為幫忙大家更快了解最新科研進(jìn)展，掌握科研熱點(diǎn)，擴(kuò)展科研思路，伯豪生物特此推出最新頂刊文獻(xiàn)速遞系列推文。本期是2024年10月最新頂刊發(fā)表的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組相關(guān)文獻(xiàn)集萃！
頂刊文獻(xiàn)一 01
標(biāo)題：Cancer Cell丨腫瘤內(nèi)B細(xì)胞泛癌單細(xì)胞RNA-seq圖譜
文章標(biāo)題：A pan-cancer single-cell RNA-seq atlas of intratumoral B cells
期刊：Cancer Cell
影響因子：48.8
文章摘要：腫瘤浸潤(rùn)性B細(xì)胞在腫瘤的發(fā)生、發(fā)展和預(yù)后中起著重要作用，但目前缺乏一個(gè)全面的分類系統(tǒng)。該研究構(gòu)建了首個(gè)涵蓋多種癌癥的腫瘤內(nèi)B細(xì)胞和漿細(xì)胞的單細(xì)胞RNA測(cè)序（scRNA-seq）圖譜。研究人員識(shí)別了關(guān)鍵的B細(xì)胞亞群特征，鑒別出十個(gè)不同的B細(xì)胞和漿細(xì)胞亞群，并揭示了它們與免疫檢查點(diǎn)抑制劑治療反應(yīng)的關(guān)聯(lián)。該研究還通過空間分析驗(yàn)證了圖譜衍生的B細(xì)胞基因簽名，并探索了B細(xì)胞與T細(xì)胞之間的獨(dú)特配體-受體相互作用。此外還發(fā)布了一個(gè)公開可用的Shiny工具，使研究人員能夠交互式地探索圖譜數(shù)據(jù)。
頂刊文獻(xiàn)二 02
標(biāo)題：Cancer Cell丨通過CTLA4阻斷能夠克服肺癌腦轉(zhuǎn)移中酪氨酸激酶抑制劑耐藥性
文章標(biāo)題：Overcoming tyrosine kinase inhibitor resistance in lung cancer brain metastasis with CTLA4 blockade
期刊：Cancer Cell
影響因子：48.8
文章概要：肺癌腦轉(zhuǎn)移（LCBM）由于對(duì)酪氨酸激酶抑制劑（TKI）治療產(chǎn)生的耐藥性，成為臨床上的重大挑戰(zhàn)。該研究對(duì)手術(shù)獲得的具有不同遺傳背景和TKI治療史的 LCBM 樣本進(jìn)行了單細(xì)胞 RNA 測(cè)序分析。研究發(fā)現(xiàn)發(fā)現(xiàn)酪氨酸激酶抑制劑（如奧希替尼）會(huì)重塑肺癌腦轉(zhuǎn)移免疫微環(huán)境，在增加T細(xì)胞浸潤(rùn)的同時(shí)造成免疫檢查點(diǎn)CTLA4的高表達(dá)，導(dǎo)致免疫逃逸。該研究進(jìn)一步在肺癌腦轉(zhuǎn)移動(dòng)物模型中證實(shí)了靶向治療和CTLA4單抗聯(lián)合用藥能夠有效激活T細(xì)胞，克服免疫逃逸，為臨床克服肺癌腦轉(zhuǎn)移靶向治療耐藥問題提供了新方案。
頂刊文獻(xiàn)三 03
標(biāo)題：Nat Rev Cancer丨研究早期癌癥生物學(xué)的新興策略
文章標(biāo)題：Emerging strategies to investigate the biology of early cancer
期刊：Nature Reviews Cancer
影響因子：72.5
文章概要：該綜述文章系統(tǒng)總結(jié)了癌癥發(fā)生及早期演進(jìn)的最新研究進(jìn)展和研究新策略，涵蓋了臨床樣本、自發(fā)成瘤小鼠、類器官及干細(xì)胞等腫瘤早期演進(jìn)研究模型，結(jié)合單細(xì)胞、空間組學(xué)和深度學(xué)習(xí)等技術(shù)，精確描繪了腫瘤早期演進(jìn)過程中克隆選擇、關(guān)鍵分子事件及影像特征。深入探討了這些研究策略的優(yōu)勢(shì)和局限，并對(duì)未來發(fā)展作出展望。
頂刊文獻(xiàn)四 04
標(biāo)題：Cell丨單細(xì)胞 RNA 測(cè)序數(shù)據(jù)差異表達(dá)分析的矩量框架方法
文章標(biāo)題：Method of moments framework for differential expression analysis of single-cell RNA sequencing data
期刊：Cell
影響因子：45.5
文章概要：單細(xì)胞RNA測(cè)序（scRNA-seq）數(shù)據(jù)的差異表達(dá)分析對(duì)于表征實(shí)驗(yàn)因素如何影響基因表達(dá)分布至關(guān)重要。目前區(qū)分生物和技術(shù)來源的細(xì)胞間變異性以及評(píng)估細(xì)胞組之間定量比較的統(tǒng)計(jì)顯著性仍然具有挑戰(zhàn)性。該研究推出了Memento，一個(gè)用于從scRNA-seq數(shù)據(jù)中進(jìn)行均值表達(dá)、變異性和基因相關(guān)性的穩(wěn)健且高效的差異分析工具，能夠擴(kuò)展到數(shù)百萬(wàn)個(gè)細(xì)胞和數(shù)千個(gè)樣本。Memento識(shí)別出的均值表達(dá)顯著性和可重復(fù)性差異均超過現(xiàn)有方法，它還識(shí)別了變異性和基因相關(guān)性的差異。
頂刊文獻(xiàn)五 05
標(biāo)題：Nat Immunol丨炎癥性腸病中抗腫瘤壞死因子治療的縱向單細(xì)胞圖譜
文章標(biāo)題：A longitudinal single-cell atlas of anti-tumour necrosis factor treatment in inflammatory bowel disease
期刊：Nature Immunology
影響因子：27.7
文章概要：免疫介導(dǎo)的炎癥性疾病（IMID）的精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)需要細(xì)胞對(duì)治療反應(yīng)的理解。描述了在接受抗腫瘤壞死因子（anti-TNF）治療的克羅恩病（CD）和潰瘍性結(jié)腸炎（UC）患者中建立的治療圖譜。研究人員從216個(gè)腸道活檢樣本（41名受試者）生成了約100萬(wàn)個(gè)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組，細(xì)分成109種細(xì)胞狀態(tài)，揭示了疾病特異性差異。
頂刊文獻(xiàn)六 06
標(biāo)題：Immunity|巨噬細(xì)胞驅(qū)動(dòng)兒童型高級(jí)別膠質(zhì)瘤疾病發(fā)展
文章標(biāo)題：Microglia and monocyte-derived macrophages drive progression of pediatric high-grade gliomas and are transcriptionally shaped by histone mutations
期刊：Immunity
影響因子：25.5
文章概要：該研究探討了巨噬細(xì)胞在兒童型高級(jí)別膠質(zhì)瘤（pHGGs）疾病發(fā)展中的作用。研究發(fā)現(xiàn)，彌漫性中線膠質(zhì)瘤（DMGs）中的腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞（TAM），包括腦內(nèi)小膠質(zhì)細(xì)胞和單核細(xì)胞來源的巨噬細(xì)胞，對(duì)腫瘤生長(zhǎng)有顯著影響。通過單細(xì)胞RNA測(cè)序和免疫組織化學(xué)分析，作者發(fā)現(xiàn)特定腫瘤驅(qū)動(dòng)突變塑造了TAM的免疫浸潤(rùn)和轉(zhuǎn)錄譜。此外，趨化因子Ccl8和Ccl12在髓細(xì)胞中的表達(dá)對(duì)TAM的浸潤(rùn)和腫瘤進(jìn)展有重要影響。研究結(jié)果表明，抑制趨化因子受體CCR1和CCR5可以有效減少TAM浸潤(rùn)，延長(zhǎng)患者生存期。這些發(fā)現(xiàn)為pHGGs的治療提供了新的理論依據(jù)和潛在的治療靶點(diǎn)。
頂刊文獻(xiàn)七
07
標(biāo)題：Cancer Cell丨Midkine是與年齡相關(guān)和增加乳腺腫瘤發(fā)生的驅(qū)動(dòng)因素
文章標(biāo)題：Midkine as a driver of age-related changes and increase in mammary tumorigenesis
期刊：Cancer Cell
影響因子：48.8
文章概要：該研究通過單細(xì)胞多組學(xué)探究了大鼠乳腺中與年齡相關(guān)的變化。研究發(fā)現(xiàn)老年大鼠上皮增生的增加，腔特性的喪失，幼稚B細(xì)胞和T細(xì)胞的減少。此外，還發(fā)現(xiàn)了一種老年大鼠特有的腔祖細(xì)胞群，能夠反映癌前病變，并確定Midkine（Mdk）是一種隨著年齡上調(diào)的基因，是與年齡相關(guān)的腔祖細(xì)胞的調(diào)節(jié)因子。人的血液和乳腺上皮細(xì)胞中的Midkine水平隨著年齡的增長(zhǎng)而增加，而正常乳腺組織中較高的MDK與年輕女性較高的乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)。研究結(jié)果揭示了衰老和腫瘤發(fā)生易感性之間的聯(lián)系，并確定了Midkine是年齡依賴性乳腺腫瘤發(fā)生增加的中介。
