科研服務(wù) | 一種新的冠心病診斷Biomarker被發(fā)現(xiàn)
?
?
?
在醫(yī)院里，各個(gè)科室的就診人數(shù)在不同的時(shí)間段都是不同的，但是有一個(gè)科室，無論什么時(shí)候都門庭若市，永遠(yuǎn)是排著長(zhǎng)隊(duì)——這就是心血管病科。冠狀動(dòng)脈粥樣硬性心臟病（CAD）對(duì)于公共健康具有重大的影響，據(jù)世界衛(wèi)生組織（WHO）2014年統(tǒng)計(jì)，2012年全世界范圍內(nèi)，心血管疾病是非傳染性疾病死亡的主要原因，冠心病因其在世界范圍內(nèi)的高發(fā)病率和死亡率對(duì)人群健康和社會(huì)經(jīng)濟(jì)造成了很大的負(fù)擔(dān)。
?
冠心病病人中，很大一部分往往在出現(xiàn)了胸痛、心衰等明顯臨床癥狀后才到醫(yī)院就診，被確診時(shí)冠脈已經(jīng)明顯狹窄或閉塞，延誤了最佳的干預(yù)時(shí)機(jī)，因此冠心病的早期診斷，對(duì)于其治療就顯得尤為重要。
?
1月3日，鄭州大學(xué)附屬河南省人民醫(yī)院心血管內(nèi)科李牧蔚教授課題組在Scientific Reports雜志發(fā)表了研究論文，報(bào)道發(fā)現(xiàn)環(huán)狀RNA hsa_circ_0124644可用于冠狀動(dòng)脈疾病的診斷。
?
研 究 背 景
?
現(xiàn)有的研究表明circRNA與腫瘤，心肌肥大引起的心衰，肺纖維化，肌強(qiáng)直營(yíng)養(yǎng)不良，阿爾茲海默病等諸多疾病均有著密切的關(guān)系。
?
?
?
鄭州大學(xué)附屬河南省人民醫(yī)院李牧蔚教授課題組的趙振舟和李雪潔等研究者，采用博奧晶典人類環(huán)狀RNA芯片 v2篩選得到冠心病病人外周血中表達(dá)明顯升高的circRNA，并研究了circRNA作為冠心病的診斷標(biāo)志物的靈敏度和特異性，對(duì)于冠心病的診斷和治療提供了新的思路。
?
技 術(shù) 路 線
?
?
?
研 究 結(jié) 果
1.博奧晶典人類環(huán)狀RNA芯片v2高通量篩選circRNA
研究者選擇了臨床和統(tǒng)計(jì)學(xué)特征相匹配的12個(gè)對(duì)照組個(gè)體和12個(gè)冠心病組患者，取全血，用博奧晶典人類環(huán)狀RNA芯片v2對(duì)全血中的circRNA表達(dá)分析，結(jié)果發(fā)現(xiàn)兩組共有22個(gè)circRNA有差異性表達(dá)，其中在冠心病患者血液中表達(dá)上調(diào)的有12個(gè)，表達(dá)下調(diào)的有10個(gè)。
?
?
2. qPCR驗(yàn)證芯片結(jié)果
按p＜0.01篩選共得到5條circRNA，本研究在另外一個(gè)獨(dú)立隊(duì)列（對(duì)照組, n=30; 冠心病組, n=30）中通過qPCR對(duì)其進(jìn)行了驗(yàn)證，最后得到的結(jié)果與微陣列分析結(jié)果相符，與在對(duì)照組外周血中的表達(dá)量相比，這5個(gè)circRNA在冠心病組中的表達(dá)量均明顯提高。
?
?
3.差異表達(dá)circRNA的ROC分析
為了比較這5個(gè)候選的circRNA對(duì)冠心病的臨床診斷能力，研究者分別對(duì)其進(jìn)行了ROC分析，結(jié)果如下圖，其中hsa_circ_0124644的靈敏度和特異度最高，分別為：86.7%和76.7%。
?
?
4. 在獨(dú)立臨床樣本中驗(yàn)證circRNA-biomarker
為了測(cè)試所hsa_circ_0124644的實(shí)際診斷價(jià)值，在另一個(gè)獨(dú)立隊(duì)列（115名對(duì)照組個(gè)體，137名冠心病組個(gè)體）中進(jìn)行驗(yàn)證。結(jié)果顯示hsa_circ_0124644在冠心病組的表達(dá)水平明顯上調(diào)，ROC分析表明其AUC為0.769（[0.710-0.827],p＜0.001，靈敏度為0.861，特異度為0.626）。在將糖尿病，吸煙，低密度，膽固醇，高血壓這些冠心病的危險(xiǎn)因素加入之后，AUC輕度的提升到了0.804（[0.751-0.857],p＜0.001)，表明了較好的診斷價(jià)值。
?
?
?
?
研 究 結(jié) 論
?
?
?
?
近期的明星RNA分子，circRNAs，已被證實(shí)參與了多種疾病的的病理過程，但是冠心病患者外周血中circRNA的表達(dá)特點(diǎn)，以及是否存在可作為診斷冠心病biomarker的circRNA，目前尚未經(jīng)證實(shí)；本研究通過前期高通量circRNA芯片篩選和后續(xù)大量臨床樣本的有力驗(yàn)證，確定Hsa_circ_0124644在臨床的確有潛力，可作為冠心病診斷的biomarker。本研究選出的circRNA biomarker，具有取材方便，費(fèi)用低廉，有較高的診斷價(jià)值和方便、快捷的診斷流程等優(yōu)點(diǎn)。
?
文 獻(xiàn) 信 息
Zhao Z, Li X, Gao C, etal. Peripheral blood circular RNA hsa_circ_0124644 can be used as adiagnostic biomarker of coronary artery disease[J]. Scientific Reports, 2017, 7 : 39918.（IF=5.228）
?
?
博奧晶典人類環(huán)狀RNA芯片 v2
為了幫助廣大科研工作者對(duì)circRNA更好地研究，北京博奧晶典生物技術(shù)有限公司在人類環(huán)狀RNA芯片v1的基礎(chǔ)上全新升級(jí)為v2，該芯片是目前國(guó)內(nèi)外市場(chǎng)檢測(cè)circRNA數(shù)量最多的芯片，便于研究者對(duì)不同生理和病理狀態(tài)下circRNA的表達(dá)變化進(jìn)行系統(tǒng)研究，如進(jìn)行疾病 biomarker 研究、功能研究、與 mRNA、miRNA 相互作用。
?
博奧晶典人類環(huán)狀RNA芯片v2的超高性價(jià)比給您無限期待！
?
芯片特點(diǎn)
? circRNA數(shù)量多 芯片全面覆蓋Circbase，Deepbase等數(shù)據(jù)庫(kù)，檢測(cè)circRNA數(shù)量達(dá)到170,340種，是國(guó)內(nèi)和國(guó)外市場(chǎng)上檢測(cè)數(shù)量最多的芯片。
? 探針的特異性強(qiáng) 芯片探針覆蓋circRNA反向剪切位點(diǎn)，特異性高。一般情況下，該位點(diǎn)的序列不存在于基因組DNA和線性RNA分子中。
? 芯片檢測(cè)效率高 芯片探針的靶向檢測(cè)與二代測(cè)序的隨機(jī)測(cè)序相比具有更高的檢測(cè)效率。一次芯片實(shí)驗(yàn)檢測(cè)circRNA數(shù)量遠(yuǎn)高于常規(guī)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序（5-10G數(shù)據(jù)量）。
? 芯片的準(zhǔn)確性好 芯片開發(fā)過程中的測(cè)試結(jié)果表明，高達(dá)74%的差異circRNA能得到定量PCR驗(yàn)證支持。
?
博奧晶典circRNA芯片產(chǎn)品
?
|
芯片 名稱 |
circRNA 來源 |
circRNA 數(shù)量 |
芯片 格式 |
芯片檢測(cè) 數(shù)量 |
|
博奧晶典人類環(huán)狀RNA芯片v2 |
Circbase Deepbase Mol Cel,2015 |
92,375 142,404 65,731 |
4x180K |
? 170,340 (單探針) |
|
? 博奧晶典小鼠環(huán)狀RNA芯片v1 |
Circbase Mol Cel, 2015 Gen Bio, 2015 Gen Bio,2014 Nat Neurosci ,2015 |
1,903 15,849 2,891 7,112 28,482 |
? 8x60K |
? 30,536 (雙探針) |
|
博奧晶典大鼠環(huán)狀RNA芯片v1 |
? ? Nat Neurosci ,2015 |
? ? 18,076 |
? ? 4x44K |
? ? 18,075 (雙探針) |
?
?
博奧晶典circRNA科研服務(wù)，不僅提供芯片檢測(cè)服務(wù)，也提供circRNA-Seq檢測(cè)服務(wù)。
?
產(chǎn)品咨詢：
bioservice@capitalbiotech.com
?
博奧晶典科研服務(wù)事業(yè)部 李青、吳潔、張西軒 |文案
部分配圖來源于網(wǎng)絡(luò)，侵刪