BioNano系統(tǒng),讓基因拼接如虎添翼
時間:2013年4月18日 來源:晶能生物
第二代測序的出現(xiàn)實現(xiàn)了低成本高通量的基因組測序,但是100bp左右的短讀長卻嚴(yán)重限制了基因組的完整拼接。尤其是當(dāng)遇到長片段的重復(fù)序列時,傳統(tǒng)的contig組裝和De novo拼接只能面對缺口望洋興嘆。為了掌握直觀而全面的基因組結(jié)構(gòu)信息,挖掘出其中的生物學(xué)奧秘,科學(xué)家們迫切期盼著一種簡化基因組拼接的新技術(shù)。
BioNano公司站在了基因組拼接的最前線。他們推出了Irys系統(tǒng)用于長鏈DNA的單分子成像。該系統(tǒng)利用單酶酶切和熒光標(biāo)記對長達幾百kb的單鏈DNA分子進行成像,利用高質(zhì)量圖像使基因組結(jié)構(gòu)通過酶切圖譜的方式展現(xiàn)無遺。Irys特有的超長序列讀長能夠輕松跨越重復(fù)片段和一些包含復(fù)雜元件的區(qū)域,在大大簡化基因組組裝的同時也讓困擾NGS技術(shù)的拼接缺口無處遁形。
已有文章利用該技術(shù)快速將節(jié)節(jié)麥的2.1M高重復(fù)區(qū)域的組裝完整性由75%提升至95%,技術(shù)平臺操作的簡便性和結(jié)果的準(zhǔn)確性力證了Irys技術(shù)的廣闊應(yīng)用前景。BioNano單分子成像技術(shù)無疑為全基因組結(jié)構(gòu)研究,尤其是De novo和染色體結(jié)構(gòu)變異方面提供了全新的研究方法。
作為BioNano在中國唯一的服務(wù)商,晶能生物技術(shù)有限公司致力于為廣大客戶提供最為**和完善的生物技術(shù)服務(wù)。日前,晶能生物已經(jīng)配備了國內(nèi)首套BioNano系統(tǒng),并同時推出了BioNano單分子測序服務(wù)。憑借晶能生物雄厚的科研力量和完善的服務(wù)體系,相信該服務(wù)的推出必將為國內(nèi)生物技術(shù)服務(wù)行業(yè)的發(fā)展注入新的活力。
(文:林泓)
參考文獻:
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