不忘初心,繼續前行。科研這條路,實如萬里長征,有多少教授、醫師兢兢業業堅守崗位,還不忘投身任重而道遠的科學研究工作?今天小編為這路漫漫其修遠兮的科研長征路帶來了一個重磅好消息!look~
圖1 博奧晶典單細胞測序技術
日前,對新成員BD Rhapsody單細胞分析系統,博奧晶典已經完成平臺搭建,并順利完成全部測試,接下來,讓小編帶大家一起來檢驗這個平臺神奇在哪里。
BD Rhapsody 系統由掃描儀和上樣臺兩部分組成
基于10X的單細胞測序平臺近兩年在基礎科研和臨床醫學研究領域大放異彩,但是對于不同的用戶群和實驗,開展單細胞實驗往往需要不同程度的樣本操作,質量和通量,這款BD儀器可以根據具體需求進行配置。BD Rhapsody由掃描儀和上樣儀兩部分組成:其中掃描儀提供自動化細胞計數和細胞活性測試,制備適用于卡式芯片最佳濃度的細胞懸液。掃描儀的配置改善了10X Genomics整個過程盲做的弊端,全程實時監測樣品質量,實驗結果有跡可循,在BD Rhapsody掃描儀中清晰成像,不滿意隨時終止實驗。同時搭載輕巧便攜的BD Rhapsody上樣臺,可在實驗室內輕松移動。
圖2 掃描儀+上樣臺
理論結合實踐,測試實驗馬上開始
高通量群體單細胞測序往往非常昂貴,BD Rhapsody單細胞分析系統設計有多種功能,實現更有效的利用測序來降低實驗成本。采用與10X相似的樣品標簽技術,捕獲mRNA 的poly A尾,BD的單細胞捕獲系統反應孔數量達到了22萬個,細胞懸液由電子移液器注入孔注,自然沉降到U型孔中。包容性強,目前監測細胞通量在100—10000均可,整體環境溫和,對于細胞活性要求低,僅需要達到50%即可輕松上樣。細胞與Beads有效結合后,可當即開展后續實驗,也可以在低溫條件下保存cDNA長達16周;如此,研究者可根據實驗設計按需定制方案,帶給您群體高通量單細胞測序服務最佳的用戶體驗。
圖3 同時標記細胞和mRNA分子的單個Bead概念圖
俗話說“臺上一分鐘,臺下十年功”,在正式實驗開始前,實驗負責人已經整理了幾十頁的實驗操作SOP。本次測試從實驗設計到單細胞懸液的制備以及整個實驗過程中,實驗操作人員敬業的精神,嚴謹細致的科研態度,讓小編頓生欽佩感和自豪感。
圖4 測試實驗過程
實測數據結果展示
本著嚴謹求實的科研態度,此次測試我們選取了5例人外周血單核(PBMC)細胞樣本,分別進行了:單樣本單細胞實驗,混合多樣本的單細胞實驗及平行對照組實驗,數據分析的結果顯示,5組實驗的細胞平均捕獲效率高達79%,為目前市場上所有主流單細胞測序平臺最高。
小編從業以來,也算是見過各種大實驗、新儀器的人,但是此次單細胞測試,為什么如此期待呢?答案即將揭曉!想不想通過一張照片看見數以萬計的細胞真實狀態呢?神奇的Rhapsody掃描儀,給您這個體驗,放大有驚喜。

圖5 混合多樣本的單細胞實驗Rhapsody掃描照片
上圖一次loading了20000個單細胞到芯片,Rhapsody掃描出單細胞19535個,計算下來雙細胞比率約6.5%,最終經數據分析處理,細胞分群結果如下:
圖6 測試數據—細胞分群圖
每一次推出新產品,都是整個團隊星夜兼程,不懈努力的成果,艱難的摸索,優化開發的過程留給我們,愿給您最優質的服務,下面總結一下平臺特色。
BD Rhapsody單細胞平臺優勢
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更低成本:靶向基因檢測,避免看家基因占用的大量測序數據,大大節省了測序和分析成本;
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罕見轉錄本更高檢出率:靶向定制panel,選定特定基因組合,提高UMI計數效率,罕見轉錄本檢測閾值更低;
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超高細胞捕獲效率:高達79%,遠高于市場上目前所有大通量單細胞轉錄組測序技術;
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克服PCR擴增偏差:引入單細胞測序金標準,BD分子標簽,降低非特異性表達;
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實現更高的分辨率:可以分辨更精細、微觀的細胞群和細胞亞種群;
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反轉錄的磁珠超長穩定存儲:完整cDNA可在磁珠微球結構保存長達16周,隨用隨取;
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靈活分樣組合:單次實驗,AbSeq kit其通過獨特的抗體標記的方法,既可以提高樣品通量(最多可12個樣本同時建庫,可等分,可隨機組合);又可以同時進行單細胞蛋白和轉錄組聯合檢測,大大降低成本的同時,也為單細胞多組學研究提供了更高效的平臺。
至此,本次BD Rhapsody平臺單細胞測試實驗已經全部展示完畢,測試圓滿,完結不是結束,而是新的開始,秉持每個博奧晶典人的精神”從芯出發,砥礪前行‘’歡迎每位感興趣的老師按需前來,定制專屬您的單細胞實驗!
博奧晶典單細胞測序平臺簡介
博奧晶典作為國內第一家引進10X Genomics平臺的公司,在國內率先開展上萬級通量的單細胞轉錄組測序服務。目前已經完成了1000多個樣品、50種不同樣品類型的服務,覆蓋的物種和樣品類型包括人和小鼠的肝臟、肺臟、皮膚、心臟、腦、腎臟、血液、卵巢、神經,以及雞、斑馬魚、豬、水稻、擬南芥、油菜、白菜、橄欖等,擁有豐富的項目經驗。
此外,還在大規模單細胞轉錄組測序的數據挖掘上開發了很多新的流程,從樣品制備到數據挖掘,為單細胞轉錄組測序研究提供一站式服務。博奧晶典支持10X Genomics單細胞轉錄組測序國內首篇科研論文發表在《PNAS》,并且目前為止該平臺國內最高分科研論文發表在國際干細胞領域頂級期刊《Cell Stem Cell》。
博奧晶典于2018年9月與BD(中國)成立單細胞研究聯合實驗室,致力于大規模單細胞測序產品的開發和打磨,目前可開展以下單細胞測序產品的服務。

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