2024年，麥特繪譜代謝組學(xué)產(chǎn)品助力生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域合作伙伴發(fā)表150+篇SCI文章，總計(jì)影響因子1500+，累計(jì)影響因子4500＋分，Cell主刊領(lǐng)跑，Cancer Cell, Signal Transduct Tar緊隨其后，20＋篇IF＞20，50＋篇IF＞10，100＋篇IF＞5，Q300全定量、膽汁酸、代謝流、能量代謝、氨基酸、非靶向代謝組學(xué)等項(xiàng)目文章遍地開花，涵蓋腫瘤與癌癥、消化系統(tǒng)類疾病、代謝性疾病、心血管疾病、免疫疾病等多個(gè)研究領(lǐng)域。
一、2024年度項(xiàng)目文章Top3
二、Q300全定量項(xiàng)目
2024年度Q300全定量項(xiàng)目文章50＋篇，20＋篇IF＞10，總影響因子達(dá)500＋分。
1. A genomic compendium of cultivated human gut fungi characterizes the gut mycobiome and its relevance to common diseases
發(fā)表期刊：Cell，2024IF=45.5
合作項(xiàng)目：Q300全定量檢測(cè)服務(wù)
合作單位：大連醫(yī)科大學(xué)
研究方向：炎癥性腸病
研究簡(jiǎn)介：腸道真菌群落是人類健康的一個(gè)重要組成部分，但其功能和代謝潛力尚未得到充分闡述，這主要是因?yàn)榭色@得的參考基因組有限。該研究發(fā)布了腸道培養(yǎng)真菌（CGF）目錄，包含了從健康個(gè)體糞便中獲得的760個(gè)真菌基因組，涵蓋了206個(gè)物種，跨越48個(gè)家族，其中包括69個(gè)之前未被識(shí)別的物種。探索了CGF物種的功能和代謝特性，并利用這一目錄，通過分析來自中國(guó)和非中國(guó)人群的超過11,000個(gè)糞便宏基因組數(shù)據(jù)，構(gòu)建了腸道真菌組的系統(tǒng)發(fā)育表示。此外，還確定了腸道真菌組組成中與常見疾病顯著相關(guān)的變異，并通過動(dòng)物實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證了真菌特征與炎癥性腸病（IBD）之間的關(guān)聯(lián)，豐富了對(duì)人類腸道真菌組生物多樣性和疾病相關(guān)性的理解。
2. BCAA-producing Clostridium symbiosum promotes colorectal tumorigenesis through the modulation of host cholesterol metabolism
發(fā)表期刊：Cell Host & Microbe，2024IF=20.6
合作項(xiàng)目：Q300全定量檢測(cè)服務(wù)
合作單位：上海仁濟(jì)醫(yī)院
研究方向：結(jié)直腸癌
研究簡(jiǎn)介：共生梭菌在結(jié)直腸癌患者的腫瘤組織中選擇性富集，并與結(jié)直腸腺瘤復(fù)發(fā)率相關(guān)，在多種小鼠模型中印證了共生菌的致瘤作用。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析和功能分析表明，C. symbiosum促進(jìn)結(jié)腸癌干細(xì)胞的增殖并增強(qiáng)癌癥的干性。通過靶向代謝組學(xué)分析，C. symbiosum通過產(chǎn)生支鏈氨基酸來增強(qiáng)細(xì)胞膽固醇合成，激活Sonic hedgehog信號(hào)傳導(dǎo)。低BCAA攝入或他汀類藥物阻斷膽固醇合成可在體內(nèi)和體外部分阻斷共生菌誘導(dǎo)的細(xì)胞增殖。
3. Gut commensal Christensenella minuta modulates host metabolism via acylated secondary bile acids
發(fā)表期刊：Nature Microbiology，2024IF=20.5
合作項(xiàng)目：Q300全定量檢測(cè)服務(wù)
合作單位：山東大學(xué)
研究方向：新型膽汁酸—糖脂代謝
研究簡(jiǎn)介：本研究發(fā)現(xiàn)了一種以3-O酰基化為特征的新型次級(jí)膽汁酸，它是腸道FXR的天然拮抗劑，并解釋了以C. minuta為代表的腸道益生菌通過 “腸道微生物—3-O-酰基氨酸—腸道FXR”的腸-肝信號(hào)軸的調(diào)節(jié)改善主代謝的新機(jī)制。展示了C. minuta和其產(chǎn)物3-O-酰基膽酸在治療包括T2D在內(nèi)的代謝性疾病方面潛力，該結(jié)論在小鼠模型中得到了證實(shí)，并得到了人群隊(duì)列研究的支持，再次強(qiáng)調(diào)了腸道共生菌及其功能代謝產(chǎn)物在宿主代謝穩(wěn)態(tài)中的重要作用，為代謝性疾病的治療和預(yù)防提供了全新的思路。
4. Diet-omics in the Study of Urban and Rural Crohn disease Evolution (SOURCE) cohort
發(fā)表期刊：Nature Communications，2024IF=14.7
合作項(xiàng)目：Q300全定量檢測(cè)服務(wù)
合作單位：中山大學(xué)附屬第一醫(yī)院
研究方向：克羅恩病
研究簡(jiǎn)介：通過人口統(tǒng)計(jì)學(xué)、CD表型、生物標(biāo)志物、食物頻率調(diào)查問卷（FFQ）、國(guó)際IBD組織（IOIBD）制定的環(huán)境調(diào)查問卷、16S、宏基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、代謝組學(xué)等方法研究城鄉(xiāng)差異與CD發(fā)病的關(guān)系，揭示了飲食-菌群-宿主復(fù)雜的相互作用，確定與城鄉(xiāng)轉(zhuǎn)變和CD相關(guān)的潛在有益和致病因素。
5. Galactooligosaccharides and Limosilactobacillus reuteri synergistically alleviate gut inflammation and barrier dysfunction by enriching Bacteroides acidifaciens for pentadecanoic acid biosynthesis
發(fā)表期刊：Nature Communications，2024IF=14.7
合作項(xiàng)目：Q300全定量檢測(cè)服務(wù)
合作單位：中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)
研究方向：腸道炎癥
研究簡(jiǎn)介：通過代謝組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、宏基因組學(xué)、FMT等技術(shù)手段，揭示了由GOS（低聚半乳糖）和L. reuteri（羅伊氏乳桿菌）的合生素通過促進(jìn)B. acidifaciens（產(chǎn)酸擬桿菌）合成C15:0（十五烷酸），從而緩解腸道炎癥和屏障功能障礙，闡明了合生素在治療UC和其他腸道炎癥性疾病的潛力。
6. Multi-modal molecular determinants of clinically relevant osteoporosis subtypes
發(fā)表期刊：Cell Discovery，2024IF=13
合作項(xiàng)目：Q300全定量檢測(cè)服務(wù)
合作單位：上海中醫(yī)藥大學(xué)
研究方向：骨質(zhì)疏松
研究簡(jiǎn)介：利用大型隊(duì)列現(xiàn)代化多組學(xué)數(shù)據(jù)，結(jié)合中醫(yī)表型組學(xué)策略，通過自主開發(fā)的高效的DLSF分析，基于多組學(xué)景觀和相應(yīng)的M3S分子特征，確定了骨質(zhì)疏松癥中國(guó)人群的臨床干預(yù)相關(guān)亞型（CISs），為OP的早期診斷和個(gè)性化治療提供參考意義。
7. Gut microbiota-derived indole-3-acetic acid suppresses high myopia progression by promoting type I collagen synthesis
發(fā)表期刊：Cell Discovery，2024IF=13
合作項(xiàng)目：Q300全定量檢測(cè)服務(wù)
合作單位：復(fù)旦大學(xué)附屬眼耳鼻喉科醫(yī)院
研究方向：眼腸軸-高度近視
研究簡(jiǎn)介：HM不僅僅是一種眼部疾病，也是腸道和眼睛之間復(fù)雜相互作用的結(jié)果。HM進(jìn)展過程中腸道菌群組成的改變導(dǎo)致血漿3-IAA的減少，在機(jī)制上通過SP1依賴的轉(zhuǎn)錄激活方式幫助維持COL1A1在鞏膜中的表達(dá)，抑制HM的進(jìn)展。因此這種以微生物群為中心的抗HM效應(yīng)可能通過每日補(bǔ)充3-IAA為高度近視的干預(yù)開辟新的治療途徑。
8. Gut microbiota-palmitoleic acid-interleukin-5 axis orchestrates benzene-induced hematopoietic toxicity
發(fā)表期刊：Gut Microbes，2024IF=12.2
合作項(xiàng)目：Q300全定量檢測(cè)服務(wù)
合作單位：首都醫(yī)科大學(xué)
研究方向：苯-血液毒性
研究簡(jiǎn)介：苯通過破壞腸道屏障導(dǎo)致腸道菌群失調(diào)，特別是與LCFAs相關(guān)的細(xì)菌，這種改變導(dǎo)致血漿LCFAs異常升高，從而通過CPT2（carnitine palmitoyltransferase 2）介導(dǎo)的FAO功能障礙加劇了苯相關(guān)的免疫炎癥和造血損傷。使用益生菌可改善小鼠腸道內(nèi)穩(wěn)態(tài)，有利于造血功能的恢復(fù)。因此，本研究為苯誘導(dǎo)血液毒性的潛在機(jī)制提供了新的見解，并強(qiáng)調(diào)了益生菌對(duì)苯毒性相關(guān)的不良血液結(jié)局的潛在保護(hù)作用。
9. Mapping multi-omics characteristics related to short-term PM2.5 trajectory and their impact on type 2 diabetes in middle-aged and elderly adults in Southern China
發(fā)表期刊：Journal of Hazardous Materials，2024IF=12.2
合作項(xiàng)目： Q300全定量檢測(cè)服務(wù)
合作單位：西湖大學(xué)
研究方向：糖尿病
研究簡(jiǎn)介：大隊(duì)列樣本在生物標(biāo)志物挖掘、疾病預(yù)測(cè)和流行病學(xué)研究中具有不可替代的作用，能夠提供豐富的數(shù)據(jù)和信息，推動(dòng)相關(guān)領(lǐng)域的研究和發(fā)展。本研究結(jié)合宏基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)等方法，建立PM2.5短期暴露軌跡與多組學(xué)特征之間的聯(lián)系，闡述PM2.5相關(guān)生物標(biāo)志物與中國(guó)南方成年人中T2D的存在和發(fā)病率之間的關(guān)系。
10. Effects of healthy low-carbohydrate diet and timerestricted eating on weight and gut microbiome in adults with overweight or obesity: Feeding RCT
發(fā)表期刊：Cell Reports Medicine，2024IF=11.7
合作項(xiàng)目： Q300全定量檢測(cè)服務(wù)
合作單位：華中科技大學(xué)
研究方向：肥胖
研究簡(jiǎn)介：通過表型分析、宏基因組學(xué)、靶向代謝組學(xué)等方法，闡述了HLCD（健康低卡飲食）和TRE（時(shí)間限制飲食）在體重管理方面是有效的，并且在熱量限制的基礎(chǔ)上引發(fā)腸道微生物組和代謝組的深刻變化。
三、膽汁酸
2024年度膽汁酸項(xiàng)目文章20＋篇，近10篇IF＞10，總影響因子超150＋分。
11. Statins aggravate insulin resistance through reduced blood glucagon-like peptide-1levels in a microbiota-dependent manner
發(fā)表期刊：Cell Metabolism，2024IF=27.7
合作項(xiàng)目：膽汁酸譜定量檢測(cè)服務(wù)
合作單位：西安交通大學(xué)第一附屬醫(yī)院
研究方向：他汀類藥物副作用
研究簡(jiǎn)介：本研究揭示了他汀類藥物通過降低腸道梭狀芽孢桿菌，抑制鵝去氧膽酸 (CDCA) 向熊去氧膽酸 (UDCA) 轉(zhuǎn)化，引起腸道胰高血糖素樣肽-1 (GLP-1) 分泌減少，導(dǎo)致機(jī)體糖代謝異常和胰島素抵抗。
12. Zinc promotes microbial p-coumaric acid production that protects against cholestatic liver injury
發(fā)表期刊：Cell Host & Microbe，2024IF=20.6
合作項(xiàng)目：膽汁酸譜定量檢測(cè)服務(wù)
合作單位：南方醫(yī)科大學(xué)
研究方向：肝損傷
研究簡(jiǎn)介：膽汁淤積性肝損傷（CLD）是肝膽系統(tǒng)的一種嚴(yán)重病理狀況，發(fā)病機(jī)理復(fù)雜，存在多種病因。目前，膽汁淤積性肝損傷的治療方法有限，病情發(fā)展為嚴(yán)重膽汁性肝硬化的患者需要接受肝移植手術(shù)。因此，迫切需要更有效的治療方法，尤其是預(yù)防措施。本研究結(jié)合動(dòng)物-細(xì)胞模型實(shí)驗(yàn)、多組學(xué)技術(shù)方法揭示了補(bǔ)充鋅可以刺激宿主-微生物群的相互作用，改變腸道微生物組，從而減輕膽汁淤積性肝損傷。
13. Resistant starch intake facilitates weight loss in humans by reshaping the gut microbiota
發(fā)表期刊：Nature Metabolism，2024IF=18.9
合作項(xiàng)目：膽汁酸譜和宏代謝檢測(cè)服務(wù)
合作單位：上海六院
研究方向：抗性淀粉-肥胖
研究簡(jiǎn)介：本研究開展了一項(xiàng)隨機(jī)雙盲、交叉設(shè)計(jì)干預(yù)研究，通過精準(zhǔn)的臨床指標(biāo)評(píng)估抗性淀粉干預(yù)對(duì)肥胖的緩解作用，同時(shí)進(jìn)行多組學(xué)研究全面分析腸道微生物和代謝物的改變，探索抗性淀粉改善肥胖的機(jī)制，并對(duì)其中發(fā)揮作用的關(guān)鍵菌種進(jìn)行了因果驗(yàn)證。
14. Ketogenic diet-induced bile acids protect against obesity through reduced calorie absorption
發(fā)表期刊：Nature Metabolism，2024IF=18.9
合作項(xiàng)目：膽汁酸譜定量和Q300全定量檢測(cè)服務(wù)
合作單位：復(fù)旦大學(xué)
研究方向：膽汁酸-肥胖
研究簡(jiǎn)介：通過自然人群隊(duì)列研究、小鼠模型實(shí)驗(yàn)、代謝組學(xué)、宏基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)等技術(shù)手段，揭示了KD消耗降低體重和空腹血糖水平的獨(dú)特宿主-腸道菌群代謝相互作用機(jī)制，發(fā)現(xiàn)兩種膽汁酸TDCA和TUDCA作為除KD外治療肥胖及其并發(fā)癥的兩種有希望的候選藥物。
15. TGR5-mediated lateral hypothalamus-dCA3-dorsolateral septum circuit regulates depressivelike behavior in male mice
發(fā)表期刊：Neuron，2024IF=14.7
合作項(xiàng)目：膽汁酸譜定量檢測(cè)服務(wù)
合作單位：中國(guó)藥科大學(xué)
研究方向：膽汁酸-抑郁癥
研究簡(jiǎn)介：本研究發(fā)現(xiàn)，在雄性小鼠的抑郁模型中，下丘腦外側(cè)區(qū)（LHA）的TGR5在GABA能神經(jīng)元中表達(dá)降低，且GABA能神經(jīng)元興奮性增加。上調(diào)TGR5或抑制GABA能興奮性可減輕抑郁樣行為，反之則加劇。TGR5通過細(xì)胞外調(diào)節(jié)蛋白激酶和Kv4.2通道雙向調(diào)節(jié)GABA能神經(jīng)元興奮性，且LHA的GABA能神經(jīng)元通過特定投射到背側(cè)CA3的CaMKIIα神經(jīng)元，進(jìn)而影響背外側(cè)隔膜（DLS），發(fā)揮抗抑郁作用，這些發(fā)現(xiàn)為理解抑郁的神經(jīng)機(jī)制和開發(fā)新療法提供了線索。
四、代謝流
2024年度代謝流項(xiàng)目近10篇，平均IF＞20＋分，涵蓋13C6-glucose, 13C5-glutamine, 13C2-acetate、2,3-13C2-alanine、13C6-Leucine、 1,2-13C2-KIC等多個(gè)同位素標(biāo)記底物分析。
16. Branched-chain amino acid transaminase 1 confers EGFRTKI resistance through epigenetic glycolytic activation
發(fā)表期刊：Signal Transduction and Targeted Therapy，2024IF=40.8
合作項(xiàng)目：代謝流（13C6-Leucine，1,2-13C2-KIC）檢測(cè)服務(wù)
合作單位：上海藥物研究所
研究方向：非小細(xì)胞肺癌
研究簡(jiǎn)介：用高通量蛋白質(zhì)組學(xué)分析，對(duì)建立的TKI耐藥腫瘤模型進(jìn)行了全面研究，發(fā)現(xiàn)與親本TKI敏感的NSCLC腫瘤相比，在奧希替尼和ASK120067耐藥的腫瘤中，支鏈氨基酸轉(zhuǎn)氨酶1（BCAT1）的表達(dá)顯著上調(diào)。進(jìn)一步的研究表明，通過遺傳敲除或藥物抑制BCAT1，可以抑制耐藥細(xì)胞的生長(zhǎng)，并部分恢復(fù)腫瘤細(xì)胞對(duì)EGFR TKIs的敏感性。機(jī)制上，耐藥細(xì)胞中BCAT1的上調(diào)重編程了支鏈氨基酸（BCAA）代謝，促進(jìn)了依賴于α-酮戊二酸（α-KG）的組蛋白H3第27位賴氨酸（H3K27）的去甲基化，進(jìn)而轉(zhuǎn)錄解除了糖酵解相關(guān)基因的抑制，增強(qiáng)了糖酵解并促進(jìn)了腫瘤進(jìn)展。此外，研究還鑒定出了一種新型BCAT1抑制劑WQQ-345，該抑制劑在體內(nèi)外均對(duì)高表達(dá)BCAT1的TKI耐藥肺癌具有抗腫瘤活性。強(qiáng)調(diào)了BCAT1在介導(dǎo)第三代EGFR-TKI耐藥中的關(guān)鍵作用，并揭示了其通過表觀遺傳激活機(jī)制促進(jìn)腫瘤進(jìn)展的分子機(jī)制。
17. Astrocytic LRP1 enables mitochondria transfer to neurons and mitigates brain ischemic stroke by suppressing ARF1 lactylation
發(fā)表期刊：Cell Metabolism，2024IF=27.7
合作項(xiàng)目：代謝流（13C6-glucose, 13C5-glutamine, 13C2-acetate）技術(shù)檢測(cè)服務(wù)
合作單位：西南醫(yī)科大學(xué)
研究方向：缺血性腦卒中
研究簡(jiǎn)介：本研究揭示了星形膠質(zhì)細(xì)胞中的LRP1通過抑制葡萄糖攝取、糖酵解和乳酸生成，導(dǎo)致ADP-核糖基化因子1 (ARF1)的乳酸化水平降低，進(jìn)而促進(jìn)了線粒體向受損神經(jīng)元的轉(zhuǎn)移，并緩解缺血導(dǎo)致的器官損傷。
18. TANGO6 regulates cell proliferation via COPI vesicle-mediated RPB2 nuclear entry
發(fā)表期刊：Nature Communications，2024IF=14.7
合作項(xiàng)目：代謝流（2,3-13C2-alanine）技術(shù)檢測(cè)服務(wù)
合作單位：中國(guó)科學(xué)院重慶綠色智能技術(shù)研究院
研究方向：造血干細(xì)胞擴(kuò)增機(jī)制
研究簡(jiǎn)介：本研究綜合利用細(xì)胞系以及小鼠等模型，揭示轉(zhuǎn)運(yùn)和高爾基體組織—TANGO6通過外殼蛋白復(fù)合物I（COPI）囊泡轉(zhuǎn)運(yùn)調(diào)控RNA聚合酶II亞基—RPB2入核驅(qū)動(dòng)細(xì)胞增殖這一新機(jī)制，并強(qiáng)調(diào)了其在促進(jìn)HSCs增殖中的重要作用。
19. Sensing of Liver-Derived Nicotinamide by Intestinal Group 2 Innate Lymphoid Cells Links Liver Cirrhosis and Ulcerative Colitis Susceptibility
發(fā)表期刊：Advanced Science，2024IF=14.3
合作項(xiàng)目：代謝流（13C6-glucose）技術(shù)檢測(cè)服務(wù)
合作單位：山東大學(xué)
研究方向：肝硬化、潰瘍性結(jié)腸炎
研究簡(jiǎn)介：通過代謝組學(xué)、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)、基因敲除和骨髓移植等技術(shù)手段，揭示了慢性肝病擾亂肝臟NAD+代謝，導(dǎo)致經(jīng)肝-腸軸到達(dá)腸道的NAD+合成前體物NAM減少，損害腸道2型固有淋巴樣細(xì)胞（ILC2s）的組織修復(fù)功能，繼而在并發(fā)UC時(shí)加重疾病。
五、能量代謝
20. Identification of hypoxic macrophages inglioblastoma with therapeutic potential for vasculature normalization
發(fā)表期刊：Cancer cell，2024IF=48.8
合作項(xiàng)目：蛋白質(zhì)組學(xué)和能量代謝檢測(cè)服務(wù)
合作單位：陸軍軍醫(yī)大學(xué)
研究方向：膠質(zhì)瘤
研究簡(jiǎn)介：在膠質(zhì)母細(xì)胞瘤中，顯著的壞死區(qū)域伴隨大量不穩(wěn)定的微血管，壞死區(qū)域周圍的環(huán)境信號(hào)使巨噬細(xì)胞極化到缺氧狀態(tài)，進(jìn)一步增強(qiáng)血管的高通透性，通過繪制膠質(zhì)母細(xì)胞瘤TAM空間圖譜，強(qiáng)調(diào)了腦膠質(zhì)瘤中Mo-TAM的多樣性和空間微環(huán)境引導(dǎo)的Mo-TAM重編程，鑒定出缺氧微環(huán)境內(nèi)Hypoxia-TAM新功能亞群，指出了針對(duì)Hypoxia-TAM的潛在治療方法，為提高腫瘤治療藥物灌注和療效提供新策略。
21. Impaired microglial glycolysis promotes inflammatory responses after intracerebral haemorrhage via HK2-dependent mitochondrial dysfunction
發(fā)表期刊：Journal of Advanced Research，2024IF=11.4
合作項(xiàng)目：能量代謝檢測(cè)服務(wù)
合作單位：浙江大學(xué)附屬第二醫(yī)院
研究方向：腦出血
研究簡(jiǎn)介：本研究揭示了一種先前未被描述的狀態(tài)，即在腦出血（ICH）后，小膠質(zhì)細(xì)胞中增強(qiáng)的炎癥反應(yīng)會(huì)損害早期的糖酵解過程。己糖激酶2（HK2）的下調(diào)會(huì)阻礙葡萄糖的攝取，并通過破壞線粒體功能促進(jìn)線粒體活性氧（MitoROS）的積累。小膠質(zhì)細(xì)胞早期糖酵解過程的抑制會(huì)加重炎癥反應(yīng)，并加劇神經(jīng)功能缺損。此外，神經(jīng)功能障礙與血腫周圍模式減少之間的強(qiáng)烈相關(guān)性表明，氟脫氧葡萄糖正電子發(fā)射斷層掃描（FDG-PET）可能有助于預(yù)測(cè)神經(jīng)系統(tǒng)的預(yù)后。
22. Enteric coronavirus PDCoV evokes a non-Warburg effect by hijacking pyruvic acid as a metabolic hub
發(fā)表期刊：Redox Biology，2024IF=10.7
合作項(xiàng)目：能量代謝檢測(cè)服務(wù)
合作單位：華中農(nóng)業(yè)大學(xué)
研究方向：豬腸道冠狀病毒
研究簡(jiǎn)介：豬δ冠狀病毒（Porcine deltacoronavirus，PDCoV）是一種新出現(xiàn)的豬腸道致病性冠狀病毒，其臨床癥狀主要表現(xiàn)為急性腹瀉、嘔吐、脫水和死亡。迄今為止，已經(jīng)在多個(gè)國(guó)家發(fā)現(xiàn)了該病毒，給養(yǎng)豬業(yè)造成了重大的經(jīng)濟(jì)損失。此外，已有報(bào)道表明PDCoV可以跨物種感染人、牛、雞、鼠等動(dòng)物，對(duì)人類和其他動(dòng)物健康構(gòu)成嚴(yán)重威脅，該研究闡明PDCoV感染會(huì)擾亂糖酵解、TCA以及谷氨酰胺酵解的代謝穩(wěn)態(tài)，進(jìn)而引發(fā)一種以丙酮酸積累為特征的非典型Warburg效應(yīng)，為開發(fā)抗PDCoV藥物提供新思路。
六、氨基酸
23. Role of Argininosuccinate Synthase 1-Dependent L-Arginine Biosynthesis in the Protective Effect of Endothelial Sirtuin 3 Against Atherosclerosis
發(fā)表期刊：Advanced Science，2024IF=14.3
合作項(xiàng)目：氨基酸譜定量檢測(cè)服務(wù)
合作單位：香港中文大學(xué)
研究方向：動(dòng)脈粥樣硬化
研究簡(jiǎn)介：本研究探討了Sirtuin 3（SIRT3）在動(dòng)脈粥樣硬化過程中內(nèi)皮細(xì)胞（EC）功能的作用。通過使用有無內(nèi)皮特異性SIRT3敲除的小鼠模型，研究發(fā)現(xiàn)內(nèi)皮細(xì)胞中SIRT3缺乏會(huì)導(dǎo)致動(dòng)脈粥樣硬化斑塊形成增加、巨噬細(xì)胞浸潤(rùn)和血管炎癥加劇。在人體內(nèi)皮細(xì)胞中，SIRT3抑制同樣會(huì)加重炎癥反應(yīng)、減少一氧化氮產(chǎn)生、增加活性氧種類并降低L-精氨酸水平。研究還進(jìn)一步揭示，SIRT3通過去乙酰化并激活精氨酸代琥珀酸合成酶1（ASS1）——L-精氨酸生物合成中的一種關(guān)鍵酶——來發(fā)揮作用。L-精氨酸補(bǔ)充劑減輕了SIRT3缺乏在小鼠中的不良影響。總體而言，本研究強(qiáng)調(diào)了內(nèi)皮SIRT3在動(dòng)脈粥樣硬化中的保護(hù)作用，以及其在通過內(nèi)皮細(xì)胞誘導(dǎo)ASS1去乙酰化來調(diào)節(jié)精氨酸合成方面的重要作用。
24. Branched-chain amino acids deficiency promotes diabetic cardiomyopathy by activating autophagy of cardiac fibroblasts
發(fā)表期刊：Theranostics，2024IF=12.4
合作項(xiàng)目：氨基酸譜定量檢測(cè)服務(wù)
合作單位：上海新華醫(yī)院
研究方向：糖尿病性心肌病
研究簡(jiǎn)介：本研究發(fā)現(xiàn)與19名未表現(xiàn)出心肌病表型的2型糖尿病（T2D）患者相比，15名糖尿病心肌病（DCM）患者的血漿支鏈氨基酸（BCAA）水平明顯較低。證實(shí)了在糖尿病小鼠中，BCAA缺乏會(huì)加重心肌病表型，而BCAA補(bǔ)充則會(huì)減輕這些表型。進(jìn)一步的研究表明，BCAA缺乏通過刺激DCM小鼠中的自噬作用促進(jìn)了心臟成纖維細(xì)胞的激活。在機(jī)制上，BCAA缺乏通過心臟成纖維細(xì)胞中的AMPK–ULK1信號(hào)通路激活了自噬作用。表明BCAA補(bǔ)充劑可能作為一種潛在的治療藥物來緩解DCM和纖維化。
七、脂肪酸
25. Gut microbiota mediates ambient PM2.5 exposure-induced abnormal glucose metabolism via short-chain fatty acids
發(fā)表期刊：Journal of Hazardous Materials，2024IF=12.2
合作項(xiàng)目： 短鏈脂肪酸定量檢測(cè)服務(wù)
合作單位：復(fù)旦大學(xué)
研究方向：PM2.5-腸道微生物穩(wěn)態(tài)
研究簡(jiǎn)介：腸道微生物群的生態(tài)失調(diào)促進(jìn)代謝紊亂的易感性，如葡萄糖耐受不良和胰島素抵抗，此外，腸道菌群所產(chǎn)生的代謝物對(duì)宿主生理也起到關(guān)鍵的作用。本研究通過宏基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、短鏈脂肪酸靶向測(cè)定等技術(shù)，闡述了腸道微生物群在PM2.5暴露誘導(dǎo)的糖代謝異常中起到介導(dǎo)作用，控制腸道微生物群或其代謝物是預(yù)防環(huán)境PM2.5對(duì)健康不利影響的潛在策略。
八、非靶向代謝組學(xué)
2024年度非靶向代謝組學(xué)項(xiàng)目文章超30＋篇，近20＋篇IF＞5。
26. Cellular spermine targets JAK signaling to restrain cytokine-mediated autoimmunity
發(fā)表期刊：Immunity，2024IF=25.5
合作項(xiàng)目：多胺定量檢測(cè)和非靶向代謝組學(xué)檢測(cè)服務(wù)
合作單位：北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所
研究方向：自身免疫
研究簡(jiǎn)介：揭示了精胺能夠抑制JAK介導(dǎo)的細(xì)胞因子免疫應(yīng)答及炎癥反應(yīng)，有效緩解自身免疫性疾病進(jìn)程。該研究還篩選出精胺天然衍生物SD1，證明了其具有廣譜性免疫抑制和抗炎功能，表明精胺及其衍生物是細(xì)胞穩(wěn)態(tài)的代謝檢查點(diǎn)和控制自身免疫性疾病的潛在免疫抑制分子。
27. Farnesyl pyrophosphate potentiates dendritic cell migration in autoimmunity through mitochondrial remodelling
發(fā)表期刊：Nature Metabolism，2024IF=18.9
合作項(xiàng)目：非靶向代謝組學(xué)檢測(cè)服務(wù)
合作單位：海軍軍醫(yī)大學(xué)免疫研究所
研究方向：自身免疫
研究簡(jiǎn)介：本研究表明，法尼基焦磷酸（FPP）作為甲羥戊酸途徑的中間產(chǎn)物，在系統(tǒng)性紅斑狼瘡（SLE）小鼠來源的mig-DCs中積聚。FPP通過協(xié)調(diào)蛋白質(zhì)香葉酰香葉酰化和線粒體重塑，促進(jìn)mig-DCs的生存和引流淋巴結(jié)中的生發(fā)中心反應(yīng)。在機(jī)制上，F(xiàn)PP依賴的RhoA香葉酰香葉酰化通過線粒體RhoA-MFN相互作用促進(jìn)線粒體融合和氧化呼吸，從而有助于mig-DCs中內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激的緩解。辛伐他汀是甲羥戊酸途徑的化學(xué)抑制劑，可恢復(fù)mig-DCs的線粒體功能，并減輕SLE小鼠的系統(tǒng)性發(fā)病。
28. TRIM65/NF2/YAP1 Signaling Coordinately Orchestrates Metabolic And Immune Advantages in Hepatocellular Carcinoma
發(fā)表期刊：Advanced Science，2024IF=14.3
合作項(xiàng)目：非靶向代謝組學(xué)
合作單位：同濟(jì)大學(xué)，上海交通大學(xué)
研究方向：肝癌
研究簡(jiǎn)介：肝細(xì)胞癌（HCC）是全球主要的癌癥死亡原因之一，其細(xì)胞內(nèi)尿苷核苷酸和脂肪酸代謝的顯著激活促進(jìn)了惡性增殖和免疫逃逸。研究發(fā)現(xiàn)，TRIM65（一種E3泛素-蛋白連接酶）在HCC中高表達(dá)，并通過O-GlcNAc糖基化修飾。TRIM65促進(jìn)了代謝重塑，增加了與尿嘧啶代謝和棕櫚酸相關(guān)的產(chǎn)物積累，從而推動(dòng)了HCC的進(jìn)展。在分子機(jī)制上，TRIM65介導(dǎo)了神經(jīng)纖維瘤病2型（NF2）蛋白K44位點(diǎn)的泛素化，NF2是經(jīng)典Hippo信號(hào)通路的關(guān)鍵上游蛋白。TRIM65加速NF2的降解，進(jìn)而抑制了YAP1（yes-associated protein 1）的磷酸化，導(dǎo)致相關(guān)代謝酶轉(zhuǎn)錄的異常激活，并協(xié)調(diào)了代謝和免疫優(yōu)勢(shì)。揭示了TRIM家族分子TRIM65在支持HCC細(xì)胞存活中的關(guān)鍵作用，并強(qiáng)調(diào)了針對(duì)其E3連接酶活性進(jìn)行靶向治療以改變蛋白酶體降解調(diào)控的潛在治療價(jià)值。
九、其他項(xiàng)目
2024年度色氨酸、神經(jīng)遞質(zhì)、一碳代謝、糖醇、多胺、宏代謝、16S等項(xiàng)目文章欣欣向榮。
29. GV-971 prevents severe acute pancreatitis byremodeling the microbiota-metabolicimmune axis
發(fā)表期刊：Nature Communications，2024IF=14.7
合作項(xiàng)目：16S和宏代謝檢測(cè)服務(wù)
合作單位：廣州醫(yī)科大學(xué)
研究方向：腸道微生物群-代謝-免疫軸
研究簡(jiǎn)介：GV-971（甘露特鈉或甘露寡糖二酸）在中國(guó)已被批準(zhǔn)用于增強(qiáng)阿爾茨海默病患者的認(rèn)知能力，它能夠調(diào)節(jié)腸道菌群并減少神經(jīng)炎癥，近期研究表明腸道菌群失調(diào)加劇了SAP，并且考慮到免疫細(xì)胞功能障礙是神經(jīng)退行性疾病和胰腺炎的常見病理機(jī)制，亟需進(jìn)一步探索GV-971在SAP中的潛在應(yīng)用。該研究闡述了GV-971通過調(diào)節(jié)腸道微生物群-代謝-免疫軸來重塑腸道微生物群，進(jìn)而影響SAP的發(fā)展，表明了GV-971在預(yù)防和治療重癥急性胰腺炎方面的潛在作用。
30. Gut microbiota dysbiosis deteriorates immunoregulatory effects of tryptophan via colonic indole and LBP/HTR2B-mediated macrophage function
發(fā)表期刊：ISME Journal ，2024IF=10.8
合作項(xiàng)目：色氨酸譜靶向定量檢測(cè)服務(wù)
合作單位：中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)
研究方向：腸道炎癥
研究簡(jiǎn)介：炎癥性腸病（IBD）和潰瘍性結(jié)腸炎（UC）與腸道免疫功能障礙和腸道菌群失調(diào)密切相關(guān)，5-羥色胺（5-HT）與腸道5-羥色胺受體（HTRs）信號(hào)傳導(dǎo)已被證明可影響腸道炎癥，但腸道菌群失調(diào)的腸道炎癥中腸道5-HT信號(hào)的微生物調(diào)節(jié)機(jī)制還有待進(jìn)一步闡明。研究結(jié)合16S rRNA、代謝組學(xué)、宏基因組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)，驗(yàn)證了腸道菌群失調(diào)通過結(jié)腸吲哚和 LBP/HTR2B （G 蛋白偶聯(lián)受體 1 家族的 5-羥色胺受體）介導(dǎo)的巨噬細(xì)胞功能削弱色氨酸的免疫調(diào)節(jié)作用，為制定新的飲食和治療策略以改善腸道菌群失調(diào)相關(guān)的腸道炎癥提供基礎(chǔ)。
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【Q300】
31.Gut Microbes/乳腺癌/Prevotella copri exhausts intrinsic indole-3-pyruvic acid in the host to promote breast cancer progression: Inactivation of AMPK via UHRF1-mediated negative regulation
32.eBioMedicine/中國(guó)男性肝癌風(fēng)險(xiǎn)/Prediagnostic plasma metabolite concentrations and liver cancer risk: a population-based study of Chinese men
33.Pharmacological Research/胃癌/Akkermansia muciniphila-derived pentadecanoic acid enhances oxaliplatin sensitivity in gastric cancer by modulating glycolysis
34.EMBO Molecular Medicine/克羅恩病/Multiomics reveals microbial metabolites as key actors in intestinal fibrosis in Crohn’s disease
35.Food Chemistry/脂代謝障礙/Alleviation of lipid metabolic dysfunction through regulation of intestinal bacteriophages and bacteria by green tea polyphenols in Ob/Ob mice “
36.Science of the Total Environment /肺損傷/Inhaled polystyrene microplastics impaired lung function through pulmonary flora/TLR4-mediated iron homeostasis imbalance
37.Cell Death and Disease/結(jié)直腸癌/The ubiquitin-like protein UBTD1 promotes colorectal cancer progression by stabilizing c-Myc to upregulate glycolysis
38.Cell Reports/NASH/The mitochondrial genome-encoded peptide MOTS-c interacts with Bcl-2 to alleviate nonalcoholic steatohepatitis progression
39.Cellular and Molecular Gastroenterology and Hepatology/肝硬化/Microbial-derived Urolithin A targets GLS1 to inhibit glutaminolysis and attenuate cirrhotic portal hypertension
40.BMC Medicine/中老年NAFLD腸菌及代謝物特征/Gut microbiome features and metabolites in non-alcoholic fatty liver disease among community-dwelling middle-aged and older adults
……
【膽汁酸】
41.Gut Microbes/原發(fā)性膽道膽管炎/The fecal microbiota of patients with primary biliary cholangitis (PBC) causes PBC-like liver lesions in mice and exacerbates liver damage in a mouse model of PBC
42.Pharmacological Research/肝損傷/Lactobacillus rhamnosus GG ameliorates triptolide-induced liver injury through modulation of the bile acid-FXR axis
43.Pharmacological Research/神經(jīng)炎癥/Gut microbiota-brain bile acid axis orchestrates aging-related neuroinflammation and behavior impairment in mice
44.Cell Reports/腸道微生物結(jié)構(gòu)變化/Mapping the gut microbial structural variations in healthy aging within the Chinese population
……
【非靶向代謝組學(xué)】
45.Chemical Engineering Journal/硫脅迫/Deciphering mechanism of sulfide stress on microalgae and overcoming its inhibition by regulation growth acclimatization period
46.Journal Of Hazardous Materials/銅綠微囊藻/Low-frequency ultrasound assisted contact-electro-catalysis for efficient inactivation of Microcystis aeruginosa inactivation of Microcystis aeruginosa
47.Redox Biology/結(jié)直腸癌/Hypoxia-induced cysteine metabolism reprogramming is crucial for thetumorigenesis of colorectal cancer
48.British Journal Of Pharmacology/胰腺炎/IDH2-NADPH pathway protects against acute pancreatitis via suppressing acinar cell ferroptosis
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【其他項(xiàng)目】
49.能量代謝檢測(cè)服務(wù)/Developmental Cell/白血病/SMARCA5 reprograms AKR1B1-mediated fructose metabolism to control leukemogenesis
50.能量代謝檢測(cè)服務(wù)/MedComm/結(jié)直腸癌/LINC01764 promotes colorectal cancer cells proliferation, metastasis, and 5-fluorouracil resistance by regulating glucose and glutamine metabolism via promoting c-MYC translation
51.脂肪酸檢測(cè)服務(wù)/Pharmacological Research /高脂血癥/Type 3 resistant starch from Canna edulis reduce lipid levels in patients with mild hyperlipidemia through altering gut microbiome: A double- blind randomized controlled trial
52.脂肪酸檢測(cè)服務(wù)/Phytomedicine/抑郁/Prebiotic inulin alleviates anxiety and depression-like behavior in alcohol withdrawal mice by modulating the gut microbiota and 5-HT metabolism
53.代謝流檢測(cè)服務(wù)/Nature Communications/肺癌/PPIA dictates NRF2 stability to promote lung cancer progression
54.神經(jīng)遞質(zhì)檢測(cè)服務(wù)/Molecular Therapy/行為缺陷/Amelioration of metabolic and behavioral defects through base editing in thePahR408W phenylketonuria mouse model
55.宏代謝檢測(cè)服務(wù)/Microbiome/自身免疫性腦脊髓炎/Dietary ellagic acid therapy for CNS autoimmunity: Targeting on Alloprevotella rava and propionate metabolism
56.一碳代謝檢測(cè)服務(wù)/International Journal of Biological Sciences/腦出血/Interaction Between the PERK/ATF4 Branch of the Endoplasmic Reticulum Stress and Mitochondrial One-Carbon Metabolism Regulates Neuronal Survival After Intracerebral Hemorrhage
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END