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科研服務(wù) | II型糖尿病circRNA Biomarker研究新成果
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?????? 研究背景
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糖尿病（Diabetes）已經(jīng)成為世界上繼腫瘤、心腦血管病之后第三位嚴(yán)重危害人類健康的慢性疾病。全世界的糖尿病發(fā)病率，依然有逐年增高的趨勢(shì)。II型糖尿病原名叫成人發(fā)病型糖尿病，占糖尿病患者90%以上。
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鄭州大學(xué)附屬河南省人民醫(yī)院李牧蔚教授課題組的趙振舟和李雪潔等研究者，采用博奧晶典人類環(huán)狀RNA芯片 v2篩選II型糖尿病病人外周血中表達(dá)明顯升高的circRNA，并研究了circRNA作為前糖尿病和II型糖尿病的診斷標(biāo)記物的靈敏度和特異性，為II型糖尿病的診斷和治療提供了新的思路。
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技術(shù)路線
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主要結(jié)果展示
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1. 博奧晶典人類環(huán)狀RNA芯片v2高通量篩選circRNA
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研究者選擇了臨床和統(tǒng)計(jì)學(xué)特征相匹配的6個(gè)對(duì)照組個(gè)體和6個(gè)糖尿病組患者，用博奧晶典人類環(huán)狀RNA芯片v2對(duì)外周血中的circRNA表達(dá)分析，結(jié)果共找到489個(gè)circRNA在糖尿病患者和對(duì)照組個(gè)體之間存在明顯的表達(dá)差異，其中78個(gè)circRNA在糖尿病患者外周血中表達(dá)上調(diào)，411個(gè)表達(dá)下調(diào)。
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2. qPCR驗(yàn)證芯片結(jié)果
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按FC＞2.4，p＜0.01篩選共得到5條circRNA，本研究在另外一個(gè)獨(dú)立隊(duì)列（對(duì)照組, n=20; 糖尿病前期group, n=20; Ⅱ型糖尿病組, n=20）中通過qPCR對(duì)其進(jìn)行了驗(yàn)證，hsa_circ_0139110和hsa_circ_0018508在三個(gè)組中的表達(dá)量無明顯差異，hsa_circ_0124636在前糖尿病和糖尿病組表達(dá)無差異，但均高于對(duì)照組，hsa_circ_0054633和hsa_circ_0068087在三組間表達(dá)存在統(tǒng)計(jì)學(xué)差異，且在對(duì)照組，前糖尿病組，T2DM組中的表達(dá)量依次增高。
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3. 差異表達(dá)circRNA的ROC分析
為了分析兩種circRNA的對(duì)前糖尿病及Ⅱ型糖尿病的診斷價(jià)值，研究者分別對(duì)其進(jìn)行了ROC分析，結(jié)果hsa_circ_0054633在診斷糖尿病危險(xiǎn)增高以及II型糖尿病時(shí)的AUC分別為：0.747（95%CI=[0.589-0.906],p=0.007 ）, 0.720（95%CI =[0.562-0.878],p=0.017 ）.hsa_circ_0068087在診斷糖尿病危險(xiǎn)增高以及Ⅱ型糖尿病時(shí)的AUC分別為：0.692（95%CI =[0.529-0.856],p=0.037），0.717（95%CI = [0.557-0.878], p =0.019）。考慮到hsa_circ_0054633和hsa_circ_0068087相比擁有更大的AUC和更小的P值，因此選擇hsa_circ_0054633作為診斷前糖尿病和Ⅱ型糖尿病的biomarker。
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4.擴(kuò)大臨床樣本驗(yàn)證circRNA biomarker
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為了檢驗(yàn)所篩選出的biomarker的臨床診斷能力，研究者在更大的隊(duì)列（對(duì)照組, n=60; 糖尿病前期組, n=63; 糖尿病組, n=64）中對(duì)hsa_circ_0054633進(jìn)行了檢測(cè)，結(jié)果發(fā)現(xiàn)hsa_circ_0054633在對(duì)照組，糖尿病前期組，Ⅱ型糖尿病組中表達(dá)量依次升高，作為biomarker在診斷糖尿病危險(xiǎn)增高以及II型糖尿病時(shí)AUC分別為：0.751（95%CI=[0.666-0.835],P＜0.001), 0.793 ( 95%CI=[0.716-0.871], p＜0.001), 將吸煙，高血壓，BMI，TC，TG，HDL，LDL等糖尿病危險(xiǎn)因素加入之后AUC分別提升至: 0.841，0.834。
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小編說
由于糖尿病早期空腹血糖受損和糖耐量異常階段沒有明顯的臨床癥狀，所以糖尿病的早期診斷顯得非常困難，病人往往出現(xiàn)明顯的臨床癥狀或嚴(yán)重并發(fā)癥（如腎衰、心血管并發(fā)癥、視網(wǎng)膜病變等）才進(jìn)行診治，這給病人的治療造成了不可逆轉(zhuǎn)的延誤。
近期的明星RNA分子，circRNAs已被證實(shí)參與了多種疾病的病理過程，但是II型糖尿病患者外周血中circRNA的表達(dá)特點(diǎn)，以及是否存在可用于診斷糖尿病前期和II型糖尿病biomarker的circRNA，目前尚無研究；本研究通過前期高通量circRNA芯片篩選和后續(xù)大量臨床樣本的有力驗(yàn)證，確定hsa_circ_0054633有臨床潛力，可作為II型糖尿病診斷的biomarker。本研究選出的circRNA biomarker，具有取材方便，費(fèi)用低廉，有較高的診斷價(jià)值和方便、快捷的診斷流程等優(yōu)點(diǎn)。
參考文獻(xiàn)
Zhao Z, Li X, Jian D, etal. Hsa_circ_0054633 in peripheral blood can be used as a diagnosticbiomarker of pre-diabetes and type 2 diabetes mellitus [J]. Acta Diabetologica,2016: 1-9.（IF=3.008）
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博奧晶典人類環(huán)狀RNA芯片v2
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為了能夠幫助廣大科研工作者對(duì)circRNA進(jìn)行更好地研究，北京博奧晶典生物技術(shù)有限公司在博奧晶典人類環(huán)狀RNA芯片v1的基礎(chǔ)上全新升級(jí)為v2。該芯片為目前國(guó)內(nèi)、國(guó)外市場(chǎng)circRNA檢測(cè)數(shù)量最多的芯片，便于研究者對(duì)不同生理和病理狀態(tài)下circRNA的表達(dá)變化進(jìn)行系統(tǒng)的研究，如進(jìn)行疾病 biomarker 研究、功能研究、與 mRNA、miRNA 相互作用研究等。
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超高性價(jià)比的博奧晶典人類環(huán)狀RNA芯片v2給您無限期待!
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芯片特點(diǎn)
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? circRNA數(shù)量多 芯片全面覆蓋Circbase，Deepbase等數(shù)據(jù)庫(kù)，檢測(cè)circRNA數(shù)量達(dá)到170,340種，是國(guó)內(nèi)和國(guó)外市場(chǎng)上檢測(cè)數(shù)量最多的芯片。
? 探針的特異性強(qiáng) 芯片探針覆蓋circRNA反向剪切位點(diǎn)，特異性高。一般情況下，該位點(diǎn)的序列不存在于基因組DNA和線性RNA分子中。
? 芯片檢測(cè)效率高 芯片探針的靶向檢測(cè)與二代測(cè)序的隨機(jī)測(cè)序相比具有更高的檢測(cè)效率。一次芯片實(shí)驗(yàn)檢測(cè)circRNA數(shù)量遠(yuǎn)高于常規(guī)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序（5-10G數(shù)據(jù)量）。
? 芯片的準(zhǔn)確性好 芯片開發(fā)過程中的測(cè)試結(jié)果表明，高達(dá)74%的差異circRNA能得到定量PCR驗(yàn)證支持。
博奧晶典circRNA芯片系列
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芯片名稱 |
circRNA來源 |
circRNA數(shù)量 |
芯片格式 |
芯片檢測(cè)數(shù)量 |
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博奧晶典人類環(huán)狀RNA芯片v2 |
Circbase Deepbase Mol Cel,2015 |
92,375 142,404 65,731 |
4x180 K |
170,340 (單探針) |
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博奧晶典小鼠環(huán)狀RNA芯片v1 |
Circbase Mol Cel, 2015 Gen Bio, 2015 Gen Bio, 2014 Nat Neurosci ,2015 |
1,903 15,849 2,891 7,112 28,482 |
8x60 K |
30,536 (雙探針) |
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博奧晶典大鼠環(huán)狀RNA芯片v1 |
? Nat Neurosci ,2015 |
? 18,076 |
4x44 K |
18,075 (雙探針) |
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博奧晶典circRNA科研服務(wù)，不僅提供芯片檢測(cè)服務(wù)，也提供circRNA-Seq檢測(cè)服務(wù)。
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產(chǎn)品咨詢
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bioservice@capitalbiotech.com
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閱讀原文了解circRNA-Seq產(chǎn)品詳情
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博奧晶典科研服務(wù)事業(yè)部 李青、吳潔、張西軒 | 文案
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