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類器官指南丨手把手教你培養(yǎng)完美腫瘤類器官!

作者:杭州環(huán)特生物科技股份有限公司 暫無(wú)發(fā)布時(shí)間 (訪問(wèn)量:40410)

編者按

當(dāng)前,隨著類器官技術(shù)的發(fā)展,腫瘤類器官已被提議作為精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的模型系統(tǒng)。由于腫瘤類器官的個(gè)性化特征,其在臨床前研究中也具有巨大的潛力。

近期,一篇重要綜述《Organoids: opportunities and challenges of cancer therapy》中,一張圖簡(jiǎn)明扼要地總結(jié)了不同腫瘤類器官培養(yǎng)方法的關(guān)鍵。從腫瘤組織中通過(guò)機(jī)械或酶解獲得腫瘤細(xì)胞,用幾乎相同的基礎(chǔ)培養(yǎng)基進(jìn)行培養(yǎng),而細(xì)胞因子是腫瘤類器官培養(yǎng)成功的決定因素之一。今天,我們重點(diǎn)介紹幾種重要的腫瘤類器官培養(yǎng)基組分及方案——

01、胃癌類器官培養(yǎng)

通過(guò)構(gòu)建源自胃癌患者的類器官(PDO),能夠直接對(duì)臨床樣本進(jìn)行研究。Vlachogiannis 等人為了成功培養(yǎng)胃癌類器官,除了使用 ADMEM/F12 培養(yǎng)基和基底膜基質(zhì)外,還添加了 EGF、Noggin、R-Spondin 1、FGF-10 等細(xì)胞因子。

胃癌患者的類器官(PDO)培養(yǎng)步驟:

如下實(shí)驗(yàn)流程和數(shù)據(jù)均引用Vlachogiannis等人發(fā)表的文章(doi: 10.1126/science.aao2774),供參考。

1. 配置 PDO 培養(yǎng)基:改良的 DMEM/F12 基礎(chǔ)培養(yǎng)基,添加 1x B27 additive、1x N2 additive、0.01% BSA、2 mM L-Glutamine、100 units/ml 青霉素-鏈霉素,以及如下表的細(xì)胞因子或其他添加物:

*HGF 僅用于膽管癌類器官。

2. 樣本收集:通過(guò)圖像引導(dǎo)或內(nèi)窺鏡手術(shù)收集活檢樣品。收獲后,樣本置于冷 PBS 中,并在冰上運(yùn)輸?shù)綄?shí)驗(yàn)室,20 分鐘~2 小時(shí)內(nèi)將組織切片切碎。

3. 樣本處理:組織切碎后,加入 5 ml 5 mM  的 PBS/EDTA,室溫靜置 15 分鐘。用含有 2x TrypLe 的 1 mM PBS/EDTA 5 ml 在 37 ℃ 消化 1 小時(shí)。施加機(jī)械力(如吹液)以促進(jìn)消化。

4. 接種細(xì)胞:用改良的 DMEM/F12 培養(yǎng)基收集分離的細(xì)胞,并在 4 ℃,1,200 轉(zhuǎn)/分離心 5 分鐘,使細(xì)胞成球狀,用 120 µl GFR 基質(zhì)膠重懸,接種到 24 孔或 48 孔的平底細(xì)胞培養(yǎng)板中。

5. 將基質(zhì)在 37 ℃、5% CO2 的細(xì)胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng) 20 分鐘,進(jìn)行固化。然后添加 500 µl 配置好的 PDO 培養(yǎng)基,要完全覆蓋培養(yǎng)孔。

6. 每?jī)商鞊Q一次培養(yǎng)基。

腫瘤類器官培養(yǎng)主要步驟

02、肝癌類器官培養(yǎng)

腫瘤類器官的培養(yǎng)非常復(fù)雜,如肝癌類器。原發(fā)性肝細(xì)胞癌主要分為肝細(xì)胞癌(HCC)、膽管細(xì)胞癌(CC)和混合型(CHC)。在肝細(xì)胞癌類器官培養(yǎng)中需要使用地塞米松但是膽管細(xì)胞性肝細(xì)胞癌類器官培養(yǎng)則需加入 R-spondin 1 來(lái)維持細(xì)胞生長(zhǎng)。

Broutier 等人發(fā)現(xiàn)原發(fā)性肝癌(PLC)組織培養(yǎng)獲得的類器官可以在體外真實(shí)地模擬人類 PLC 的遺傳復(fù)雜性。構(gòu)建的類器官包含 PLC 常見(jiàn)的三種亞型:HCC、CC 和 CHC,再現(xiàn)親本腫瘤的組織結(jié)構(gòu)和表達(dá)譜,同時(shí)保留患者及亞型之間的差異性,有利于肝癌相關(guān)基因和潛在生物標(biāo)志物的鑒定。

肝癌類器官分類培養(yǎng)基:

如下實(shí)驗(yàn)流程和數(shù)據(jù)均引用 Broutier 等人發(fā)表的文章(doi: 10.1038/nm.4438),供參考。

1. 基礎(chǔ)培養(yǎng)基:改良的 DMEM/F12 培養(yǎng)基,添加 1% 青霉素-鏈霉素、1% Glutamax、10 mM HEPES 和 1:50 B27 添加劑。

2. 經(jīng)典人肝類器官分離培養(yǎng)基:Wnt 條件培養(yǎng)基、R-Spondin 1 條件培養(yǎng)基和基礎(chǔ)培養(yǎng)基按照 30%、10% 和 70% 的體積比混合,然后加入 1:100 N2 添加劑、1.25 mM n-Acetyl Cysteine、10 mM Nicotinamide、10 nM 重組人 Gastrin I、50 ng/ml 重組人EGF、100 ng/ml 重組人 FGF10、25 ng/ml 重組人  HGF、25 ng/ml Noggin、5 uM A83-01、10 uM Forskolin、10 uM Y27632。

3. 腫瘤細(xì)胞特異性分離培養(yǎng)基:經(jīng)典人肝類器官分離培養(yǎng)基中添加 3 mM 地塞米松。

4. 肝癌類器官培養(yǎng)基:基礎(chǔ)培養(yǎng)基、10% (體積比)R-Spondin 1 條件培養(yǎng)基、1:100 N2 添加劑、1.25 mM n-Acetyl Cysteine、10 mM Nicotinamide、10 nM 重組人 Gastrin I、50 ng/ml 重組人 EGF、100 ng/ml 重組人 FGF10、25 ng/ml 重組人 HGF、5 uM A83-01、10 uM Forskolin。

03、結(jié)直腸癌類器官培養(yǎng) 

患者來(lái)源的腫瘤類器官已成為結(jié)直腸癌臨床前研究的一種出色的模型,原代上皮細(xì)胞可在特定生長(zhǎng)因子的控制下和 3D 細(xì)胞外基質(zhì)(ECM)中成功培養(yǎng)類器官。腸上皮細(xì)胞的自我更新由位于隱窩中的 Lgr5 干細(xì)胞驅(qū)動(dòng)。Wnt 信號(hào)是維持隱窩干細(xì)胞活躍所必需的,Wnt 激動(dòng)劑 R-Spondin 1 是 Lgr5 的配體,誘導(dǎo)隱窩增生。EGF 信號(hào)與腸道增殖有關(guān),Noggin 誘導(dǎo)隱窩數(shù)量的急劇增加。

因此,van de Wetering 等人開(kāi)發(fā)的結(jié)直腸癌類器官培養(yǎng)體系如下:

如下實(shí)驗(yàn)流程和數(shù)據(jù)均引用 van de Wetering 等人發(fā)表的文章(doi: 10.1016/j.cell.2015.03.053),供參考。

1. 基礎(chǔ)培養(yǎng)基:改良的 DMEM/F12 培養(yǎng)基,添加青霉素-鏈霉素、10 mM HEPES 和 Glutamax。

2. 人腸干細(xì)胞培養(yǎng)基:Wnt 條件培養(yǎng)基、R-Spondin 1 條件培養(yǎng)基、Noggin 條件培養(yǎng)基和基礎(chǔ)培養(yǎng)基按照 50%、20%、10% 和 20% 的體積比混合,然后加入 1x B27、1.25 mM n-Acetyl Cysteine、10 mM Nicotinamide、50 ng/ml 人 EGF、10 nM Gastrin、500 nM A83-01、3 uM SB202190、10 nM Prostaglandine E2 和 100 mg/ml Primocin。

3. H&E 染色分析:通過(guò) H&E 染色對(duì)培養(yǎng)后的原代腫瘤細(xì)胞和類器官進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)大多數(shù)類器官的特征是存在一個(gè)或多個(gè)管腔,與原代腫瘤的管狀結(jié)構(gòu)相似(如 P8 和 P19b),沒(méi)有管腔的原代腫瘤會(huì)形成沒(méi)有管腔的緊湊型類器官(P19a)。

腫瘤類器官與原代腫瘤上皮相似

04、乳腺癌類器官培養(yǎng)

乳腺癌類器官的培養(yǎng)基與其他腫瘤的略有不同。Seino 等人在類器官培養(yǎng)基優(yōu)化過(guò)程中發(fā)現(xiàn),Neuregulin 1 與乳腺發(fā)育和腫瘤發(fā)生有關(guān),將其添加到培養(yǎng)基中可維持類器官有效再生和長(zhǎng)期增殖(超過(guò) 20 代)。Wnt-3A 對(duì)類器官培養(yǎng)條件改善不明顯。EGF 對(duì)乳腺癌類器官培養(yǎng)具有雙重作用,高于 5 ng/ml 促進(jìn)細(xì)胞增殖,但會(huì)導(dǎo)致類器官解體,失去自組織功能,低濃度則相反。

Hans Clevers 等構(gòu)建乳腺癌類器官的培養(yǎng)基組分:

如下實(shí)驗(yàn)流程和數(shù)據(jù)均引用 Hans Clevers 等人發(fā)表的文章( doi 10.1016/j.cell.2017.11.010 ),供參考。

a:類器官出現(xiàn)解體時(shí)減少或不添加,b:濃度超過(guò) 1 μM 會(huì)降低類器官生成效率

05、肺癌類器官培養(yǎng)

肺癌是全球常見(jiàn)的惡性實(shí)體腫瘤,但是肺癌早期臨床表現(xiàn)不明顯,容易與其他感染混淆而被忽視,一般確診時(shí)已發(fā)展到中晚期,因此,及時(shí)準(zhǔn)確地篩選合適的抗腫瘤藥物對(duì)肺癌患者非常重要。

1 份從原發(fā)性腫瘤組織中衍生出肺腺癌類器官(成功率達(dá)到 80%)的培養(yǎng)基組分:

如下實(shí)驗(yàn)流程和數(shù)據(jù)均引用Zhichao Li等人發(fā)表的文章(10.1016/j.xpro.2020.100239 ),供參考。

試劑詳細(xì)配制指南

關(guān)鍵:所有操作都應(yīng)在二級(jí)生物安全柜中進(jìn)行,以保持無(wú)菌狀態(tài)。

1、200 μg/mL FGF-10 (10,000 X)

a. 取100 μg溶于0.5 mL 無(wú)菌的 PBS(加 0.1% BSA,質(zhì)量/體積)。

b. 每管 5 μL,將溶液分裝到 1.5 mL 的離心管中,可在 -20 ℃ 保持 3 個(gè)月。

2、250 μg/mL FGF-7 (12,500 X)

a. 取 100 μg 溶于 0.4 mL 無(wú)菌的 PBS(加 0.1% BSA,質(zhì)量/體積)。

b. 每管 4 μL,將溶液分裝到 1.5 mL 的離心管中,可在 -20 ℃ 保持 3 個(gè)月。

3、100 μg/mL R-spondin 1 (200 X)

a. 取 250 μg 溶于 2.5 mL 無(wú)菌的 PBS(加 0.1% BSA,質(zhì)量/體積)。

b. 每管 250 μL,將溶液分裝到 1.5 mL 的離心管中,可在 -20 ℃ 保持 1 個(gè)月。

4、100 μg/mL Noggin (1,000 X)

a. 取 100 μg 溶于 1 mL 無(wú)菌的 PBS(加 0.1%  BSA,質(zhì)量/體積)。

b. 每管 50 μL,將溶液分裝到 1.5 mL 的離心管中,可在 -20 ℃ 保持 2 個(gè)月。

5、100 mM Y-27632 dihydrochloride (10,000 X)

a. 取 50 mg 溶于 1.56 mL 的超純水中。

b. 用 0.22 μm 的過(guò)濾器過(guò)濾溶液。

c. 每管 5 μL,將溶液分裝到 1.5 mL 的離心管中,可在 -20 ℃ 保持 6 個(gè)月。

6、500 mM N-Acetylcysteine (400 X)

a. 取 408 mg 溶于超純水,至終體積為 5 mL。

b. 用 0.22 μm 的過(guò)濾器過(guò)濾溶液。

c. 每管 125 μL,將溶液分裝到 1.5 mL 的離心管中,可在 -20 ℃ 保持 3 個(gè)月。

7、2 M Nicotinamide (200 X)

a. 取 6.1 g 溶于 1x PBS,至終體積為 25 mL。

b. 用 0.22 μm 的過(guò)濾器過(guò)濾溶液。

c. 每管 250 μL,將溶液分裝到 1.5 mL 的離心管中,可在 -20 ℃ 保持 3 個(gè)月。

8、30 mM SB202190 單鹽酸鹽水合物 (3,000 X)

a. 取 5 mg 溶于 0.453 mL 的二甲基亞砜(DMSO)中

b. 每管 16.67 μL,將溶液分裝到 1.5 mL 的黑色離心管中,可在 -20 ℃ 保持 3 個(gè)月。

關(guān)鍵:不要用聚偏二氟乙烯(PVDF)膜過(guò)濾含有 DMSO 的溶液,因?yàn)?DMSO 可以溶解這種膜。

關(guān)鍵:使用黑色離心管,防止該溶液受到光照。

建議:過(guò)濾 DMSO 溶液,可以使用 DMSO 安全過(guò)濾器或尼龍膜過(guò)濾器。

9、25 mM A83-01 (50,000 X)

a. 取 5 mg 溶于 0.474 mL 的二甲基亞砜(DMSO)中

b. 每管 2 μL,將溶液分裝到 1.5 mL 的離心管中,可在 -20 ℃ 保持 3 個(gè)月。

10、分裝基質(zhì)膠

a. 取一瓶新的基質(zhì)膠,放于 4 ℃ 冰箱中解凍 8 小時(shí)。

b. 將瓶子倒置幾次,使其充分混合。

c. 取 1.5 mL 的離心管置于冰上冷卻。

d. 將基質(zhì)膠和 1.5 mL 的離心管置于冰上,按實(shí)驗(yàn)所需體積將基質(zhì)膠分裝到 1.5 mL 的離心管中,并在 -20 ℃ 保存。

關(guān)鍵:移液器槍頭應(yīng)在抽吸基質(zhì)膠之前,為了防止基質(zhì)膠黏在槍頭上,應(yīng)通過(guò)多次抽吸和排出冷的無(wú)菌 PBS(含 01.% BSA)進(jìn)行預(yù)濕和預(yù)冷。

注意:基質(zhì)膠是一種重組基膜制劑,富含胞外蛋白,應(yīng)避免反復(fù)凍融。

06、卵巢癌類器官培養(yǎng)

 目前,培養(yǎng)卵巢癌類器官的方法有多種,但成功率較高的是使用基質(zhì)膠和改良 DMEM/F12 基礎(chǔ)培養(yǎng)基的組合,并輔以 EGF、FGF2、FGF10、Noggin、Rspondin1、p38 抑制劑等,可使類器官培養(yǎng)成功率達(dá)到 80%~90%。

Senkowski 等人為了獲得高級(jí)別漿液性卵巢癌(HGSC)類器官的長(zhǎng)期培養(yǎng)方案,對(duì)培養(yǎng)基添加組分進(jìn)行優(yōu)化,獲得兩種成功率更高的配方。并且體外培養(yǎng)的 HGSC 類器官保留了原始腫瘤的基因組和表型特征,其藥物反應(yīng)與臨床結(jié)果具有相關(guān)性。

培養(yǎng)基優(yōu)化主要涉及添加物種類和濃度,尤其是細(xì)胞因子類。

研究人員在改良型 DMEM/F12 培養(yǎng)基中加入 Glutamax、Primocin、N-acetyl-cysteine 和 B27 添加劑構(gòu)成基礎(chǔ)培養(yǎng)基。通過(guò)分析添加劑對(duì) HGSC 原代細(xì)胞短期類器官形成和生長(zhǎng)的影響,使用添加 FGF-10、SB202190 和 A83-10 的基礎(chǔ)培養(yǎng)基(M 0.1)進(jìn)行優(yōu)化。但 M 0.1 培養(yǎng)基能促進(jìn)生長(zhǎng),但在傳代后并不能維持生長(zhǎng)。進(jìn)一步確定 HGSC 類器官培養(yǎng)基配方中加入了 5 mM 煙酰胺,形成培養(yǎng)基 M1。

在培養(yǎng)基 M1 中添加 EGF、Heregulin-β-1、Hydrocortisone 和 Forskolin,形成培養(yǎng)基 M2。對(duì)于不同的樣品,M2 可能具有促進(jìn)或抑制類器官生長(zhǎng)的「矛盾」結(jié)果,因此為了最大限度地提高類器官形成,每個(gè) HGSC 樣品應(yīng)在兩種不同的培養(yǎng)基 M1 和 M2 中平行培養(yǎng)。

類器官形成和長(zhǎng)期培養(yǎng)測(cè)試的主要因子及其影響概述:

腫瘤類器官與原代腫瘤上皮相似

07、其他腫瘤類器官培養(yǎng)

膀胱癌類器官利用 CTOS 培養(yǎng)基進(jìn)行培養(yǎng),主要成分為改良型 DMEM/F12、B27、A83-01,需補(bǔ)充添加 FGF10、FGF7、HER3。

培養(yǎng)前列腺類器官時(shí),一般會(huì)加入 FGF10、FGF2、p38 抑制劑 SB202190、Rho 激酶抑制劑等,而小鼠前列腺癌類器官無(wú)需添加 FGF10、FGF2、PGE2、煙酰胺和 SB202190……

總之,不同腫瘤類器官培養(yǎng)需要添加不同組合的細(xì)胞因子,以促進(jìn)或抑制參與類器官形成的信號(hào)通路,獲得所需的類器官。腫瘤類器官培養(yǎng)作為一種具有廣泛應(yīng)用前景的技術(shù),通過(guò)不斷優(yōu)化和完善培養(yǎng)方法,有望為腫瘤研究和治療提供新的突破。

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