(guò)體外和體內(nèi)實(shí)驗(yàn),我們持續(xù)觀察到:與 CleanCap AG (3' OMe) 帽類似物及酶法加帽的 mRNA 相比,用 CleanCap M6 加帽的 mRNA 蛋白表達(dá)水平更高(提升幅度≥30%)。

這種蛋白表達(dá)的提升,部分原因可能是 CleanCap M6 類似物上的 N6 - 甲基化腺苷抑制了 Dcp2 介導(dǎo)的脫帽作用。(DOI: 10.1016/j.omtn.2025.102456 External Link)

 

Q:5'UTR序列會(huì)對(duì)CleanCap® M6 IVT 試劑盒產(chǎn)生什么影響?

A:我們觀察到,CleanCap M6 IVT 試劑盒的產(chǎn)量可能會(huì)受到部分 5'UTR 序列的影響。如果您對(duì)自己使用的UTR序列有顧慮,請(qǐng)聯(lián)系我們獲取技術(shù)支持。

 

Q:如何優(yōu)化 mRNA 的 5'UTR 和 3'UTR 序列?

A:mRNA 的5'UTR和3'UTR的優(yōu)化取決于您的具體研究目的,以及 mRNA 對(duì)應(yīng)的靶細(xì)胞或組織類型。

為支持這一需求,TriLink的Officinae Bio 服務(wù)提供專業(yè)的優(yōu)化服務(wù):您只需提供您的序列和 UTR 信息,TriLink會(huì)進(jìn)行密碼子優(yōu)化,以幫助實(shí)現(xiàn)最佳表達(dá)效果。

此外,查閱已發(fā)表的文獻(xiàn)是確定與您的應(yīng)用場(chǎng)景相關(guān)的UTR序列的有效方式。我們也建議開展篩選實(shí)驗(yàn),以評(píng)估翻譯效率。

如果您使用的是 TriLink的mRNA 服務(wù),我們?cè)?DNA 模板中集成了自主 UTR 序列選項(xiàng),您可以將開放閱讀框(ORF)插入其中,從而簡(jiǎn)化實(shí)驗(yàn)流程。

 

 

 

 

 

 

 

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