
鄭州大學(xué)袁寶銀、劉康棟老師團隊在Analytical Chemistry(IF:8.008)上發(fā)表題為“DNA Aptamer Selected against Esophageal Squamous Cell Carcinoma for Tissue Imaging and Targeted Therapy with Integrin β1 as a Molecular Target”的文章。在該研究中,研究團隊通過Cell-SELEX技術(shù)篩選出可以特異性識別ESCC細胞系的核酸適配體,且通過組織成像證明核酸適配體 A2可識別病人食管鱗癌組織,該團隊還通過Pull-down、質(zhì)譜實驗(由吉凱基因提供技術(shù)服務(wù))及siRNA干擾技術(shù)鑒定該aptamer結(jié)合的靶標為整合素β1。此外,該團隊通過構(gòu)建A2-NA納米結(jié)構(gòu)負載化療藥物阿霉素(Dox),實現(xiàn)了體外和體內(nèi)靶腫瘤細胞的特異性殺傷。

研究結(jié)果
1.?利用Cell-SELEX技術(shù)篩選得到與靶細胞高親和力結(jié)合的核酸適配體
A2、A3、A4核酸適配體與靶細胞結(jié)合的解離常數(shù)均為納摩爾級別,三條核酸適配體均能夠結(jié)合在靶細胞的細胞膜上,核酸適配體A2能夠特異性識別病人食管鱗癌組織。


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【補充知識】:
SELEX技術(shù)即指數(shù)富集的配體系統(tǒng)進化技術(shù)(Systematic Evolution of Ligands by Exponential Enrichment,SELEX)。利用該技術(shù)可以從隨機單鏈核酸序列庫中篩選出特異性與靶物質(zhì)高度親和的核酸適體(Aptamer)。Cell-SELEX技術(shù)是在SELEX技術(shù)基礎(chǔ)上,獲取能與特定靶細胞結(jié)合的適配體的方法。
2.?核酸適配體A2與靶細胞結(jié)合的分子靶標為整合素β1(Integrin β1)
利用流式細胞術(shù)初步驗證出核酸適配體A2與靶細胞結(jié)合的靶標為蛋白質(zhì),利用Pull-down實驗及質(zhì)譜技術(shù)(由吉凱基因提供技術(shù)服務(wù))、基因敲低實驗進一步驗證出A2結(jié)合靶標為Integrin β1。此外,通過分子對接技術(shù)準確地預(yù)測出A2與Integrin β1的具體結(jié)合位點。


3.?設(shè)計A2連接的DNA納米結(jié)構(gòu),實現(xiàn)化療藥物Dox的靶向遞送
利用HCR(雜交鏈式反應(yīng))原理,設(shè)計出A2連接的DNA納米結(jié)構(gòu),該納米結(jié)構(gòu)能夠負載自身濃度100倍的Dox,并將其靶向遞送至靶腫瘤細胞中,降低化療藥物的毒副作用。


研究結(jié)論
(1)通過Cell-SELEX,篩選得到與低分化食管鱗癌KYSE410細胞高親和力高特異性結(jié)合的核酸適配體,其中核酸適配體A2能夠特異性成像患者食管鱗癌組織,有望作為一種特異性成像探針應(yīng)用于食管鱗癌的診斷;
(2)經(jīng)鑒定核酸適配體A2與靶細胞結(jié)合的主靶標為整合素β1,具備作為食管鱗癌標志物和治療靶點的潛力;
(3)以核酸適配體A2為靶向分子設(shè)計并構(gòu)建了A2-NA納米結(jié)構(gòu),該納米結(jié)構(gòu)能夠負載高濃度的Dox并將其特異性遞送至靶細胞,實現(xiàn)腫瘤的靶向治療。
吉凱助力
本研究使用質(zhì)譜檢測核酸適配體A2結(jié)合的目標蛋白,由吉凱基因提供技術(shù)服務(wù)。

作者介紹

吉凱基因憑借多年在靶標篩選及驗證服務(wù)領(lǐng)域的技術(shù)積累,建立的標準化 、工程化 、系統(tǒng)化的GRP平臺,為中國研究型醫(yī)生提供科研服務(wù),加快科研成果轉(zhuǎn)化。其中,多組學(xué)平臺包含蛋白質(zhì)組學(xué)平臺和高通量測序平臺:
·蛋白質(zhì)組學(xué)平臺擁有多臺timsTOF Pro、Exploris 480高精度質(zhì)譜儀,專業(yè)的Spectronaut Plusar、Mascot等分析軟件,提供專業(yè)的4D、DIA、TMT、PRM、磷酸化修飾組、olink蛋白質(zhì)組等檢測服務(wù),強大的機器學(xué)習(xí)算法、IPA分析、蛋白基因組分析服務(wù),系統(tǒng)的生物標志物、分子分型、藥物靶點、基因功能研究等解決方案,真正讓廣大研究型醫(yī)生的科研工作更省心、更省力、更高效;
·高通量測序平臺分為常規(guī)測序服務(wù)和單細胞測序服務(wù):單細胞測序擁有10x和BD兩個平臺,提供單細胞RNA-seq、單細胞核測序、單細胞混樣RNA-seq、單細胞TCR/BCR、單細胞(RNA+ATAC)、空間轉(zhuǎn)錄組測序等服務(wù);常規(guī)測序服務(wù)提供meRIP-seq(m6A/m1A/m7G/m5C 等RNA甲基化修飾測序)、acRIP-seq(ac4C RNA乙酰化修飾測序)、ATAC-seq、Ribo-seq(翻譯組測序) 、mRNA/miRNA/LncRNA/circRNA-seq、全轉(zhuǎn)錄組測序(兩文庫/三文庫)、外泌體miRNA/LncRNA-seq、WGS/WES、WGBS、RRBS、BSAS等服務(wù)。
