解讀 | lncRNA與血管內(nèi)皮細(xì)胞凋亡過程的是是非非-技術(shù)前沿-資訊-生物在線

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解讀 | lncRNA與血管內(nèi)皮細(xì)胞凋亡過程的是是非非

作者:北京博奧晶典生物技術(shù)有限公司 2017-02-19T08:42 (訪問量:9006)

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-博奧晶典科研服務(wù)-ncRNA,lncRNA研究領(lǐng)域新發(fā)現(xiàn)!

研究背景

近年來,越來越多的證據(jù)表明lncRNA(長鏈非編碼RNA)可以通過多個(gè)水平改變基因的表達(dá),進(jìn)而在生物過程中起到關(guān)鍵調(diào)節(jié)子的作用。血管內(nèi)皮細(xì)胞的凋亡與多種心血管疾病相關(guān)聯(lián),如動脈粥樣硬化和血栓形成等。然而在心血管系統(tǒng)中的lncRNA研究才剛剛起步。到目前為止,在血管內(nèi)皮細(xì)胞中還沒有發(fā)現(xiàn)與抗凋亡相關(guān)的lncRNA。

來自山東大學(xué)苗俊英(教授)課題組的路瑋等,利用博奧晶典的lncRNA芯片發(fā)現(xiàn)LOC100129973能夠作為miRNA海綿體,與miRNA-4707-5p和miRNA-4767miRNA結(jié)合,最終降低由于血清和生長因子缺乏所引起的血管內(nèi)皮細(xì)胞的凋亡。該lncRNA作為血管內(nèi)皮細(xì)胞凋亡的抑制劑,為確定內(nèi)皮細(xì)胞凋亡相關(guān)心血管疾病治療的新靶點(diǎn)提供證據(jù)。相關(guān)結(jié)果發(fā)表在2016年的Scientific Reports上IF=5.525)。

本研究中,北京博奧晶典生物技術(shù)有限公司提供了lncRNA芯片檢測服務(wù)和生物信息分析服務(wù)。

技術(shù)路線

結(jié)果展示

1. 三種培養(yǎng)條件下,加入ABO可以抑制饑餓引起的血管內(nèi)皮細(xì)胞的凋亡

作者對血管內(nèi)皮細(xì)胞培養(yǎng)采用三種條件,發(fā)現(xiàn)ABO存在的情況下,可抑制因?yàn)轲囸I導(dǎo)致的細(xì)胞凋亡。

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圖注:Nor:正常培養(yǎng); Ctr:去血清去生長因子誘導(dǎo)內(nèi)皮細(xì)胞凋亡;ABO:去血清去生長因子的條件下加入ABO;

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三種實(shí)驗(yàn)分析血管內(nèi)皮細(xì)胞凋亡:A細(xì)胞形態(tài)觀察;B 丫啶橙染色;C TUNEL染色。

2. ABO處理細(xì)胞時(shí),差異表達(dá)基因篩選及驗(yàn)證

ABO培養(yǎng)條件下,長非編碼RNA LOC100129973顯著上調(diào)。

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圖注:左圖:芯片篩選到的差異lncRNA情況; 右圖:A.LOC100129973在基因組上的情況;B.3種培養(yǎng)條件下LOC100129973的RT-PCR結(jié)果。

3. 確定長非編碼RNA LOC100129973對凋亡的作用

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LncRNA LOC100129973可以抑制血管內(nèi)皮細(xì)胞因血清和FGF-2饑餓誘導(dǎo)的細(xì)胞凋亡。

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圖注:A.LOC100129973過表達(dá)和敲低的RT-PCR驗(yàn)證;B.染色實(shí)驗(yàn);C,D.切割切割PARP的Western Blot實(shí)驗(yàn)。

4. 長非編碼RNA LOC100129973可以作為miRNA海綿體,負(fù)調(diào)控miRNA 4707-5p和miRNA 4767

lncRNA LOC100129973可發(fā)揮miRNA海綿體的作用,對兩個(gè)miRNA進(jìn)行調(diào)控。

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小編說

血管內(nèi)皮細(xì)胞的凋亡與多種心血管疾病相關(guān)聯(lián),如動脈粥樣硬化和血栓形成等。越來越多的證據(jù)表明lncRNA可以通過多個(gè)水平改變基因的表達(dá),進(jìn)而在多個(gè)生物過程中起到關(guān)鍵調(diào)節(jié)子的作用;但目前在心血管系統(tǒng)中的長非編碼RNA研究才剛剛起步,尚未發(fā)現(xiàn)在血管內(nèi)皮細(xì)胞中抗凋亡的lncRNA。本研究發(fā)現(xiàn)的一個(gè)lncRNA能夠抑制由于去血清去生長因子引起的血管內(nèi)皮細(xì)胞的凋亡。而且該lncRNA能夠作為miRNA海綿體,與miRNA-4707-5p和miRNA-4767這兩個(gè)miRNA結(jié)合,進(jìn)而上調(diào)兩者的靶基,最終降低由于血清和生長因子缺乏所引起的血管內(nèi)皮細(xì)胞的凋亡。

本文的研究證明lncRNA可作為提高內(nèi)皮功能的有效靶標(biāo),也為確定內(nèi)皮凋亡相關(guān)心血管疾病治療的新靶點(diǎn)提供證據(jù)。

Reference

Lu, W., et al. Long Noncoding RNA LOC100129973 Suppresses Apoptosis by Targeting miR-4707-5p and miR-4767 in Vascular Endothelial Cells. Scientific Reports 6(2016).

作者簡介

苗俊英 教授

武漢大學(xué)細(xì)胞生物學(xué)學(xué)士,武漢大學(xué)生物物理學(xué)碩士,名古屋大學(xué)理學(xué)博士。主要從事血管內(nèi)皮細(xì)胞增殖、分化和凋亡分子機(jī)制研究,以及神經(jīng)元存活與凋亡分子機(jī)制研究。現(xiàn)任山東大學(xué)教授,從事發(fā)育生物學(xué)和細(xì)胞生物學(xué)教學(xué)工作。多次承擔(dān)國家重大的科研項(xiàng)目,并已獲得多項(xiàng)發(fā)明**。

博奧晶典人lncRNA檢測產(chǎn)品

晶芯?人類lncRNA V4.0芯片是博奧生物集團(tuán)有限公司與中國科學(xué)院生物物理研究所陳潤生院士課題組共同開發(fā)的人類長鏈非編碼RNA(lncRNA)芯片。晶芯?人類lncRNA V4.0芯片已經(jīng)完成食道癌、肺癌、腎細(xì)胞癌、肝癌、卵巢癌、甲狀腺腫瘤、結(jié)腸癌、舌癌、膠質(zhì)瘤、乳腺癌、宮頸癌等十余種腫瘤的相關(guān)研究,檢測總樣品數(shù)超過4500個(gè),為224家單位提供了科研服務(wù)。科研服務(wù)助21家單位發(fā)表30篇文章,影響因子總計(jì)超過114分。晶芯?人類lncRNA V4.0芯片服務(wù)于2015年獲得了北京市新技術(shù)新產(chǎn)品(服務(wù))證書。

產(chǎn)品詳情

http://www.capitalbiotech.com/ProductServer.html?categoryId=50

科研服務(wù)-芯片服務(wù)-lncRNA+mRNA芯片服務(wù)-晶芯? 人類長鏈非編碼RNA (lncRNA)芯片 V4.0

科研服務(wù)事業(yè)部 顏世磊、吳潔、張西軒 | 文案

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