近日，第二軍醫(yī)大學(xué)國(guó)家肝癌科學(xué)中心陳磊研究員、王紅陽(yáng)院士課題組，龍華醫(yī)院劉維薇教授課題組和復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院王鵬教授課題組在Gastroenterology雜志(IF=33.88）合作發(fā)表了名為《Integrated Multi-omics Landscape of Liver Metastases》的文章。文章應(yīng)用Standard BioTools 質(zhì)譜流式技術(shù)，轉(zhuǎn)錄組和全外顯子測(cè)序等技術(shù)研究了原發(fā)性肝癌和肝轉(zhuǎn)移癌患者的免疫細(xì)胞圖譜以及免疫細(xì)胞亞型的潛在機(jī)制。
腫瘤微環(huán)境（TME）在原發(fā)性肝癌（PLC）和肝轉(zhuǎn)移（LM）的形成和發(fā)展中起著重要作用。確定TME的特征并將其作為靶點(diǎn)，可能對(duì)各種轉(zhuǎn)移性腫瘤有益。然而，各種LM中TME的異質(zhì)表型和可能的貢獻(xiàn)仍未得到證實(shí)。因此作者試圖研究了LMs內(nèi)TME的多樣化組成及其對(duì)LM進(jìn)展和臨床結(jié)果的潛在意義。
作者設(shè)計(jì)了32個(gè)marker的表型panel，用質(zhì)譜流式技術(shù)檢測(cè)了100例肝轉(zhuǎn)移（LM）和50例原發(fā)性肝癌（PLC）患者的隊(duì)列樣本。由于樣本數(shù)目眾多，作者采用了在質(zhì)譜流式上廣泛使用的Pd（鈀元素） Barcoding技術(shù)，有效地減少了批次染色操作對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果的影響。作者重點(diǎn)研究了T細(xì)胞亞群，通過評(píng)估經(jīng)典的表面標(biāo)志物（HLA-DR：T細(xì)胞激活標(biāo)志物，PD-1：T細(xì)胞抑制標(biāo)志物）確定了八個(gè)功能不同的亞群（圖A）。并且得到五種由不同的T細(xì)胞組成的免疫微環(huán)境(IM)亞型（IM1至IM5）。結(jié)合病人的生存分析發(fā)現(xiàn)，五種IM亞型（IM1至IM5）與不同類型腫瘤的不同免疫特征和臨床結(jié)果有關(guān), 具有終末衰竭（IM1）或稀有T細(xì)胞炎癥（IM2和IM3）免疫特征的患者預(yù)后較差。在質(zhì)譜流式的結(jié)果的基礎(chǔ)上，作者也進(jìn)一步結(jié)合轉(zhuǎn)錄組等其他技術(shù)探索了其機(jī)制，發(fā)現(xiàn)了關(guān)鍵分子SLC2A1，其通過增加肝轉(zhuǎn)移病灶中Spp1+巨噬細(xì)胞的比例及其對(duì)T細(xì)胞的抑制作用，促進(jìn)免疫抑制和沙漠化。此外，SLC2A1通過誘導(dǎo)原發(fā)性結(jié)直腸癌中的調(diào)節(jié)性T細(xì)胞（Tregs和LAG3+CD4+T cells）來促進(jìn)其免疫逃避和肝轉(zhuǎn)移。
總之，作者全面描述了LMs免疫、基因組和轉(zhuǎn)錄組特征的研究，提供了肝臟轉(zhuǎn)移的綜合多組學(xué)景觀，揭示了惡性腫瘤亞型的潛在機(jī)制，增加了對(duì)多種類型LMs的腫瘤微環(huán)境的全面了解。