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坊間盛傳的rAAV載體空殼率大比拼

作者:和元生物技術(shù)(上海)股份有限公司 2022-03-15T18:07 (訪問量:4611)

腺相關(guān)病毒(Adeno-associated virus, AAV)是表達(dá)基因序列的理想載體,由于其種類多樣、免疫原性低、擴(kuò)散能力強(qiáng)、宿主范圍廣等優(yōu)勢(shì)在基因功能研究和基因治療遞送載體中占據(jù)主導(dǎo)地位。目前FDA已批準(zhǔn)了兩款基于AAV的基因治療藥物,近年來,隨著對(duì)AAV衣殼開發(fā)和基因組優(yōu)化的研究深入,更加推動(dòng)了AAV在基因研究和基因治療領(lǐng)域的應(yīng)用。

相關(guān)病毒載體

腺相關(guān)病毒(Adeno-associated virus,AAV)是微小病毒科(Parvoviridae)家族的成員之一,是一類無法自主復(fù)制、無被膜、具有二十面體結(jié)構(gòu)的微小病毒,其直徑約20-26nm,含有4.7kb左右的線狀單鏈DNA作為基因組。

重組腺相關(guān)病毒載體(recombinant AAV, rAAV)是在非致病的野生型AAV基礎(chǔ)上改造而成的基因載體,研究中采用的rAAV通常為AAV2型基因組與不同的衣殼蛋白結(jié)合產(chǎn)生的混合體病毒載體。

rAAV載體空殼率

隨著rAAV載體的基礎(chǔ)研究、臨床前研究和臨床研究的不斷深入,在rAAV載體制備過程中,產(chǎn)品質(zhì)量穩(wěn)定性、純度是產(chǎn)品質(zhì)控的重要內(nèi)容。

rAAV衣殼是由60個(gè)衣殼蛋白亞單位構(gòu)成,排列成二十面體結(jié)構(gòu),包含載體DNA基因組。在rAAV載體制備過程中,除了含有全長(zhǎng)DNA基因組的完整rAAV載體外,有一定比例的rAAV顆粒不含任何DNA基因組,被稱為空病毒顆粒。在Rep蛋白的參與下,組裝好的空病毒顆粒向核質(zhì)遷移,而DNA的包裝則發(fā)生在已組裝完畢的空病毒顆粒遷移至核質(zhì)后,這促進(jìn)了形成空病毒顆粒的概率。

此外,還存在一定比例的含有部分DNA的病毒顆粒,DNA過度裝載的病毒顆粒,以及rAAV多聚體(圖1)。

圖1 rAAV制備過程中產(chǎn)生的病毒顆粒主要類型(圖片來源:參考文獻(xiàn)1)

rAAV載體空殼率高所帶來的影響

現(xiàn)有研究發(fā)現(xiàn),大量空病毒顆粒的存在可能會(huì)影響rAAV載體的有效性和安全性,因?yàn)樗鼈兛赡軙?huì)增加rAAV載體的免疫原性,增加免疫毒性的風(fēng)險(xiǎn),或通過競(jìng)爭(zhēng)細(xì)胞表面受體結(jié)合位點(diǎn)、內(nèi)吞作用及胞內(nèi)過程,影響rAAV轉(zhuǎn)導(dǎo)效率。因此,在rAAV載體制備和純化過程中,優(yōu)化生產(chǎn)工藝、建立有效的純化方法,以降低rAAV空病毒顆粒數(shù),盡可能純化獲得含有全長(zhǎng)DNA基因組的完整rAAV載體,確保rAAV載體安全、穩(wěn)定、有效,是產(chǎn)品質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)的重要一環(huán)。

如何獲得空殼率更低、更可控的載體?

目前對(duì)于去除rAAV載體中的空病毒顆粒主要是在病毒純化過程中實(shí)現(xiàn)的,策略依賴于rAAV載體和空病毒顆粒的物理性質(zhì)差異。

密度梯度離心法(Density gradient ultracentrifugation, DGC):空病毒顆粒(不含DNA基因組)和含有部分DNA的病毒顆粒在較低的密度區(qū)間聚集,因此借助碘克沙醇或氯化銫(CsCl)經(jīng)過多次密度梯度離心后,可以很容易將空病毒顆粒與rAAV載體分離,DGC法目前適用于所有血清型的純化。

離子交換層析法(ion-exchange chromatography, IEC):rAAV載體的等電點(diǎn)會(huì)比空病毒顆粒略低,因此借助IEC法可以將空病毒顆粒去除。IEC法目前在某些血清型載體(如rAAV1、2、6)中去除空殼效果不錯(cuò),然而對(duì)于不同血清型的rAAV載體可能需要建立不同的純化方法。

低空殼率rAAV大起底

空殼的腺相關(guān)病毒會(huì)為科學(xué)研究和基因治療藥物開發(fā)帶來不可控因素和風(fēng)險(xiǎn),因此人們?cè)诓粩嗵剿骺刂瓶諝AAV載體產(chǎn)生的辦法。空殼rAAV的形成與病毒生產(chǎn)時(shí)的質(zhì)粒配比、細(xì)胞培養(yǎng)水平、rAAV出毒時(shí)間均有一定關(guān)系,而下游腺相關(guān)病毒純化過程更是減少空殼rAAV的重要核心環(huán)節(jié)。

基于12年、30000+的病毒載體生產(chǎn)經(jīng)驗(yàn),和元生物持續(xù)優(yōu)化病毒生產(chǎn)全流程,用更優(yōu)化的質(zhì)粒配比、病毒收獲時(shí)間,借助超離、超濾、層析、PEG沉淀等科研及工業(yè)生產(chǎn)中的整合純化工藝,持續(xù)降低rAAV載體包裝中的空殼率,可做到<5%空殼率(實(shí)際工作中通常<2%),為研究者提供更好的基因載體。

2021年,我們選擇同一載體、不同生產(chǎn)廠商的腺相關(guān)病毒,發(fā)起了空殼率雙盲測(cè)試,電鏡結(jié)果顯示,和元生物的腺相關(guān)病毒空殼率遠(yuǎn)低于行業(yè)一線品牌。

樹立行業(yè)標(biāo)桿,讓基因遞送觸手可及!

圖2 rAAV載體生產(chǎn)空殼率大比拼

為了更好地顯示和元生物AAV產(chǎn)品的屬性,我們選取大視野進(jìn)行比較

圖3 和元生物rAAV載體生產(chǎn)空殼率

電鏡結(jié)果:包裝DNA基因組的病毒顆粒為實(shí)心顆粒(紅色箭頭);空病毒顆粒中間存在空洞(黃色箭頭)

別人只追求滴度的時(shí)候,我們還追求更有效;

別人只追求純度的時(shí)候,我們還追求更安全;

別人只追求承諾的時(shí)候,我們還追求更真實(shí);

別人只追求周期的時(shí)候,我們還追求更穩(wěn)定;

在看不見的地方努力,

只為給您提供穩(wěn)定的高品質(zhì)產(chǎn)品!

和元生物,專注于病毒包裝服務(wù),用心做科研,和元生物制備的每一支病毒,在分裝之前,都要經(jīng)過十幾道純化工藝,才能保證病毒純度,和元生物GeneDelivery,讓基因遞送觸手可及!

參考文獻(xiàn)

[1] Maria Schn?dt, et al., Improving the Quality of Adeno-Associated Viral Vector Preparations: The Challenge of Product-Related Impurities. Hum Gene Ther Methods. 2017 Jun;28(3):101-108. doi: 10.1089/hgtb.2016.188.

[2] Andreas L Gimpel, et al., Analytical methods for process and product characterization of recombinant adeno-associated virus-based gene therapies. Mol Ther Methods Clin Dev. 2021 Feb 17;20:740-754.doi: 10.1016/j.omtm.2021.02.010.

[3] 腺相關(guān)病毒 : 從病毒到臨床. 許瑞安 主編

[4] J Fraser Wright., AAV empty capsids: for better or for worse? Mol Ther. 2014 Jan;22(1):1-2. doi: 10.1038/mt.2013.268.

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