Peko Green(TM) 雙鏈核酸染料的使用方法-公司介紹-資訊-生物在線(xiàn)

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Peko Green(TM) 雙鏈核酸染料的使用方法

作者:西安百螢生物科技有限公司 2014-04-15T00:00 (訪問(wèn)量:5902)

產(chǎn)品簡(jiǎn)介:
??? 對(duì)微量的雙鏈DNA進(jìn)行定量在各種生物學(xué)應(yīng)用中都顯得非常重要。例如cDNA文庫(kù)的構(gòu)建,亞克隆的DNA
片段的純化,定量DNA擴(kuò)增產(chǎn)物,在藥物中DNA分子殘留的測(cè)定等。檢測(cè)核酸濃度最常用的方法就是檢測(cè)
核酸再260nm (A260)處的光吸收,此方法主要的缺點(diǎn)是單鏈核酸和單核苷酸會(huì)產(chǎn)生干擾信號(hào),核酸樣品中的雜質(zhì)也會(huì)影向結(jié)果。光吸收不能區(qū)分DNA和RNA,靈敏度也相對(duì)較低(用1cm的比色杯在A260值為0.1時(shí)相對(duì)應(yīng)的雙鏈DNA濃度為5μg/mL)。Peko Green(TM) 染料是一種新型的dDNA染料。其檢測(cè)靈敏度高,可檢測(cè)到pg級(jí)DNA。檢測(cè)范圍寬,可跨越4個(gè)數(shù)量級(jí)。特異性好,基本不受ssDNA和RNA的影響,并且可以耐受一定濃度的鹽,尿素,已醇,氯仿,去垢劑,蛋白等干擾。目前使用Peko Green(TM) 染料定量檢測(cè)DNA已經(jīng)廣泛用于生物學(xué)檢測(cè)。

光學(xué)性質(zhì):
激發(fā)波長(zhǎng)= 502 nm
發(fā)射波長(zhǎng)= 523 nm

實(shí)驗(yàn)方法:
1. 試劑準(zhǔn)備
Peko Green是以1毫升的濃縮液形式保存在無(wú)水DMSO(二甲基亞砜)中。實(shí)驗(yàn)當(dāng)天,配制2x Peko
Green試劑的工作溶液,用1xTE液(10mM的Tris-HCl,1mM EDTA中,pH值為7.5)按1:200的比例稀釋濃縮液。如果要準(zhǔn)備好足夠的工作液檢測(cè)20個(gè)樣品,可在20毫升1xTE加入100mL Peko Green dsDNA定量試劑。由于試劑容易吸附到玻璃表面,要在一個(gè)塑料容器中配制。Peko Green試劑容易光降解,所以應(yīng)將配好的溶液用箔包主或放置暗處避光保存。

溶液最好在配制數(shù)小時(shí)內(nèi)使用,以保證最佳結(jié)果。
2.DNA標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)
* 標(biāo)準(zhǔn)品工作液的配制:Sigma小牛胸腺DNA干粉(貨號(hào):D4522-1MG)1mg (Tris,
NaCL等濃度已成標(biāo)準(zhǔn)體系),加入1mL雙蒸水,配制成1mg/mL的標(biāo)準(zhǔn)工作液。
* 標(biāo)準(zhǔn)品工作液的稀釋?zhuān)?BR>* 母液稀釋?zhuān)喝?0mL(1mg/mL) 標(biāo)準(zhǔn)品工作液加入到990
mLTE溶液中,稀釋成10mg/mL。再取10mL(10mg/mL)標(biāo)準(zhǔn)品工作液加入到990
mLTE溶液中,稀釋成100ng/mL。
* 倍比稀釋?zhuān)喝?00mL(100ng/mL) 標(biāo)準(zhǔn)品工作液加入到200
mLTE溶液中,稀釋成80ng/mL(藥典規(guī)定:熒光染色方法DNA含量在。25-
80ng/mL范圍線(xiàn)性較好,此方法DNA檢出限為0.3ng/mL)。再取500mL(80ng/mL)標(biāo)準(zhǔn)品工作
液加入到500
mLTE溶液中,濃度稀釋到40ng/mL。然后按倍比稀釋成20ng/mL,10ng/mL,5ng/mL,2.5ng/m
L,1.25ng/mL,0.625ng/mL的標(biāo)準(zhǔn)品溶液,見(jiàn)表1。
1標(biāo)準(zhǔn)品工作液及樣品排續(xù)在一個(gè)實(shí)心的黑色96孔板*
S0 DS0? …. ….
樣品 樣品
S1? DS1? …. …. …. ….
S2? DS2
S3? DS3
S4? DS4
S5? DS5
S6 DS6
S7 DS7注: DS= 標(biāo)準(zhǔn)品工作液從0到40ng/mL平行樣品。
雙鏈DNA樣品分析:
* 倍比稀釋后的各梯度標(biāo)準(zhǔn)品溶液,樣品,和染料工作液各取100mL混勻,避光室溫放置5分鐘見(jiàn)表1。
備注: 如果用 384孔板, 則倍比稀釋后的各梯度標(biāo)準(zhǔn)品溶液,樣品,和染料工作液各取25mL即可。
* 用熒光酶標(biāo)儀在激發(fā)/發(fā)射波長(zhǎng)= 490/525 nm(截止波長(zhǎng)為510 nm)檢測(cè)熒光強(qiáng)度。
* 樣品DNA 含量可根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)品曲線(xiàn)算出。
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