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? ? ? ??近年來,單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)獲得快速發(fā)展,尤其是大通量單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序突破了傳統(tǒng)技術(shù)的低通量、高成本等局限;而其中基于微液滴技術(shù)的大規(guī)模單細(xì)胞分選平臺(tái)的出現(xiàn),更可一次性實(shí)現(xiàn)數(shù)十萬數(shù)量級(jí)細(xì)胞的表達(dá)圖譜構(gòu)建,可用于解析各個(gè)器官或者組織細(xì)胞復(fù)雜的基因網(wǎng)絡(luò)在單個(gè)細(xì)胞中的運(yùn)作機(jī)制,可了解各個(gè)細(xì)胞中這些網(wǎng)絡(luò)有何差異,以及各種細(xì)胞群體如何協(xié)同工作。
? ? ? ?2017年,基于大規(guī)模單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的重磅研究取得豐碩成果,并且各項(xiàng)大型計(jì)劃的提出,更加“引爆”了大規(guī)模單細(xì)胞測(cè)序技術(shù),指引生命科學(xué)研究進(jìn)入單細(xì)胞測(cè)序新時(shí)代。
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下面小編就來給大家盤點(diǎn)一下2017大規(guī)模單細(xì)胞研究大事件
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? 10X Genomics 助力大規(guī)模單細(xì)胞 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析技術(shù) ? 2017年1月,10X Genomics 公司和 Fred Hutch 的團(tuán)隊(duì)利用基于液滴的方法,讓單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究得以加速,從單個(gè)細(xì)胞到群體單細(xì)胞研究,相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在《Nature Communication》。 這項(xiàng)新的單細(xì)胞RNA測(cè)序方法,可實(shí)現(xiàn)數(shù)千個(gè)免疫細(xì)胞或者其他類型細(xì)胞的分析。
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? 《Cell》:中國學(xué)者團(tuán)隊(duì)首次通過 大規(guī)模單細(xì)胞測(cè)序,發(fā)布肝癌免疫圖譜 ? 2017年6月16日,中國學(xué)者團(tuán)隊(duì)《Cell》雜志發(fā)布重大研究成果,題目為“Landscape of infiltrating T cells in liver cancer revealed by single-cell sequencing”的研究論文,首次在單細(xì)胞水平上描繪了肝癌微環(huán)境中的免疫圖譜,深刻了解肝癌的腫瘤免疫微環(huán)境來探索新的腫瘤免疫療法及尋找新靶點(diǎn)和有效的生物標(biāo)志物,對(duì)于肝癌的診斷和治療具有重大意義。 這項(xiàng)研究結(jié)果,為構(gòu)建其他腫瘤(肺癌等)的單細(xì)胞水平免疫圖譜提供了系統(tǒng)的研究方法和思路。
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Nature 特刊,生命科學(xué)研究 進(jìn)入大規(guī)模單細(xì)胞研究的生物學(xué)時(shí)代 ? 2017年7月5日,《Nature》特刊發(fā)布單細(xì)胞測(cè)序進(jìn)入生物學(xué)時(shí)代;Nature 聚焦于生命的最基本單位:細(xì)胞;單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的發(fā)展使我們能夠在單細(xì)胞層面繪制復(fù)雜機(jī)體的細(xì)胞圖譜,追蹤細(xì)胞世系以及發(fā)育和分化機(jī)制,探索機(jī)體中究竟存在多少類型的細(xì)胞、它們的作用及發(fā)展過程。 單細(xì)胞技術(shù)的快速發(fā)展,并將經(jīng)典細(xì)胞生物學(xué)、發(fā)育生物學(xué)、基因組學(xué)和計(jì)算生物學(xué)引入單細(xì)胞層面,從而更加多維度分析復(fù)雜的細(xì)胞,探索細(xì)胞進(jìn)入新的科研領(lǐng)域。
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? 高通量的單核RNA測(cè)序新方法:sNuc-Seq, 引領(lǐng)生命科學(xué)研究 進(jìn)入大規(guī)模單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序 ? 2017年8月28日,Nature Methods 雜志發(fā)表題為《Massively Parallel Single-Nucleus RNA-Seq with DroNc-Seq》的文章,將sNuc-Seq技術(shù)與微流控技術(shù)相結(jié)合,可分析結(jié)構(gòu)復(fù)雜的組織中大量細(xì)胞的細(xì)胞核RNA,進(jìn)行大規(guī)模的基因表達(dá)檢測(cè),引領(lǐng)生命科學(xué)研究進(jìn)入大規(guī)模單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。其可應(yīng)用于各種癌癥和神經(jīng)退行性疾病,如阿爾茨海默氏癥或腫瘤的異質(zhì)性,甚至正常腦老化過程的研究,以及“人體細(xì)胞圖譜計(jì)劃項(xiàng)目”。
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促進(jìn)精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)發(fā)展, 中國人血細(xì)胞分子圖譜研究聯(lián)盟成立 2017年9月,由中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院和中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院血液病醫(yī)院牽頭,成立人血細(xì)胞分子圖譜(Atlas of Blood Cells,ABC)研究聯(lián)盟,全面解析并繪制單細(xì)胞水平的正常人以及各類血液病患者的血細(xì)胞分子圖譜及其異質(zhì)性規(guī)律。其目的是繪制中國首個(gè)人類生理、病理的血細(xì)胞圖譜,以期為國內(nèi)外血細(xì)胞研究提供綜合參考目錄,為我國血液疾病早期診斷和治療提供新的技術(shù)及策略,使我國在國際細(xì)胞分子圖譜和血細(xì)胞研究領(lǐng)域?qū)崿F(xiàn)率先理論突破和臨床轉(zhuǎn)化。
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“人類細(xì)胞圖譜計(jì)劃”首批38個(gè)項(xiàng)目公布, 清華大學(xué)張學(xué)工團(tuán)隊(duì)入選 ? 2017年10月16日,與“人類基因組計(jì)劃”相媲美的“人類細(xì)胞圖譜計(jì)劃” 首批擬資助的38個(gè)項(xiàng)目正式公布。清華大學(xué)張學(xué)工負(fù)責(zé)的項(xiàng)目是其中唯一一個(gè)由中國科學(xué)家承擔(dān)的項(xiàng)目。主要方向:腦、免疫、組織處理、胃腸道、皮膚和技術(shù)研發(fā)等。 
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Science專刊: Single-cell Genomics 獨(dú)領(lǐng)風(fēng)* ? 2017年10月,《Science》雜志的封面特刊聚焦單細(xì)胞基因組學(xué)(Single-cell Genomics),從單細(xì)胞組學(xué)水平暢談了人類對(duì)免疫系統(tǒng)和腦神經(jīng)系統(tǒng)的新認(rèn)識(shí),以及單細(xì)胞表觀遺傳學(xué)的新進(jìn)展,并對(duì)“人類細(xì)胞圖譜”計(jì)劃寄以厚望。 解讀每個(gè)細(xì)胞的“指紋”,單細(xì)胞組學(xué)在行動(dòng) 《科學(xué)》雜志封面圖里的科學(xué)家們用放大鏡就解開了單個(gè)細(xì)胞的遺傳學(xué)秘密;現(xiàn)實(shí)中的科學(xué)家們則需要依賴日益成熟的單細(xì)胞組學(xué)技術(shù)來解讀“指紋”信息。了解單個(gè)細(xì)胞層面的生命信息將協(xié)助揭開更多生命的奧秘。
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《Nature》:大規(guī)模單細(xì)胞RNA測(cè)序 繪制首張高分辨率小腸上皮細(xì)胞表達(dá)圖譜 ? 2017年11月08日,由博德研究所和馬薩諸塞州總醫(yī)院領(lǐng)導(dǎo)的多中心研究小組于《Nature》期刊發(fā)布了首張高分辨率的小腸上皮細(xì)胞基因表達(dá)圖譜,題目為《A singlecell survey of the small intestinal epithelium》,解析了腸道細(xì)胞產(chǎn)生的激素等其他信號(hào)物質(zhì),并為腸道如何應(yīng)對(duì)病原體入侵提供了新的線索,其為后續(xù)構(gòu)建其他組織或者器官的細(xì)胞圖譜提供系統(tǒng)的的方法和參考經(jīng)驗(yàn)。 
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《Cell》發(fā)布重大突破, 6000個(gè)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序 繪制頭頸部癌癥史上最清晰細(xì)胞圖譜! Cell 雜志11月30日在線發(fā)表了題為《Single-Cell Transcriptomic Analysis of Primary and Metastatic Tumor Ecosystems in Head and Neck Cancer》的文章,報(bào)道大規(guī)模單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序在頭頸部鱗狀細(xì)胞癌(HNSCC)中的研究結(jié)果。 該研究結(jié)果揭示了頭頸部腫瘤中存在部分上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)變(p-EMT)的細(xì)胞,這些細(xì)胞從腫瘤組織整齊的結(jié)構(gòu)中轉(zhuǎn)變成不規(guī)則的結(jié)構(gòu),然后被擠壓到周圍環(huán)境中,從而有可能侵入并擴(kuò)散到身體的其他部位。這項(xiàng)研究創(chuàng)造了頭頸部腫瘤的第一個(gè)細(xì)胞圖譜,揭示了頭頸部腫瘤及其轉(zhuǎn)移的許多不同類型的細(xì)胞。
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? 博奧晶典10X Genomics平臺(tái)優(yōu)勢(shì) 博奧晶典作為國內(nèi)第一家引進(jìn)10X Genomics平臺(tái)的公司,在國內(nèi)率先開展上萬級(jí)通量的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序服務(wù)。目前已經(jīng)完成了300多個(gè)樣品、30種不同樣品類型的服務(wù),覆蓋的物種和樣品類型包括人和小鼠的肝臟、肺臟、皮膚、心臟、腦、腎臟、血液、卵巢、神經(jīng),以及雞、斑馬魚、豬、水稻、擬南芥、油菜、白菜、橄欖等,擁有豐富的項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)。此外,還在大規(guī)模單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的數(shù)據(jù)挖掘上開發(fā)了很多新的流程,為單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序研究提供一站式服務(wù)。
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博奧晶典科研服務(wù)事業(yè)部商桂娜、李媛媛 | 文案
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