為幫忙大家更快了解最新科研進(jìn)展，掌握科研熱點(diǎn)，擴(kuò)展科研思路，伯豪生物特此推出最新頂刊文獻(xiàn)速遞系列推文。本期是2025年11月最新頂刊發(fā)表的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組相關(guān)文獻(xiàn)集萃！
頂刊文獻(xiàn)一：STTT丨晚期胰腺癌中NK細(xì)胞療法聯(lián)合吉西他濱和S-1的動(dòng)態(tài)轉(zhuǎn)錄免疫景觀
文章標(biāo)題：Dynamic transcriptional immune landscape in response to NK-cell therapy combined with gemcitabine plus S-1 in advanced pancreatic cancer: a phase 1b/2 trial
期刊：Signal Transduct Target Ther（IF：52.7）
文章摘要：該研究為評(píng)估異體NK細(xì)胞療法聯(lián)合吉西他濱和S-1作為晚期胰腺癌一線治療的安全性和有效性，對(duì) 24 名患者施用 1×10、9 至 8×10、9 個(gè) NK 細(xì)胞耐受良好，無移植物抗宿主病或劑量限制性毒性。在 19 例可評(píng)估患者中，客觀反應(yīng)率為 31.6%，疾病控制率為 73.7%。中位無進(jìn)展生存期為 6.6 個(gè)月，總體生存期為 10.8 個(gè)月。對(duì) 19 個(gè)配對(duì)血樣進(jìn)行進(jìn)一步縱向單細(xì)胞 RNA 測(cè)序（scRNA-seq）檢測(cè)顯示，反應(yīng)者中某些 NK 細(xì)胞亞群和T細(xì)胞亞群比例增加，表現(xiàn)為促炎和效應(yīng)分子表達(dá)增加。對(duì)反應(yīng)者的整體T細(xì)胞受體（TCR）Vβ序列測(cè)序顯示了潛在的T細(xì)胞克隆擴(kuò)增，表現(xiàn)為更大且過度擴(kuò)張的克隆型數(shù)量增加?？傊?，該研究通過1b/2期臨床試驗(yàn)表明，聯(lián)合療法耐受性良好，顯示出初步療效，并發(fā)現(xiàn)應(yīng)答者中特定NK細(xì)胞和T細(xì)胞亞群比例增加，為NK細(xì)胞治療的免疫機(jī)制提供了新見解。
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頂刊文獻(xiàn)二：Nature丨小鼠視覺皮層發(fā)育中細(xì)胞類型的持續(xù)多樣化
文章標(biāo)題：Continuous cell-type diversification in mouse visual cortex development
期刊：Nature（IF：48.5）
文章摘要：該研究通過單細(xì)胞RNA測(cè)序和單核多組學(xué)測(cè)序技術(shù)，對(duì)胚胎11.5天至出生后56天的小鼠視覺皮層進(jìn)行了密集采樣，獲得了568,654個(gè)高質(zhì)量單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組和200,061個(gè)高質(zhì)量細(xì)胞核數(shù)據(jù)。借助先進(jìn)的計(jì)算生物學(xué)方法，重構(gòu)了興奮性神經(jīng)元、抑制性神經(jīng)元和非神經(jīng)元細(xì)胞的完整發(fā)育軌跡圖譜，精準(zhǔn)定位了不同細(xì)胞類型出現(xiàn)的關(guān)鍵時(shí)間節(jié)點(diǎn)和分子特征。研究首次系統(tǒng)揭示了從胚胎期到成年期視覺皮層細(xì)胞類型持續(xù)多樣化的動(dòng)態(tài)過程及分子調(diào)控機(jī)制。
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頂刊文獻(xiàn)三：Nature丨首次從臨床樣本分離高效抗癌CD8+T細(xì)胞簇
文章標(biāo)題：Tumour-reactive heterotypic CD8 T cell clusters from clinical samples
期刊：Nature（IF：48.5）
文章摘要：近年來，免疫治療已成為對(duì)抗癌癥的重要手段，但其療效仍因人而異。越來越多的證據(jù)表明，腫瘤微環(huán)境中CD8+ T細(xì)胞與癌細(xì)胞的物理接近程度，直接影響免疫治療的效果。然而，這些細(xì)胞是否以能夠從患者樣本中直接分離的、有功能的簇形式存在，此前一直不清楚。該研究成功從21例人類黑色素瘤轉(zhuǎn)移瘤臨床樣本中，分離出了一種由CD8+ T細(xì)胞與一個(gè)或多個(gè)腫瘤細(xì)胞及/或抗原呈遞細(xì)胞緊密結(jié)合形成的“異型細(xì)胞簇”。單細(xì)胞測(cè)序分析顯示，這些簇中的T細(xì)胞富含腫瘤反應(yīng)性和耗竭相關(guān)基因特征，具有更高的TCR克隆性。體外實(shí)驗(yàn)證明，從這些簇中擴(kuò)增出的T細(xì)胞，對(duì)自體黑色素瘤的殺傷活性平均提高了九倍，并伴有細(xì)胞因子產(chǎn)量的增加。將這類T細(xì)胞過繼移植到小鼠體內(nèi)后，它們能更有效地控制患者來源的腫瘤生長。研究表明，這些通常被流式細(xì)胞術(shù)單細(xì)胞圈門排除在外的異型T細(xì)胞簇，是解碼功能性腫瘤-免疫細(xì)胞互作的寶貴資源，也具有巨大的治療探索潛力。
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頂刊文獻(xiàn)四：Nat Immunol丨單細(xì)胞多組學(xué)揭示花生過敏口服免疫療法誘導(dǎo)T細(xì)胞持續(xù)無應(yīng)答的機(jī)制
文章標(biāo)題：Peanut allergy oral immunotherapy drives single-cell multi-omic changes in peanut-reactive T cells associated with sustained unresponsiveness
期刊：Nat Immunol（IF：27.6）
文章摘要：當(dāng)前，花生口服免疫療法(OIT)是美國食品藥品監(jiān)督管理局批準(zhǔn)的唯一治療方法，但其在停藥后誘導(dǎo)的持續(xù)無應(yīng)答(SU)成功率仍不理想。以 “花生口服免疫療法：安全性、有效性與機(jī)制探索”（POISED）二期隨機(jī)對(duì)照試驗(yàn)為基礎(chǔ)，選取31名參與者（包括23名接受OIT治療的患者、8名安慰劑對(duì)照組患者，以及5名無花生過敏的健康對(duì)照者）的外周血單個(gè)核細(xì)胞，采用 BD Rhapsody 單細(xì)胞平臺(tái)，整合單細(xì)胞RNA測(cè)序、蛋白質(zhì)表達(dá)分析及T細(xì)胞受體（TCR）庫測(cè)序技術(shù)，對(duì)花生反應(yīng)性（pr）CD4+T 細(xì)胞進(jìn)行了全方位解析。這項(xiàng)研究不僅描繪了花生特異性CD4+T細(xì)胞在OIT過程中的動(dòng)態(tài)變化圖譜，更揭示了與SU密切相關(guān)的關(guān)鍵免疫特征，為優(yōu)化過敏原特異性免疫療法策略奠定基礎(chǔ)。
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頂刊文獻(xiàn)五：Immunity丨髓系細(xì)胞介導(dǎo)晚期腎細(xì)胞癌中干擾素驅(qū)動(dòng)的免疫治療抵抗
文章標(biāo)題：Myeloid cells mediate interferon-driven resistance to immunotherapy in advanced renal cell carcinoma
期刊：Immunity（IF：26.3）
文章摘要：為闡明腎細(xì)胞癌(RCC)免疫檢查點(diǎn)阻斷(ICB)耐藥機(jī)制，研究人員通過單細(xì)胞RNA測(cè)序(scRNA-seq)和推斷建模，揭示了髓系細(xì)胞（而非腫瘤細(xì)胞）的IFNγ信號(hào)傳導(dǎo)是導(dǎo)致抗PD-1/抗VEGF聯(lián)合治療原發(fā)性耐藥的關(guān)鍵因素。研究發(fā)現(xiàn)IFNγ極化的巨噬細(xì)胞高表達(dá)抑制性配體，并能在體外抑制T細(xì)胞對(duì)RCC腫瘤細(xì)胞的殺傷，這表明髓系細(xì)胞是RCC中IFN驅(qū)動(dòng)的免疫治療抵抗的介質(zhì)。
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頂刊文獻(xiàn)六：Immunity丨IL-9信號(hào)增強(qiáng)CAR-T細(xì)胞治療實(shí)體瘤效果
文章標(biāo)題：IL-9 signaling redirects CAR T cell fate toward CD8+memory and CD4+ cycling states, enhancing antitumor efficacy
期刊：Immunity（IF：26.3）
文章摘要：嵌合抗原受體（CAR）T細(xì)胞療法，在血液類癌癥中取得了顯著效果，但對(duì)于占據(jù)癌癥大多數(shù)的實(shí)體瘤，由于受到實(shí)體瘤的免疫抑制性微環(huán)境的限制，其治療效果仍差強(qiáng)人意。該研究發(fā)現(xiàn)通過共表達(dá)IL-9受體，賦予CAR T細(xì)胞異位白介素（IL）-9信號(hào)通路，能重塑抗原應(yīng)激下的CAR T細(xì)胞命運(yùn)，以增強(qiáng)抗腫瘤療效。在臨床前實(shí)體腫瘤模型中，IL-9信號(hào)傳遞的 CAR T 細(xì)胞表現(xiàn)出增強(qiáng)的擴(kuò)增、持續(xù)性和腫瘤浸潤性，使得在顯著較低劑量下優(yōu)于傳統(tǒng)產(chǎn)品實(shí)現(xiàn)了更優(yōu)異的腫瘤控制。單細(xì)胞RNA測(cè)序數(shù)據(jù)的軌跡和RNA速度分析顯示，IL-9信號(hào)在抗原應(yīng)激下改變CAR T細(xì)胞分化，避免功能障礙，促進(jìn)向CD8+ T細(xì)胞記憶和效應(yīng)態(tài)的多能轉(zhuǎn)變，并促進(jìn) CD4+細(xì)胞增殖狀態(tài)。轉(zhuǎn)錄因子通路的探測(cè)表明，IL-9介導(dǎo)的STAT1和STAT4激活可能促成IL-9 信號(hào)傳遞CAR T細(xì)胞的優(yōu)良表型，為靶向?qū)嶓w癌提供了有前景的治療策略。
