在人類基因組計(jì)劃完成之后,人類基因組絕大多數(shù)基因及其功能,都有待蛋白層面予以揭示。蛋白質(zhì)處于中心法則的下游,是生命活動的最終執(zhí)行者,其在生命及疾病發(fā)生/發(fā)展過程中的意義不言而喻,如同人類基因圖譜的重大意義,對人類蛋白質(zhì)組進(jìn)行系統(tǒng)性研究勢在必行。因此,2003年,繼人類基因組計(jì)劃后的一項(xiàng)針對基因編碼產(chǎn)物蛋白質(zhì)進(jìn)行系統(tǒng)而深入研究的國際性科技工程——人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃(HPP)宣布正式啟動。首批行動計(jì)劃包括我國科學(xué)家牽頭的“人類肝臟蛋白質(zhì)組計(jì)劃”和美國科學(xué)家牽頭的“人血漿蛋白質(zhì)組計(jì)劃”。2014年,中國人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃(CNHPP)也正式啟動。
人體蛋白質(zhì)種類眾多,存在著來源廣、組成復(fù)雜等特點(diǎn)。然而目前基于質(zhì)譜檢測的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)更傾向于高豐度物質(zhì)的檢測,容易丟失了很多低豐度蛋白與疾病關(guān)系的重要信息。新一代的Olink蛋白質(zhì)組學(xué)平臺應(yīng)運(yùn)而生,彌補(bǔ)了質(zhì)譜在血液樣本檢測中的缺陷,為血液蛋白質(zhì)標(biāo)志物的發(fā)展提供了新的檢測方向。Olink平臺基于鄰位延伸分析技術(shù)(PEA),既覆蓋了廣泛的動態(tài)范圍,橫跨10個(gè)log,覆蓋了高、中、低豐度蛋白;又有基因組學(xué)的高通量,保留了蛋白/抗原識別的特異性,檢測蛋白豐度最低可以達(dá)到fg/ml,可對疾病早篩相關(guān)的蛋白生物標(biāo)志物進(jìn)行多重、靈敏、高通量的檢測。Olink平臺自上市以來備受矚目,先后獲得人類血漿蛋白質(zhì)組官方推薦、入選“登月計(jì)劃”腫瘤免疫生物標(biāo)志物臨床試驗(yàn)技術(shù)指南方法學(xué)第一梯隊(duì)并獲得蛋白質(zhì)組學(xué)研究的推動性技術(shù)等諸多殊榮。吉?jiǎng)P基因可提供“Olink蛋白質(zhì)組學(xué)+機(jī)器學(xué)習(xí)算法”打包產(chǎn)品,助力臨床標(biāo)志物發(fā)現(xiàn),助力臨床疾病的一級二級預(yù)防以及藥物開發(fā),更多詳情請咨詢當(dāng)?shù)劁N售工程師!接下來跟小編一起看看Olink技術(shù)特點(diǎn)吧。

Olink平臺基于Proximity ExtensionAssay (PEA) 鄰位延伸分析技術(shù)原理,抗體上帶有探針,兩條探針末端含有配對堿基,在延伸酶的作用下形成雙鏈模板,利用qPCR或者NGS對探針進(jìn)行定量檢測,從而確定蛋白含量。

二、Olink平臺技術(shù)優(yōu)勢
1. 微量樣本&高通量:1ul血漿中可以同時(shí)檢測48—384種蛋白標(biāo)志物,6.4ul血漿中可以檢測3000多種蛋白標(biāo)志物,并即將拓展至4500 biomarkers;
2. 超靈敏:檢測靈敏度低至fg/ml水平,可以在組學(xué)水平上檢測疾病相關(guān)的成百上千種低豐度蛋白(尤其是血漿、血清樣本中的低豐度biomarkers);
3. 靶向性:所有檢測蛋白,均為生物標(biāo)志物(來自于全球權(quán)威機(jī)構(gòu)和專家);
4. 寬動態(tài)范圍:整個(gè)Panel橫跨10個(gè)log值,可以同時(shí)兼顧不同豐度的蛋白biomarkers;
5. 高重復(fù)性:使用成熟的qPCR和NGS技術(shù)作為檢測手段,重復(fù)性好,數(shù)據(jù)質(zhì)量高,適合大數(shù)據(jù)分析要求和臨床轉(zhuǎn)化應(yīng)用的重復(fù)性要求;
6. 高特異:基于PEA**、質(zhì)控設(shè)計(jì)和充分驗(yàn)證,特異性強(qiáng)。
三、 Olink 產(chǎn)品系列
Olink產(chǎn)品圍繞以疾病或生物學(xué)設(shè)計(jì),分為target系列和Explore系列。如果需要定制服務(wù),可選擇Focus平臺。相關(guān)產(chǎn)品信息如下:

科研領(lǐng)域目前已有超過500篇文獻(xiàn)采用了Olink技術(shù),涉及心血管、腫瘤、炎癥與免疫、神經(jīng)、代謝等多個(gè)領(lǐng)域。部分典型案例分享如下:
案例一
EHJ:基于Olink的大規(guī)模血漿蛋白質(zhì)組學(xué)建立的模型優(yōu)于臨床風(fēng)險(xiǎn)模型,可改善心血管風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測
技術(shù):Olink 心血管II,心血管III和心臟代謝,共計(jì)panel
在1570名已確定動脈疾病的患者的兩個(gè)隊(duì)列中使用靶向的Olink蛋白質(zhì)組學(xué),研究顯示一組50種蛋白質(zhì)在預(yù)測復(fù)發(fā)性ASCVD事件方面優(yōu)于臨床風(fēng)險(xiǎn)模型。在派生和驗(yàn)證隊(duì)列中,蛋白質(zhì)組學(xué)模型在區(qū)分方面表現(xiàn)更好,同樣校準(zhǔn)良好,優(yōu)于臨床風(fēng)險(xiǎn)模型。總的來說,這些數(shù)據(jù)證實(shí)了在二級預(yù)防環(huán)境中蛋白質(zhì)組支持的風(fēng)險(xiǎn)分層的潛力。在低CRP患者中發(fā)現(xiàn)了中性粒細(xì)胞相關(guān)的途徑,這意味著在傳統(tǒng)的NLRP3途徑之外還存在著殘余的炎癥風(fēng)險(xiǎn)。

案例二
香港科技大學(xué)副校長葉玉如院士基于Olink的大規(guī)模血漿蛋白質(zhì)組學(xué)發(fā)現(xiàn)并確定了用于阿爾茨海默癥篩查和分期的高性能生物標(biāo)志物組合

180名≥60歲的香港市民為發(fā)現(xiàn)隊(duì)列(106位AD患者和74位健康對照)和97名≥60歲的香港市民作為驗(yàn)證隊(duì)列(36位AD患者和61位健康對照)。該研究使用Olink 技術(shù)對篩選和驗(yàn)證AD隊(duì)列樣本中的1160種血漿蛋白進(jìn)行了分析(是迄今為止最全面的AD血漿蛋白質(zhì)組研究),從而系統(tǒng)地研究了AD的血漿蛋白質(zhì)組。研究者鑒定出19種與AD相關(guān)的血漿核心蛋白標(biāo)志物,并據(jù)此開發(fā)了生物標(biāo)志物模型,可準(zhǔn)確對AD進(jìn)行鑒定并確定AD患者的疾病嚴(yán)重程度。與現(xiàn)有的用于AD分類的血液生物標(biāo)志物(如血漿ATN生物標(biāo)志物,血漿p-tau181和p-tau217等)相比,該研究鑒定出的19蛋白標(biāo)志物組合準(zhǔn)確性更高,AUC可達(dá) 0.98,且其中7個(gè)蛋白與AD發(fā)展階段相關(guān),可用于AD疾病分期。
案例三
Lancet Respir Med(IF =30.7):基于Olink的大規(guī)模血漿蛋白質(zhì)組學(xué)發(fā)現(xiàn)能夠預(yù)測進(jìn)行性間質(zhì)性肺纖維化進(jìn)展的生物標(biāo)志物組合
技術(shù):Olink,Explore 384 Inflammation panel
通過對加州大學(xué)收集的發(fā)現(xiàn)隊(duì)列384例結(jié)締組織疾病相關(guān)ILD、慢性過敏肺炎、或不可分類ILD患者的血漿樣本在和德克薩斯大學(xué)收集的驗(yàn)證隊(duì)列204例患者的血漿樣本進(jìn)行Olink靶向蛋白質(zhì)組分析。研究團(tuán)隊(duì)同時(shí)借助機(jī)器學(xué)習(xí)算法(Machine Learning)最終發(fā)現(xiàn)了能夠預(yù)測進(jìn)行性間質(zhì)性肺纖維化進(jìn)展的蛋白質(zhì)組特征(Proteomic Signature),該蛋白質(zhì)組特征為17個(gè)基于Olink PEA技術(shù)的蛋白標(biāo)志物組合,顯示了基于蛋白質(zhì)組的血漿和血清生物標(biāo)志物在預(yù)測ILD患者進(jìn)展風(fēng)險(xiǎn)方面的巨大潛力。

吉?jiǎng)P基因憑借多年在靶標(biāo)篩選及驗(yàn)證服務(wù)領(lǐng)域的技術(shù)積累,建立的標(biāo)準(zhǔn)化 、工程化 、系統(tǒng)化的GRP平臺,為中國研究型醫(yī)生提供科研服務(wù),加快科研成果轉(zhuǎn)化。其中,多組學(xué)平臺包含蛋白質(zhì)組學(xué)平臺和單細(xì)胞測序平臺:
·蛋白質(zhì)組學(xué)平臺擁有多臺timsTOF Pro、Exploris 480高精度質(zhì)譜儀,專業(yè)的Spectronaut Plusar、Mascot等分析軟件,提供專業(yè)的4D、DIA、TMT、PRM、磷酸化修飾組和Olink蛋白質(zhì)組等檢測服務(wù),強(qiáng)大的機(jī)器學(xué)習(xí)算法、IPA分析、蛋白基因組分析服務(wù),系統(tǒng)的生物標(biāo)志物、分子分型、藥物靶點(diǎn)、基因功能研究等解決方案,真正讓廣大研究型醫(yī)生的科研工作更省心、更省力、更高效;
·單細(xì)胞測序擁有10x和BD兩個(gè)平臺,提供單細(xì)胞RNA-seq、單細(xì)胞核測序、單細(xì)胞混樣RNA-seq、單細(xì)胞(RNA+ATAC)、空間轉(zhuǎn)錄組測序等服務(wù)。
