MaxUpII DNA Library Prep Kit for Illumina?
——建庫試劑盒中的全能王
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1、產(chǎn)品概述
Hieff NGS??MaxUpII DNA Library Prep Kit for Illumina?，可用于NGS測序中DNA樣本文庫構(gòu)建，采用高質(zhì)量的酶學(xué)組成，改進型接頭連接技術(shù)，以及具有強擴增效率的高保真酶，顯著提高文庫轉(zhuǎn)化率與擴增效率，Input DNA范圍為500 pg-1 μg，適用包含cfDNA、FFPE在內(nèi)的所有樣本進行文庫構(gòu)建，產(chǎn)品可以應(yīng)用于全基因組測序、靶向捕獲測序、Chip-seq等測序方法中。
2、產(chǎn)品特點
≥?適用樣本類型廣：包含cfDNA、FFPE在內(nèi)的所有樣本均能獲得優(yōu)異文庫和測序質(zhì)量
≥?應(yīng)用范圍廣：產(chǎn)品可應(yīng)用于全基因組測序、靶向捕獲測序、Chip-seq等等
≥?高品質(zhì)酶學(xué)組成：業(yè)界**的接頭連接效率，高達(dá)60%、超高保真性和超強擴增效率
≥?品質(zhì)穩(wěn)定：嚴(yán)格的批次性能與穩(wěn)定性質(zhì)控
3、操作流程
精簡的操作步驟，2-2.5小時快速建庫
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4、產(chǎn)品優(yōu)勢
1）文庫轉(zhuǎn)化效率高達(dá)60%
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圖1??Agilent ?2100?檢測350bp平末端DNA片段單端和雙端連接產(chǎn)物峰
0：350bpDNA片段峰、1：單端接頭連接產(chǎn)物峰、2：雙端接頭連接產(chǎn)物峰。測試基于各公司的標(biāo)準(zhǔn)?protocol進行。
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圖2?接頭連接效率百分比（%）。
對圖1峰面積進行積分后的定量結(jié)果顯示Hieff NGS? MaxUp II Kit?的雙端連接效率可達(dá)60%
2）擴增效率高，兼容不同GC含量樣本
使用具有強擴增效率的Super CanaceTM High-Fidelity Mix用于文庫擴增，效率更高。
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產(chǎn)品名稱 |
GC 38% (ng) |
GC 50% (ng) |
GC 70% (ng) |
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Super Canace? High-Fidelity Mix |
25.6 |
18 |
17.1 |
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K*-HiFi mix |
15.8 |
16.7 |
21.1 |
1 ng GC含量分別為38%、50%、70%的400 bp DNA片段為起始樣本，12 cycles擴增。
3）文庫產(chǎn)量高
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樣本 |
100 ng FFPE |
5 ng cfDNA |
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|
7 cycles (ng) |
10 cycles (ng) |
9 cycles (ng) |
12 cycles?(ng) |
|
|
MaxUP II |
400 |
2000 |
120 |
1200 |
|
K*?品牌 |
150 |
1100 |
100 |
1080 |
以FFPE和cfDNA為起始樣本建庫，相對同類型試劑盒品牌?K*，在相同擴增循環(huán)數(shù)下，獲得更多文庫產(chǎn)量。
4）數(shù)據(jù)無偏好性
在不同GC含量樣本中，使用Hieff NGS??MaxUP II Kit均能獲得堿基質(zhì)量好且覆蓋度均一的測序數(shù)據(jù)。
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樣本 |
Mapped Reads (%) |
Coverage (%) |
||||
|
Average |
5× |
10× |
15× |
20× |
||
|
蠟狀芽孢桿菌（GC 34%） |
93.8 |
99.644 |
99.643 |
99.641 |
99.639 |
99.638 |
|
大腸桿菌（GC 51%） |
92.7 |
93.057 |
92.782 |
92.687 |
92.625 |
92.579 |
|
嗜鹽桿菌（GC 65%） |
94.2 |
99.598 |
99.028 |
98.391 |
97.885 |
97.419 |
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圖3不同GC含量樣本測序偏好性圖譜
5、客戶反饋
5.1建庫產(chǎn)量高
1）杭州某生物公司邁*
洗相同條件下對比實驗，脫體積32 μL，對比文庫產(chǎn)量，翊圣MaxUpII文庫產(chǎn)量比K*文庫產(chǎn)量更高
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? |
MaxUp II |
K* Hyper |
||||
|
Input DNA |
50 ng |
25 ng |
10 ng |
50 ng |
25 ng |
10 ng |
|
循環(huán)數(shù) （cycles） |
7 |
9 |
13 |
7 |
9 |
13 |
|
文庫濃度?(ng/μL) |
15.4 |
23.8 |
58.2 |
8.76 |
13.5 |
52.4 |
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