Olink精準(zhǔn)蛋白質(zhì)組學(xué)助力腫瘤生物標(biāo)志物開發(fā)-技術(shù)前沿-資訊-生物在線

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Olink精準(zhǔn)蛋白質(zhì)組學(xué)助力腫瘤生物標(biāo)志物開發(fā)

作者:上海中科新生命生物科技有限公司 2022-10-11T11:43 (訪問量:8126)


2022年“中國腫瘤標(biāo)志物學(xué)術(shù)大會”召開在即。腫瘤標(biāo)志物的測定,作為腫瘤診斷、監(jiān)測治療的重要手段之一,結(jié)合病理活檢、影像學(xué)等可有效幫助腫瘤患者更好地實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)治療。但遺憾的是,現(xiàn)階段腫瘤標(biāo)志物的開發(fā)仍在持續(xù)探索中,低豐度蛋白的檢測是其中的一大難題。

癌癥登月計劃(Cancer Moonshot)旗下的癌癥免疫監(jiān)測和分析中心選擇Olink作為低豐度蛋白標(biāo)志物的核心檢測方法,為一系列項(xiàng)目提供細(xì)胞因子、趨化因子生長因子等的檢測和分析數(shù)據(jù)。今天小編來跟大家分享一下Olink蛋白質(zhì)組學(xué)在腫瘤領(lǐng)域的應(yīng)用,以期能給大家提供一些思路及靈感。


圖片來源鏈接:https://cimac-network.org/assays

1. 腫瘤早篩

文獻(xiàn)名稱Prospective identification of elevated circulating CDCP1 in patients years before onset of lung cancer

期刊Cancer Research(IF 12.701)

檢測平臺Olink-炎癥、mRNA-seq

樣本類型:血漿

研究內(nèi)容:該研究通過olink96-炎癥panel檢測648個診斷前血液樣本,發(fā)現(xiàn)肺腺癌早篩標(biāo)志物CDCP1,又通過mRNA-seq富集分析表明CDCP1在與細(xì)胞粘附和遷移相關(guān)的通路中具有潛在作用。




2. 預(yù)后分層

文獻(xiàn)名稱Identification of Potential Prognostic and Predictive Immunological Biomarkers in Patients with Stage I and Stage III Non-Small Cell Lung Cancer (NSCLC): A Prospective Exploratory Study

期刊Cancers(IF 6.575)

檢測平臺Olink-炎癥等

樣本類型:血漿

研究內(nèi)容:該研究采用Olink蛋白質(zhì)組學(xué)發(fā)現(xiàn)I期NSCLC陰性預(yù)后標(biāo)志物CD244,III期NSCLC陽性生物標(biāo)志物CR2、IFNGR2。此外,通過治療誘導(dǎo)的循環(huán)免疫原蛋白表達(dá)水平的變化確定CXCL10、IL-10為額外的陰性預(yù)測生物標(biāo)志物。



3. 藥物療效

文獻(xiàn)名稱Plasma proteomics identifies Leukemia Inhibitory Factor (LIF) as a novel predictive biomarker of immune-checkpoint blockade resistance

期刊Annals of Oncology(IF 51.769)

檢測平臺Olink-1536、RNA-seq 等

樣本類型:血漿

研究內(nèi)容:通過Olink蛋白質(zhì)組學(xué)發(fā)現(xiàn),在探索和驗(yàn)證隊(duì)列中,白血病抑制因子(LIF)基線水平升高與接受ICB治療的癌癥患者較差的臨床結(jié)局相關(guān),該癥狀獨(dú)立于其他預(yù)后因素。我們還證明了LIF的循環(huán)水平與腫瘤微環(huán)境中三級淋巴結(jié)構(gòu)(TLS)的存在呈負(fù)相關(guān)。

文獻(xiàn)名稱In-depth plasma proteomics reveals increase in circulating PD-1 during anti-PD-1 immunotherapy in patients with metastatic cutaneous melanoma

期刊J Immunother Cancer(IF 12.469)

檢測平臺Olink-免疫腫瘤、質(zhì)譜

樣本類型:血漿

研究內(nèi)容:利用基于質(zhì)譜+Olink的全局蛋白質(zhì)組學(xué)分析了24名接受ICI治療CM患者和24名接受MAPKis治療CM患者的血漿蛋白組以確定ICI治療的特異性血漿蛋白水平的變化。結(jié)果顯示在抗PD-1治療期間循環(huán)PD-1的增加,以及在抗PD-1應(yīng)答者中呈現(xiàn)多樣化的免疫血漿蛋白組學(xué)標(biāo)志。



4. 腫瘤與其他疾病關(guān)聯(lián)研究

文獻(xiàn)名稱Inflammatory Leptomeningeal Cytokines Mediate COVID-19 Neurologic Symptoms in Cancer Patients

期刊Cancer cell(IF 38.585)

檢測平臺Olink-炎癥、Olink-神經(jīng)探索等

樣本類型:腦脊液

研究內(nèi)容:本研究采用Olink蛋白組學(xué)分析腦脊液中蛋白質(zhì)的實(shí)時動態(tài)變化,發(fā)現(xiàn)II型干擾素驅(qū)動的柔腦膜炎癥細(xì)胞因子釋放可誘發(fā)神經(jīng)系統(tǒng)損傷。延長型神經(jīng)炎癥伴隨的細(xì)胞因子釋放綜合癥會導(dǎo)致長期神經(jīng)認(rèn)知障礙,這也預(yù)示對COVID-19感染引發(fā)的神經(jīng)性并發(fā)癥治療需要干預(yù)免疫炎癥系統(tǒng)。

Olink作為目前流行的創(chuàng)新蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法,其獨(dú)特的PEA技術(shù)大大增加了樣本中低豐度蛋白的鑒定深度,輔助腫瘤生物標(biāo)志物開發(fā),推進(jìn)腫瘤液體活檢的進(jìn)程。
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