在 DNA - 蛋白質(zhì)互作研究的 “江湖” 里,有一款超牛的技術(shù) ——Multi-CUT&Tag !它憑借獨(dú)特的優(yōu)勢(shì),迅速成為科研 er 們探索生命奧秘的得力助手,今天就帶大家一探究竟!
技術(shù)原理超硬核
傳統(tǒng)研究 DNA - 蛋白質(zhì)互作的方法或多或少存在一些局限,而 Multi-CUT&Tag 技術(shù)則另辟蹊徑!它巧妙地利用 Tn5 轉(zhuǎn)座酶和特異性抗體??贵w與目標(biāo)蛋白質(zhì)結(jié)合后,引導(dǎo) Tn5 轉(zhuǎn)座酶精準(zhǔn)定位到 DNA - 蛋白質(zhì)互作位點(diǎn),然后 Tn5 轉(zhuǎn)座酶對(duì) DNA 進(jìn)行切割并添加測(cè)序接頭,直接高效地捕獲互作信息。相比于傳統(tǒng)的 ChIP-seq,Multi-CUT&Tag 無需超聲破碎,大大減少了樣本損耗,還能降低背景信號(hào)干擾,讓研究結(jié)果更加準(zhǔn)確可靠!
應(yīng)用場(chǎng)景超豐富
01
神經(jīng)科學(xué)領(lǐng)域
2022 年 12 月,Gonçalo Castelo - Branco 課題組在《Nature Biotechnology》上發(fā)表研究 ,通過 anti - mouse Tn5 和 anti - rabbit Tn5,針對(duì)鼠抗和兔抗在鼠腦中實(shí)現(xiàn)特異性的 Multi - CUT&Tag 技術(shù)應(yīng)用。此研究非常詳細(xì)地剖析大腦中的祖細(xì)胞如何特化成少突膠質(zhì)細(xì)胞,為我們?cè)诩膊”尘跋氯绾未碳ど偻荒z質(zhì)細(xì)胞群的恢復(fù)提供線索,幫助我們深入了解大腦神經(jīng)細(xì)胞的分化機(jī)制。
02
免疫學(xué)研究
美國(guó)紐約基因組中心 Ivan Raimondi 團(tuán)隊(duì)于 2022 年 12 月在《Nature Biotechnology》發(fā)表成果 ,在不同免疫細(xì)胞,如 PBMCs 和 BMMCs 中,使用納米抗體偶聯(lián)的 Tn5 酶實(shí)現(xiàn)了單細(xì)胞多靶標(biāo)的 CUT&Tag 研究。不僅獲得了高分辨率的多模態(tài)圖,還擴(kuò)展了技術(shù),能同時(shí)分析細(xì)胞表面蛋白表達(dá)和多模態(tài)染色質(zhì)狀態(tài),極大推動(dòng)了免疫系統(tǒng)細(xì)胞的研究進(jìn)展。03
發(fā)育生物學(xué)
在研究細(xì)胞分化和發(fā)育過程中,Multi - CUT&Tag 可同時(shí)檢測(cè)多種染色質(zhì)特征的變化,助力了解基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)在單細(xì)胞水平如何協(xié)調(diào)細(xì)胞發(fā)育命運(yùn)。相關(guān)研究成果可參考發(fā)表于《Nature Protocols》的論文 “Multi - CUT&Tag to simultaneously profile multiple chromatin proteins” 。該研究展示了 Multi - CUT&Tag 在小鼠胚胎干細(xì)胞和滋養(yǎng)層干細(xì)胞中的應(yīng)用,為探究胚胎發(fā)育早期細(xì)胞分化機(jī)制提供了關(guān)鍵數(shù)據(jù) 。
產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)超給力
01
多靶標(biāo)同時(shí)檢測(cè)
Multi-CUT&Tag 最大的亮點(diǎn)之一就是能夠同時(shí)檢測(cè)多個(gè)蛋白質(zhì)與 DNA 的互作。一次實(shí)驗(yàn)就能獲取多種蛋白質(zhì)的結(jié)合信息,不僅節(jié)省了大量的樣本、時(shí)間和實(shí)驗(yàn)成本,還能更全面地解析復(fù)雜的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),讓研究效率直線飆升!
02
超高靈敏度與特異性
得益于獨(dú)特的酶切和標(biāo)記方式,即使是微量樣本,Multi-CUT&Tag 也能精準(zhǔn)捕獲 DNA - 蛋白質(zhì)互作信號(hào)。并且,它對(duì)目標(biāo)位點(diǎn)的識(shí)別特異性極高,能夠有效區(qū)分特異性結(jié)合和非特異性結(jié)合,確保研究數(shù)據(jù)真實(shí)有效,為科研成果保駕護(hù)航。
03
操作簡(jiǎn)便易上手
翌圣全球首發(fā)的 Multi-CUT&Tag 試劑盒配套完善(貨號(hào)12592ES),包含了實(shí)驗(yàn)所需的各種關(guān)鍵試劑??蒲腥藛T只需按照標(biāo)準(zhǔn)化的操作流程,準(zhǔn)備好樣本和簡(jiǎn)單的實(shí)驗(yàn)設(shè)備,就能輕松開展實(shí)驗(yàn)。即使是實(shí)驗(yàn)新手,也能快速掌握,大大降低了技術(shù)門檻。
表1.翌圣Multi-CUT&Tag試劑盒組分原理
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組分名稱 |
組分原理 |
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BOX-I |
ConA Beads |
ConA beads為包被了伴刀豆球蛋白A的磁珠,結(jié)合細(xì)胞膜糖蛋白,從而捕獲細(xì)胞 |
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DNA Extract Beads |
提取DNA的磁珠 |
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DNA Selection Beads |
DNA純化及分選磁珠 |
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BOX-II |
10 x Binding Buffer |
細(xì)胞捕獲緩沖液 |
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10 x Wash Buffer |
細(xì)胞洗滌緩沖液 |
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5% Digitonin |
增加細(xì)胞膜通透性,在細(xì)胞表明打孔,便于后續(xù)轉(zhuǎn)座切割 |
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50 x PB Buffer |
抗體結(jié)合緩沖液 |
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10 x Dig-300 Buffer |
轉(zhuǎn)座酶結(jié)合緩沖液 |
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Anti-mouse Tn5 |
偶聯(lián)抗鼠二抗的Tn5復(fù)合體 |
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Anti-rabbit Tn5 |
偶聯(lián)抗兔二抗的Tn5復(fù)合體 |
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33 Activating Buffer |
含鎂離子,激活Tn5轉(zhuǎn)座活性 |
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15 x Terminate Solution |
終止轉(zhuǎn)座酶活性,同時(shí)裂解細(xì)胞,釋放DNA |
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30 x Proteinase K |
消化蛋白質(zhì),釋放蛋白質(zhì)結(jié)合的DNA |
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DNA Spike-in Mix (5 ng/μL) |
來源于Ecoli.的三段序列,用于后續(xù)分析的標(biāo)準(zhǔn)化 |
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2xHiFi Amplification Mix |
文庫擴(kuò)增酶 |
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i5 Universal Primer |
文庫接頭 |
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i7 Index Primer (T701) |
文庫接頭,含測(cè)序index |
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這么寶藏的 DNA - 蛋白質(zhì)互作研究利器,真的太香了!無論是基礎(chǔ)科研,還是應(yīng)用研究,Multi-CUT&Tag 都能大顯身手。還在為 DNA - 蛋白質(zhì)互作研究發(fā)愁的寶子們,趕緊碼住,說不定下一個(gè)科研突破就靠它啦!
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多靶標(biāo)CUT&Tag試劑盒 |
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