Science Advances | 脂質(zhì)誘導(dǎo)的向絲氨酸途徑的代謝轉(zhuǎn)變促進(jìn)乳腺細(xì)胞的表觀(guān)遺傳重編程-技術(shù)前沿-資訊-生物在線(xiàn)

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Science Advances | 脂質(zhì)誘導(dǎo)的向絲氨酸途徑的代謝轉(zhuǎn)變促進(jìn)乳腺細(xì)胞的表觀(guān)遺傳重編程

作者:麥特繪譜生物科技(上海)有限公司 暫無(wú)發(fā)布時(shí)間 (訪(fǎng)問(wèn)量:24005)

如今,人們的飲食日益豐富多樣,油炸食品、動(dòng)物脂肪和奶油、黃油和奶酪等乳制品中脂質(zhì)含量較高,深受大眾喜愛(ài)。殊不知,這些美食中富含的飽和脂肪酸,正悄然影響著人體代謝過(guò)程,從而誘導(dǎo)相關(guān)疾病產(chǎn)生。乳腺癌嚴(yán)重威脅女性健康,盡管治療和檢測(cè)手段進(jìn)步使相關(guān)死亡率下降,但全球發(fā)病率仍呈上升趨勢(shì),尤其是雌激素受體陰性乳腺癌(ERneg BC)的預(yù)防面臨多重困境。

 

2025年,美國(guó)西北大學(xué)研究人員在期刊Science Advances(IF=11.7)上發(fā)表了題為 “A metabolic shift to the serine pathway induced by lipids fosters epigenetic reprogramming in nontransformed breast cells” 的研究文章。這篇論文主要研究脂質(zhì)代謝與ERneg BC的關(guān)聯(lián),發(fā)現(xiàn)中鏈脂肪酸辛酸(OA)會(huì)使非轉(zhuǎn)化乳腺細(xì)胞代謝轉(zhuǎn)變,促進(jìn)表觀(guān)遺傳重編程,影響細(xì)胞表型和功能,還涉及腫瘤發(fā)生的潛在機(jī)制

 

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【技術(shù)路線(xiàn)圖】

 

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1.辛酸將代謝轉(zhuǎn)向從頭絲氨酸途徑

 

研究者利用辛酸處理的非轉(zhuǎn)化乳腺細(xì)胞,基于U-13C葡萄糖示蹤結(jié)果表明,葡萄糖攝取、糖酵解和磷酸戊糖通路通量降低,并且1C-THF被重定向到蛋氨酸循環(huán),增加對(duì)DNA甲基化的通量。靶向代謝組檢測(cè)發(fā)現(xiàn),OA處理15分鐘后,絲氨酸、SAM、GSH和甜菜堿的產(chǎn)量增加;30分鐘后,2-HG、GSH、NADH和α-酮戊二酸(aKG)的產(chǎn)量增加。

 

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圖1. 代謝轉(zhuǎn)變

 

 

2. 表觀(guān)遺傳重編程

 

全基因組DNA甲基化檢測(cè)表明,OA誘導(dǎo)的SAM增加整體DNA甲基化。CUT&RUN結(jié)果顯示,OA誘導(dǎo)的基因與EMT、神經(jīng)相關(guān)通路、胚胎干細(xì)胞多能性、細(xì)胞遷移和侵襲以及乳腺癌等通路相關(guān)。RT-qPCR進(jìn)一步驗(yàn)證,基因表達(dá)變化是由向SOG和蛋氨酸循環(huán)的代謝轉(zhuǎn)變驅(qū)動(dòng)的,并且是繼發(fā)于H3K4me3增加的表觀(guān)遺傳重編程的結(jié)果。

 

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圖2. 表觀(guān)遺傳重編程

 

 

3. 細(xì)胞表型及功能變化

 

通過(guò)監(jiān)測(cè)了ROS誘導(dǎo)的氧化還原變化,發(fā)現(xiàn)OA暴露導(dǎo)致細(xì)胞啟動(dòng)抗氧化防御機(jī)制來(lái)減輕ROS濃度的增加。檢測(cè)DNA損失的堿性彗星試驗(yàn)顯示,OA和外源性2-HG顯著增加彗星尾(DNA損傷增加),但添加PHGDH抑制劑CBR-5884或NTC-503并未減少彗星尾;添加N-乙酰半胱氨酸可挽救OA處理導(dǎo)致的細(xì)胞活力下降。

 

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圖3. 細(xì)胞利用抗氧化防御來(lái)控制活性氧的濃度

 

 

4. OA處理的組織來(lái)源的乳腺微結(jié)構(gòu)的單細(xì)胞景觀(guān)

 

單細(xì)胞RNA測(cè)序(scRNA-seq)分析表明,共鑒定出25個(gè)細(xì)胞簇,包括上皮細(xì)胞、成纖維細(xì)胞、內(nèi)皮細(xì)胞和免疫細(xì)胞等。OA顯著影響了許多細(xì)胞亞型的比例,如上皮細(xì)胞中的BSL1、HS1和LP3比例增加,HS2、LP1和LP4比例下降;內(nèi)皮細(xì)胞中,血管生成尖端細(xì)胞比例下降,靜脈內(nèi)皮細(xì)胞比例增加。

 

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圖4. 單細(xì)胞景觀(guān)

 

 

5. OA調(diào)節(jié)組織源性乳腺微結(jié)構(gòu)中的基因表達(dá)

 

OA處理調(diào)節(jié)了每個(gè)細(xì)胞亞型內(nèi)的基因表達(dá),導(dǎo)致譜系標(biāo)記物下調(diào),細(xì)胞狀態(tài)發(fā)生改變。CellChat分析表明,OA處理后,細(xì)胞間通訊的總體相互作用發(fā)生變化,分泌信號(hào)增加,細(xì)胞外基質(zhì)-細(xì)胞相互作用和細(xì)胞-細(xì)胞粘附減少。

 

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圖5. OA調(diào)節(jié)組織源性乳腺微結(jié)構(gòu)中的基因表達(dá)

 

 

6. Compass算法預(yù)測(cè)BSL1、LP3和HS1細(xì)胞群中受OA影響的代謝系統(tǒng)

 

Compass算法預(yù)測(cè),OA暴露后,BSL1、LP3和HS1細(xì)胞對(duì)甘氨酸、絲氨酸、丙氨酸和蘇氨酸代謝的依賴(lài)性增加,且OA增強(qiáng)了這些細(xì)胞亞型中絲氨酸代謝關(guān)鍵酶的活性,同時(shí)突出了這些細(xì)胞亞型在ROS解毒和GSH代謝方面的差異,還預(yù)測(cè)OA會(huì)增加這三種細(xì)胞亞型中酪氨酸代謝的代謝活性。

 

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圖6. OA影響的代謝系統(tǒng)

 

 

7. 小結(jié)

 

本研究圍繞中鏈脂肪酸辛酸(OA)對(duì)非轉(zhuǎn)化乳腺細(xì)胞的作用機(jī)制展開(kāi)。U-13C標(biāo)記葡萄糖示蹤技術(shù)結(jié)果表明,OA可使非轉(zhuǎn)化乳腺細(xì)胞代謝模式發(fā)生重塑,顯著抑制糖酵解,促進(jìn)代謝向絲氨酸、一碳、甘氨酸及甲硫氨酸途徑轉(zhuǎn)移,改變細(xì)胞內(nèi)重要代謝產(chǎn)物的生成水平。同時(shí),OA在表觀(guān)遺傳層面發(fā)揮作用,通過(guò)影響S-腺苷甲硫氨酸(SAM)等物質(zhì),參與DNA甲基化與組蛋白甲基化過(guò)程,誘導(dǎo)細(xì)胞呈現(xiàn)神經(jīng)樣轉(zhuǎn)錄程序,還引發(fā)活性氧(ROS)積累致DNA損傷。該研究為雌激素受體陰性乳腺癌的發(fā)病機(jī)制研究提供了新視角與理論依據(jù)。

 

參考文獻(xiàn)

 

Eduardo MB, et al. A metabolic shift to the serine pathway induced by lipids fosters epigenetic reprogramming in nontransformed breast cells. Sci Adv. 2025.

 

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麥特繪譜開(kāi)創(chuàng)性地搭建了醫(yī)學(xué)領(lǐng)域高端代謝組學(xué)技術(shù)平臺(tái),覆蓋了非靶向-全定量-代謝流等全方位的高端醫(yī)學(xué)代謝組解決方案,同時(shí)全面布局微生物組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)等多組學(xué)技術(shù)服務(wù),已成為全球多組學(xué)研究者的優(yōu)選合作伙伴。麥特繪譜擁有Q1000,Q500、Q300、Q200和膽汁酸、短鏈脂肪酸、色氨酸及咧咪衍生物、多胺和TMAO類(lèi)等各類(lèi)小分子代謝物、非靶向代謝組學(xué)和同位素示蹤代謝流技術(shù)等共40+系列檢測(cè)方法;已為數(shù)百家三甲醫(yī)院、科研院所和企業(yè)提供多組學(xué)解決方案,協(xié)助客戶(hù)與合作伙伴發(fā)表SCI文章600+篇,累計(jì)影響因子6000+,平均IF>10,包括Cell, Science, Nature, Cancer Cell,  Signal Trans-duction and Targeted Therapy, Nature Biotechnology, Cell Metabolism等權(quán)威期刊。

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