在擁有質量可靠的機器后，還必需嚴格遵循必要的注意事項，才能更好發揮作用。所謂鐵打的營盤流水的兵，實驗室里學生一批批進來又畢業，特別要嚴格培訓才能減少意外發生。還記得多年前學校里一世行貸款的大離心機壞了請老外來維修，看看離心腔壁上液跡斑斑，殘留在個別轉子孔里面臨時平衡用的草紙或者膠墊，學生們配平時的隨隨便便，老外嘀咕了一句——難以相信中國著名學府的研究生是這樣做實驗的。類似的話在若干年后又聽到了多次，比如上海送來維修的一把自動測序的排針式上樣器——上樣的細金屬針應該浸泡清洗，但是卻被用火燒來消毒——針都堵掉了，或者被人為地扭曲或折斷了，當時也有人問——這就是你們中國最好的學府、最好的實驗室、最好的學生用過的？每一次聽到都一樣的無地自容。其實很多儀器的損壞僅僅是因為我們怕麻煩、馬虎一點或者想省點事——也許當時沒有立即出問題，但損壞卻一點一點的累積下去。每個學生都嚴格一點，不單可以減少無謂的損壞，也可以使實驗順利很多。
1.樣品的裝載和平衡 由于離心時產生很大的離心力。當轉子所帶的樣品不平衡時會產生很大的力矩，輕者引起機器發抖和震動，重者會扭斷轉軸造成事故。因此離心樣品的平衡裝載是特別要注意的問題。離心轉速越高，對平衡的要求也越高，除了小型離心機轉軸較軟有一定調節能力而允許目測平衡外，所有離心機均要求用天平平衡樣品。離心管至少要兩兩對稱平衡，或者三個一批對稱平衡，最好是一樣重。水平轉子不要空轉。在平衡時不僅要保證對稱的兩管樣品等重，還要保證二者密度和體積相當。因為離心時產生的力矩不僅與樣品的重量有關，還和樣品的旋轉半徑有關。例如一管水和半管砂子雖然重量相等，但半管砂子的旋轉半徑要大一些，所以力矩相差很大，轉動起來并不平衡。所以處于對稱位置的兩個離心管必須裝載密度相近的樣品。例如要同時離心兩個樣品，一管是用蒸餾水稀釋的，另一管是用60%的蔗糖配制的。雖然兩管重量相等，但不可配成一對離心，而必須另裝一管水和一管60%的蔗糖作為平衡物分別配重，否則不能正常運轉。
2. 轉子的保管和使用要嚴格按照說明。
3. 離心管的選擇應該參照離心管的說明和材料，防止不適當的使用導致破裂，不但損失樣品還會污染轉子和離心機。在超速離心時為了減小阻力，都是在真空狀態下運行。所以除了不銹鋼和厚壁聚碳酸脂(PC)離心管外，樣品必須裝滿，否則離心管會因真空而變形或破裂。常規的高速或者低速離心則不要裝滿，所有帶蓋的轉子、水平吊籃、試管蓋都要蓋緊，防止樣品外泄而失去平衡。使用角轉子時必需蓋轉頭蓋，否則離心腔內會產生很大的渦流阻力和摩擦升溫，這等于給離心機的電機和制冷機增加了額外負擔，影響離心機的使用壽命。