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做完了單細胞實驗
還在為數據分析發愁嗎?
還在找別人幫忙作圖嗎?
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博奧晶典專門為各位老師獨家整理并制作了單細胞數據分析可視化軟件——loupe軟件操作的系列教程,我們將loupe中可實現的重要功能進行了全面的梳理講解,將在陸續幾期推文中為大家一一展示。抑制住您激動的心情,請先看以下內容!
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Loupe 軟件簡介
Loupe軟件是10x官網的一款功能強大、可視化軟件,老師們可以通過軟件查看自己的實驗結果,也可通過十分簡單的操作,實現許多重要功能,如:細胞亞群細分、導出基因表達列表、查看多樣本聯合分析(AGGR)結果、免疫組庫多樣本比較等。
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接下來,小編先帶大家認識一下
loupe cell browser軟件的界面~
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在我們給出的結果中沒有整個樣本中各個亞群的基因表達列表,莫方,在這里,您可以自由選擇,導出指定亞群、上調或者下調基因、top50或者top100或者all genes的基因表達列表,再進行后續分析。
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定義細胞亞群是單細胞分析中的一個重要內容。本期,小編為您介紹根據一個或多個marker基因的表達來定義細胞亞群,另外兩種將在下期為您奉上。您可在這三種方式中自由選擇,也可結合手上的資料將三種方式進行組合使用。
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本期內容就到這里咯
下期小編會繼續為您帶來
另外兩種定義細胞亞群的方式
以及AGGR部分的分享
不要失約哦!
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博奧晶典科研服務事業部 李曉敏 張靜茹 | 文案
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文中部分配圖源于網絡 侵刪
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