CRISPR智庫(kù) | 基于CRISPR/Cas12a高靈敏檢測(cè)HPV-技術(shù)前沿-資訊-生物在線

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CRISPR智庫(kù) | 基于CRISPR/Cas12a高靈敏檢測(cè)HPV

作者:上海伯豪生物技術(shù)有限公司 2023-10-17T00:00 (訪問(wèn)量:30198)

準(zhǔn)確靈敏的核酸檢測(cè)在疾病評(píng)估中具有重要意義,尤其是在臨床早期階段。目前的核酸檢測(cè)法以PCR方法為代表,具有較高的特異性和靈敏度,但同時(shí)也對(duì)專業(yè)設(shè)備和技術(shù)人員的要求較高,通常需要在實(shí)驗(yàn)室內(nèi)進(jìn)行。新冠大流行讓人們意識(shí)到即時(shí)診斷的重要性,這就對(duì)核酸檢測(cè)在速度和簡(jiǎn)便性上提出了更高的要求。

CRISPR/Cas系統(tǒng)原本是細(xì)菌免疫系統(tǒng)的組成部分,因其獨(dú)特的反式切割活性可非特異性切割環(huán)境中的游離核酸,包括熒光報(bào)告分子,因而具備核酸檢測(cè)的能力,并被開(kāi)發(fā)為精準(zhǔn)、快速、低成本和簡(jiǎn)便的分子檢測(cè)工具,被稱為下一代分子診斷技術(shù)。電化學(xué)發(fā)光(electrochemluminescence, ECL)是電化學(xué)和化學(xué)發(fā)光的結(jié)合,具有設(shè)備要求簡(jiǎn)單、 背景干擾低、 靈敏度高、 動(dòng)態(tài)范圍寬等優(yōu)勢(shì),在生物分析和臨床診斷中引起了越來(lái)越多的關(guān)注。近年來(lái),CRISPR核酸檢測(cè)技術(shù)也已從熒光信號(hào)檢測(cè)迅速發(fā)展到與電化學(xué)檢測(cè)聯(lián)用,實(shí)現(xiàn)了靶標(biāo)的精準(zhǔn)識(shí)別和信號(hào)放大。但基于CRISPR的ECL傳感器的應(yīng)用受到了高背景干擾的限制,并且傳統(tǒng)配合物的價(jià)格較昂貴、位阻較大,容易使檢測(cè)的靈敏度降低,因此尋找高效、經(jīng)濟(jì)的ECL材料仍是十分必要的。?

江蘇大學(xué)的Liu Pengfei團(tuán)隊(duì)在Biosensors and Bioelectronics期刊上發(fā)表了題為Cas12a-based electrochemiluminescence biosensor for target amplification-free DNA detection的論文,該研究構(gòu)建了一種新的基于CRISPR/Cas12a的ECL生物傳感器L-甲硫氨酸穩(wěn)定金納米團(tuán)簇(Met-AuNCs)。A金納米團(tuán)簇是一種新興的綠色納米材料,具有優(yōu)異的生物相容性和電化學(xué)特性,而Met-AuNCs作為高效ECL發(fā)射器實(shí)現(xiàn)ECL信號(hào)轉(zhuǎn)換。用于HPV-16 DNA的免擴(kuò)增檢測(cè)。

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01Met-AuNCs CRISPR系統(tǒng)的原理

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Met-AuNCs CRISPR系統(tǒng)的工作原理如圖1所示。?在電極表面修飾Met-AuNCs以獲得原始信號(hào)。二鐵標(biāo)記的硫代單鏈DNA (SH-ssDNA-Fc)作為非特異性ssDNA隨后被固定在Met-AuNCs表面以抑制其釋放。當(dāng)靶HPV-16 DNA存在時(shí),Cas12a被激活并切割ssDNA,通過(guò)記錄不同濃度靶HPV-16 DNA的ECL信號(hào)實(shí)現(xiàn)定量檢測(cè)。

圖1.Met-AuNCs CRISPR系統(tǒng)的工作原理??
?02Met-AuNCs CRISPR系統(tǒng)具有高靈敏度

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為了提高M(jìn)et-AuNCs CRISPR系統(tǒng)的檢測(cè)靈敏度,作者首先對(duì)TEA、SH-ssDNA-Fc、Cas12a/crRNA的濃度以及Cas12a在SH-ssDNA-Fc上的裂解時(shí)間等幾個(gè)重要反應(yīng)條件進(jìn)行了優(yōu)化(圖2)。

圖2.Met-AuNCs CRISPR系統(tǒng)檢測(cè)HPV的反應(yīng)條件優(yōu)化

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在最佳反應(yīng)條件下,作者隨后采用一系列不同濃度的HPV-16 DNA加入Met-AuNCs CRISPR系統(tǒng)中。在室溫下孵育10分鐘以激活Cas12a的反式切割能力,再將經(jīng)過(guò)修飾的電極用上述反應(yīng)液處理,在ECL檢測(cè)。如圖3所示,作者觀察到Met-AuNCs的ECL強(qiáng)度會(huì)隨著HPV-16 DNA濃度的提高而持續(xù)增加,Met-AuNCs CRISPR系統(tǒng)檢測(cè)HPV-16的檢出限(LOD)可達(dá)到0.48 pM的水平(圖3)。這一靈敏度要比目前已發(fā)表的幾種CRISPR電化學(xué)檢測(cè)系統(tǒng)的檢測(cè)水平都要高(表1)。

圖3.ECL強(qiáng)度與HPV-16 DNA濃度呈線性關(guān)系??

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03Met-AuNCs CRISPR檢測(cè)系統(tǒng)的其它優(yōu)勢(shì)

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?除靈敏度高以外,作者在Met-AuNCs CRISPR檢測(cè)系統(tǒng)中采用HPV-18 DNA為干擾劑檢測(cè)HPV-16 DNA(圖4A),測(cè)試結(jié)果表面該系統(tǒng)具有優(yōu)異的特異性,這很大程度要?dú)w功于CRISPR/Cas12a系統(tǒng)自身優(yōu)秀的識(shí)別能力;此外,在相同的實(shí)驗(yàn)條件下,作者還對(duì)不同濃度的靶標(biāo)DNA進(jìn)行5次平行測(cè)試(圖4B),測(cè)試結(jié)果表明Met-AuNCs CRISPR檢測(cè)系統(tǒng)具有較高的重復(fù)性。

4. Met-AuNCs CRISPR檢測(cè)系統(tǒng)的特異性和重復(fù)性

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?結(jié)?

綜上所述,作者提出了一種基于Met-AuNCs ECL材料的CRISPR/Cas12a檢測(cè)系統(tǒng),用于HPV-16 DNA檢測(cè)。?得益于CRISPR/Cas12a系統(tǒng)的反式切割信號(hào)放大以及Met-AuNCs高效的ECL反應(yīng)水平,該系統(tǒng)對(duì)目標(biāo)HPV-16 DNA檢測(cè)具有超高的靈敏度,并優(yōu)于大多數(shù)的免擴(kuò)增CRISPR技術(shù)。上述研究表明Met-AuNCs CRISPR檢測(cè)系統(tǒng)在臨床診斷中具有廣闊的應(yīng)用前景,并為即時(shí)檢測(cè)提供了新方案。

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