項目文章|單細胞轉(zhuǎn)錄組測序揭示錳離子在腫瘤NK細胞功能調(diào)控中的角色-技術(shù)前沿-資訊-生物在線

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項目文章|單細胞轉(zhuǎn)錄組測序揭示錳離子在腫瘤NK細胞功能調(diào)控中的角色

作者:上海伯豪生物技術(shù)有限公司 2024-12-11T00:00 (訪問量:33942)

期刊:MedComm

影響因子:10.7

伯豪技術(shù)服務(wù)產(chǎn)品:單細胞轉(zhuǎn)錄組測序、伯優(yōu)®單細胞測序組織/細胞保存液

 

導(dǎo)語

研究背景:NK細胞在固有免疫和適應(yīng)性免疫中均有重要的作用,Mn2+激活cGAS-STING通路,但該機制對NK細胞的影響尚不明確。

科學(xué)問題:Mn2+如何調(diào)控NK細胞的激活。

實驗材料:C57BL/6小鼠、NK-92MI細胞系、人類和小鼠的原代NK細胞。

表型:Mn2+處理顯著抑制小鼠黑色素瘤生長,且NK細胞在這一過程中受到Mn2+調(diào)控。

機制:Mn2+激活NK細胞中的cGAS-STING通路,激活UTX的表達,提升NK細胞的響應(yīng),直接增強NK細胞的細胞毒性和細胞因子分泌,并通過NK細胞間接激活CD8+ T細胞。

 

主要技術(shù)

單細胞轉(zhuǎn)錄組測序

(技術(shù)服務(wù)由伯豪生物提供)

 

研究結(jié)果

1. Mn2+的抗腫瘤效應(yīng)依賴于NK細胞

作者通過向C57BL/6小鼠中注射小鼠黑色素瘤細胞B16F10,構(gòu)建腫瘤模型,分四次腹腔注射MnCl2,觀察到Mn2+處理顯著抑制腫瘤生長,NK細胞、CD8+T細胞等均有顯著增加,NK細胞具有更強的抗腫瘤活性(Fig. 1A-D, S1A, B)。

為了探究Mn2+抗癌的主要影響因素,作者設(shè)計了Rag1全身性敲除(Rag1-/-)的免疫缺陷性小鼠,阻斷T細胞和B細胞的發(fā)育和分化。在排除了T細胞和B細胞的影響后,Mn2+的抗腫瘤能力依舊顯著強于對照組,另一方面,Mn2+處理組中的NK細胞的激活水平也顯著高于對照組(Fig. 1F, G)。在使用NK細胞抑制劑處理后,腫瘤生長顯著上調(diào),而Mn2+的抗腫瘤效應(yīng)下調(diào)(Fig. 1H, I, J)。回補Mn2+,有部分CD8+ T細胞受到激活,腫瘤的生長因此受到部分抑制(Fig. 1I, J, K)。如上結(jié)果暗示了NK細胞在Mn2+介導(dǎo)的抗腫瘤效應(yīng)中發(fā)揮的關(guān)鍵性作用,以及Mn2+在此過程中還可能通過NK依賴或非依賴的方式激活其他類型的免疫細胞。

Fig. 1. NK細胞調(diào)控Mn2+的抗腫瘤效應(yīng)

2. Mn2+直接調(diào)控NK細胞的細胞毒性

考慮到NK細胞在清除腫瘤細胞過程中發(fā)揮的重要作用,作者選擇小鼠胰腺和人類PBMC中分離純化出來的NK細胞,用于探究Mn2+對NK細胞的細胞毒性的調(diào)控。結(jié)果表明,Mn2+處理不會對NK細胞的生長和凋亡產(chǎn)生顯著性的影響,但能使得NK細胞激活marker的表達水平上調(diào)(Fig. 2A-F)。

隨后,作者選取NK-92MI細胞系和人類原代NK細胞,與靶細胞K562分別以不同的細胞比例(E:T)進行共培養(yǎng)48小時,可見兩種NK細胞的Mn2+處理組的細胞毒性均有顯著上調(diào),鼠源NK細胞和靶細胞同理可證,即Mn2+提高NK細胞的腫瘤殺傷性(Fig. 3A-H)。

Fig. 2. Mn2+增強NK細胞的激活水平

Fig. 3. Mn2+直接增強NK細胞對腫瘤的細胞毒性

3. Mn2+通過NK細胞增強CD8+ T細胞的激活

前文提到,Mn2+的抗腫瘤效應(yīng)除了可能依賴于對NK細胞細胞毒性的直接調(diào)控外,還可能通過NK細胞進一步調(diào)控T細胞。為了驗證這種可能性,作者檢測了NK細胞去除的小鼠中CD8+ T細胞的激活水平,發(fā)現(xiàn)Mn2+處理可以讓CD8+ T細胞激活水平顯著上調(diào)但低于對照組(Fig. 1K)。作者分析了CD45+ 腫瘤浸潤細胞的單細胞轉(zhuǎn)錄組測序(scRNA-seq;測序服務(wù)由伯豪生物提供)數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)Mn2+處理組中NK細胞、CD8+ T細胞及其他一些細胞類型在數(shù)目和比例上顯著增加,GO和KEGG富集到了NK細胞中趨化因子和白細胞遷移等與表型和功能相關(guān)通路的顯著激活,隨后用體外實驗驗證了趨化因子濃度在Mn2+處理條件下的變化(Fig. 4A-F)。在Mn2+處理條件下,CD8+ T細胞和NK細胞共培養(yǎng)時,其激活水平和細胞毒性相比于無Mn2+組均有進一步的顯著提升(Fig. 4G-L)。綜上,作者得到結(jié)論:Mn2+處理可以通過NK細胞依賴或非依賴的方式調(diào)控CD8+ T細胞。

Fig. 4. Mn2+通過NK細胞激活CD8+ T細胞

4. Mn2+通過cGAS-STING-UTX途徑激活NK細胞

cGAS-STING途徑在以往的研究中已經(jīng)被報道受到Mn2+調(diào)控[1][2][3],UTX也被報道在NK細胞響應(yīng)中具有重要的作用[4],而本研究中關(guān)于Mn2+調(diào)控NK細胞的結(jié)果也就成為了連接上述兩個結(jié)論的關(guān)鍵。

首先,作者在STING全身性敲除的小鼠(STING-/-)中驗證了NK細胞的增殖和凋亡都不受Mn2+調(diào)控,且完全不會被Mn2+處理激活;其次,作者在野生型小鼠中分別利用cGAS和STING的抑制劑對cGAS-STING信號通路進行抑制,觀察到Mn2+處理不會影響NK細胞的增殖,但NK細胞的激活水平不再受Mn2+處理的顯著上調(diào)(Fig. 5)。

最后,為了驗證UTX在Mn2+依賴的NK細胞激活調(diào)控機制中發(fā)揮的作用,作者在scRNA-seq結(jié)果中通過在轉(zhuǎn)錄水平上計算cGAS和STING的表達水平與UTX表達水平之間的相關(guān)系數(shù),推斷出cGAS-STING通路與UTX具有顯著的相關(guān)性,并使用TCGA數(shù)據(jù)庫中的公共數(shù)據(jù)對這一結(jié)論進行了驗證,隨后進一步通過公共數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn)了UTX轉(zhuǎn)錄水平和NK細胞豐度之間具有顯著的正相關(guān)性(Fig. 6A, B)。

Mn2+處理能在轉(zhuǎn)錄和翻譯水平上調(diào)UTX,但這種調(diào)控在STING敲除的NK細胞中受到明顯的抑制(Fig. 6C, D)。在cGAS或STING抑制劑處理的NK細胞中過表UTX可以顯著回補激活的NK細胞占比,反之亦然(Fig. 6E-H)。

綜上,作者驗證了Mn2+依賴的cGAS-STING-UTX通路調(diào)控NK細胞激活的機制。

Fig. 5. Mn2+通過NK細胞固有的cGAS-STING途徑激活NK細胞

Fig. 6. Mn2+通過STING誘導(dǎo)UTX表達進而激活NK細胞

 

參考文獻:

[1]. Hooy RM, Massaccesi G, Rousseau KE, Chattergoon MA, Sohn J. Allosteric coupling between Mn2+ and dsDNA controls the catalytic efficiency and fidelity of cGAS. Nucleic Acids Res. 2020;48(8):4435-4447.

[2]. Wang C, Guan Y, Lv M, et al. Manganese increases the sensitivity of the cGAS-STING pathway for double-stranded DNA and is required for the host defense against DNA viruses. Immunity. 2018;48(4).

[3]. Zhao Z, Ma Z, Wang B, Guan Y, Su X-D, Jiang Z. Mn2+ directly activates cGAS and structural analysis suggests Mn2+ induces a noncanonical catalytic synthesis of 2’3’-cGAMP. Cell Rep. 2020;32(7):108053.

[4]. Cheng MI, Li JH, Riggan L, et al. The X-linked epigenetic regulator UTX controls NK cell-intrinsic sex differences. Nat Immunol. 2023;24(5):780-791.

 

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