?基本概念
???原理：將待檢測的DNA分子用/不用限制性內(nèi)切酶消化后，通過瓊脂糖凝膠電泳進行分離，繼而將其變性并按其在凝膠中的位置轉(zhuǎn)移到**纖維素薄膜或尼龍膜上，固定后再與同位素或其它標記物標記的DNA或RNA探針進行反應。如果待檢物中含有與探針互補的序列，則二者通過堿基互補的原理進行結(jié)合，游離探針洗滌后用自顯影或其它合適的技術(shù)進行檢測，從而顯示出待檢的片段及其相對大小。?
??用途：檢測樣品中的DNA及其含量，了解基因的狀態(tài),?如是否有點突變、擴增重排等。
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實驗步驟
一、基因組DNA的制備
二、基因組DNA的限制酶切
根據(jù)實驗目的決定酶切DNA的量。一般Southern雜交每一個電泳通道需要10-30μg的DNA。購買的限制性內(nèi)切酶都附有相對應的10倍濃度緩沖液，并可從該公司的產(chǎn)品目錄上查到最佳消化溫度。為保證消化完全，一般用2-4U的酶消化1μg?的DNA。消化的DNA濃度不宜太高，以0.5μg?/μl?為好。具體操作如下：在1.5ml離心管中依次加入
DNA（1μg?/μl）-------------------------------20?μg
10×酶切buffer?--------------------------------4.0?μl
限制性內(nèi)切酶（10U/μl）------------------5.0?μl
加ddH2O?至----------------------500?μl
在最適溫度下消化1-3Hour。消化結(jié)束時可取5μl電泳檢測消化效果。若消化效果不好，可以延長消化時間，但超過6?Hour已沒有必要。或者放大反應體積，或者補充酶再消化。如仍不能奏效，可能的原因是DNA樣品中有太多的雜質(zhì)，或酶的活力下降。
消化后的DNA加入1/10?體積的0.5M?EDTA，以終止消化。然后用等體積酚抽提、等體積氯仿抽提，2.5倍體積乙醇沉淀，少量TE溶解。
如果需要兩種酶消化DNA，而兩種酶的反應條件可以一致，則兩種酶可同時進行消化；如果反應條件不一致，則先用需要低離子強度的酶消化，然后補加鹽類等物質(zhì)調(diào)高反應體系的離子強度，再加第二種酶進行消化。
三、基因組DNA消化產(chǎn)物的瓊脂糖凝膠電泳
瓊脂糖凝膠電泳是目前分離核酸片段最常用的方法，制備簡單，分離范圍廣（200bp-50kb），實驗成本低。下表列舉了不同濃度瓊脂糖凝膠能分離的DNA片段范圍。
表：不同濃度瓊脂糖凝膠分離DNA片段的范圍
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瓊脂糖凝膠濃度（%） |
分離DN**段范圍（kb）表： 不同濃度瓊脂糖凝膠分離DN**段的范圍 |
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0.3 |
5-60 |
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0.6 |
1-20 |
|
0.7 |
0.8-10 |
|
0.9 |
0.5-7 |
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1.2 |
0.4-6 |
|
1.5 |
0.2-3 |
|
2.0 |
0.1-2 |
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1.?制備0.8%
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