DNA/RNA IsoAmp MasterMix(用于LAMP/HDA/RCA/CPA恒溫擴(kuò)增用)-分析方法-資訊-生物在線

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DNA/RNA IsoAmp MasterMix(用于LAMP/HDA/RCA/CPA恒溫擴(kuò)增用)

作者:上海雅吉生物科技有限公司 2021-03-25T00:00 (訪問量:3255)

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在核酸分子的恒溫擴(kuò)增過程中,無論采用LAMP、HDA、RCA、CPA、SMAP等擴(kuò)增技術(shù),這種高速度的擴(kuò)增特性,均不可避免的引起假陽性擴(kuò)增。這種假陽性的擴(kuò)增情況在LAMP擴(kuò)增中表現(xiàn)尤為明顯,由于LAMP擴(kuò)增用到很高濃度的引物,因此難免保證有少量錯配和引物Dimer,這些輕微的污染都會導(dǎo)致在LAMP高速擴(kuò)增中造成假陽性。優(yōu)化的反應(yīng)緩沖液,配合獨(dú)有的顯色技術(shù)和陰性控制技術(shù)建立的預(yù)混恒溫mix系列產(chǎn)品,可高靈敏度、高特異性的用于LAMP HNB變色、LAMP紅黃變色、LAMP OG變色、 LAMP 濁度分析、LAMP SYBR Green熒光檢測、HDA熒光檢測、RCA熒光檢測、CPA熒光檢測、SMAP熒光檢測的擴(kuò)增反應(yīng)。在LAMP擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)中,與其它公司提供的 DNA/RNA LAMP MasterMix 或 LAMP Mix相比,得益于 Bst 4.0 DNA/RNA聚合酶的出色性能,Bst 4.0 IsoAmp Red MasterMix具有更快的擴(kuò)增速度和雜質(zhì)耐受性。
Bst 4.0 DNA/RNA聚合酶對dUTP底物的超強(qiáng)識別能力,擴(kuò)增反應(yīng)所需的核苷酸底物dTTP可被dUTP完全取代,因此擴(kuò)增產(chǎn)物均包含dUTP,在配合熱敏UDG的情況下,氣溶膠污染物,將會在起始反應(yīng)階段被徹底清除。而后續(xù)熱敏UDG在65℃條件下3min內(nèi),完全不可逆失活;從而既能消除污染物,又能保證核酸正常擴(kuò)增。因此,應(yīng)用該試劑能大大降低LAMP反應(yīng)中由于氣溶膠污染造成的假陽性信號。

使用特征

? Bst 4.0 MasterMix
特點(diǎn) 單組分預(yù)混
擴(kuò)增用酶 Bst3.0+ThermoStable V
DNA模板 ★★★★★
RNA模板 ★★★★★
擴(kuò)增速度 ★★★★★
反應(yīng)溫度 60-68℃
雜質(zhì)耐受性 ★★★★★

以2019-nCov核酸擴(kuò)增為例三種方法的性能比較

? 紅黃變色可視化
(Cat.No.:A3824-01)
橙綠變色可視化
(Cat.No.:A3824-02)
熒光法
(Cat.No.:A3824-03)
試劑信息? 靶標(biāo)均為N基因,凍干Assay均相同;搭配不同Buffer實(shí)現(xiàn)不同的顯色。
檢測方法 肉眼觀測 肉眼觀測 SYBR Green熒光
檢測設(shè)備 水浴鍋、金屬浴、PCR儀 水浴鍋、金屬浴、PCR儀 定量PCR或恒溫?zé)晒鈨x
陽性判讀方式 黃色為陽性 綠色為陽性 有擴(kuò)增曲線為陽性
反應(yīng)溫度 60-65℃
反應(yīng)時間 30min 20min 15-18min
靈敏度(100%檢出) 10 copies/test 10 copies/test 10 copies/test
單copy檢出率 10-30% 30-50% 30-50%
假陽性比例 <1% <1% <1%
抗雜質(zhì)能力 +++ +++++ +++++
操作通量 可高通量檢測 不適宜大量樣本 30-50%

實(shí)例展示

1、A3824-01 紅黃變色反應(yīng)(肉眼觀察)
以2019-nCoV 體外轉(zhuǎn)錄 RNA 為模板,1-6分別為1、10 、100、1000、104和106Copy,NTC為ddH2O為模板。 上圖為加樣結(jié)束反應(yīng)起始前,下圖為 65 度反應(yīng) 30min 后。
LAMP紅黃變色反應(yīng)
2、A3824-02 搭配 OG 橙綠變色反應(yīng)管(A3821)(肉眼觀察)
以2019-nCoV 體外轉(zhuǎn)錄 RNA 為模板,1-6分別為1、10 、100、1000、104和106Copy,NTC為ddH2O為模板。 上圖為加樣結(jié)束反應(yīng)起始前,下圖為 65 度反應(yīng) 20min 后。
LAMP橙綠變色反應(yīng)
3、A3824-03 用于熒光檢測(便攜式恒溫檢測儀)
以2019-nCoV 體外轉(zhuǎn)錄 RNA 為模板,1-6分別為1、10 、100、1000、104和106Copy,NTC為ddH2O為模板。 上圖為加樣結(jié)束反應(yīng)起始前,下圖為 65 度反應(yīng) 26min 后。
LAMP熒光擴(kuò)增反應(yīng)
4、A3802 用于HNB變色擴(kuò)增反應(yīng)
采用環(huán)引物對7個樣本(HHV-6 DNA核酸模板進(jìn)行恒溫HNB變色檢測反應(yīng)),NTC為不加模板的對照,產(chǎn)物以HNB顯色如下圖。
LAMP HNB變色反應(yīng)
5、首先使用含dUTP的Bst4.0 SYBR Green IsoAmp MasterMix擴(kuò)增獲得三種基因產(chǎn)物(AFSV P72,Covid-19 N Gene-1,Covid-19 N Gene-2),然后以105拷貝的含U產(chǎn)物作為模板,分別用Bst4.0 SYBR Green IsoAmp MasterMix(with UDG)和Bst4.0 SYBR Green IsoAmp MasterMix 進(jìn)行擴(kuò)增,反應(yīng)結(jié)束后統(tǒng)計兩組之間的Ct,結(jié)果為:UDG組在30min內(nèi)幾乎不起峰,無信號;未加UDG組均在4min之前起峰,表明該Bst4.0 SYBR Green IsoAmp MasterMix(with UDG)具有良好的去除殘留模板的能力。
LAMP防污染擴(kuò)增
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